CD11b

Infotaula de genCD11b
Estructures disponibles
PDBCerca ortòloga: PDBe RCSB
Llista de codis id de PDB

1BHO, 1BHQ, 1IDN, 1IDO, 1JLM, 1M1U, 1MF7, 1N9Z, 1NA5, 2LKE, 2LKJ, 3Q3G, 3QA3, 4M76, 4XW2

Identificadors
ÀliesITGAM (HUGO), CD11B, CR3A, MAC-1, MAC1A, MO1A, SLEB6, integrin subunit alpha M
IDs externesOMIM: 120980   MGI: 96607   HomoloGene: 526   GeneCards: ITGAM   OMA: ITGAM - orthologs
Localització del gen (humà)
Cromosoma 16 (humà)
Crom.Cromosoma 16 (humà)[1]
Cromosoma 16 (humà)
Localització genòmica per CD11b
Localització genòmica per CD11b
Banda16p11.2Inici31.259.967 bp[1]
Fi31.332.892 bp[1]
Localització del gen (ratolí)
Cromosoma 7 (ratolí)
Crom.Cromosoma 7 (ratolí)[2]
Cromosoma 7 (ratolí)
Localització genòmica per CD11b
Localització genòmica per CD11b
Banda7|7 F3Inici127.661.812 bp[2]
Fi127.717.663 bp[2]
Patró d'expressió d'ARN
Bgee
HumàRatolí (ortòleg)
Més explicacions
Més explicacions
Més dades d'expressió de referència
BioGPS
Més referències a dades d'expressió
Ontologia genètica
Funció molecular
  • metal ion binding Podeu traduir-lo
  • unió proteica 
  • protein heterodimerization activity Podeu traduir-lo
  • heat shock protein binding Podeu traduir-lo
  • amyloid-beta binding Podeu traduir-lo
  • complement component C3b binding Podeu traduir-lo
  • cargo receptor activity Podeu traduir-lo
Component cel·lular
  • exosoma extracel·lular Podeu corregir-lo
  • membrana plasmàtica 
  • superfície cel·lular Podeu corregir-lo
  • membrana Podeu corregir-lo
  • component integral de la membrana Podeu corregir-lo
  • integrin complex Podeu traduir-lo
  • extracel·lular 
  • specific granule membrane Podeu traduir-lo
  • tertiary granule membrane Podeu traduir-lo
  • external side of plasma membrane Podeu traduir-lo
  • integrin alphaM-beta2 complex Podeu traduir-lo
  • plasma membrane raft Podeu traduir-lo
  • membrane raft Podeu traduir-lo
Procés biològic
  • ectodermal cell differentiation Podeu traduir-lo
  • toll-like receptor 4 signaling pathway Podeu traduir-lo
  • integrin-mediated signaling pathway Podeu traduir-lo
  • leukocyte migration Podeu traduir-lo
  • extracellular matrix organization Podeu traduir-lo
  • adherència cel·lular 
  • neutrophil degranulation Podeu traduir-lo
  • microglial cell activation Podeu traduir-lo
  • procés del sistema immunitari Podeu corregir-lo
  • Endocitosi mediada per receptors Podeu corregir-lo
  • phagocytosis, engulfment Podeu traduir-lo
  • cytokine-mediated signaling pathway Podeu traduir-lo
  • positive regulation of superoxide anion generation Podeu traduir-lo
  • positive regulation of neutrophil degranulation Podeu traduir-lo
  • sistema immunitari innat 
  • negative regulation of dopamine metabolic process Podeu traduir-lo
  • positive regulation of protein targeting to membrane Podeu traduir-lo
  • amyloid-beta clearance Podeu traduir-lo
  • cell-cell adhesion via plasma-membrane adhesion molecules Podeu traduir-lo
  • complement-mediated synapse pruning Podeu traduir-lo
  • vertebrate eye-specific patterning Podeu traduir-lo
  • positive regulation of neuron death Podeu traduir-lo
  • positive regulation of microglial cell activation Podeu traduir-lo
  • positive regulation of microglial cell mediated cytotoxicity Podeu traduir-lo
  • cell surface receptor signaling pathway involved in cell-cell signaling Podeu traduir-lo
  • positive regulation of prostaglandin-E synthase activity Podeu traduir-lo
  • forebrain development Podeu traduir-lo
  • apoptotic signaling pathway Podeu traduir-lo
  • positive regulation of hippocampal neuron apoptotic process Podeu traduir-lo
Fonts:Amigo / QuickGO
Ortòlegs
EspèciesHumàRatolí
Entrez

3684

16409

Ensembl

ENSG00000169896

ENSMUSG00000030786

UniProt

P11215

P05555

RefSeq (ARNm)

NM_000632
NM_001145808

NM_001082960
NM_008401

RefSeq (proteïna)

NP_000623
NP_001139280

n/a

Localització (UCSC)Chr 16: 31.26 – 31.33 MbChr 7: 127.66 – 127.72 Mb
Cerca a PubMed[3][4]
Wikidata
Veure/Editar HumàVeure/Editar Ratolí
Infotaula de compost químicCD11b
Substància químicaproteïna Modifica el valor a Wikidata
Trobat en el tàxon
UniProtP11215 Modifica el valor a Wikidata

CD11b és el nom que rep la subunitat Integrina Alfa M mitjançant el sistema de diferenciació utilitzat com a marcador de cèl·lules associades a certes funcions immunològiques. La Integrina Alfa M es una glicoproteïna present en l'heterodímer Integrina Alfa M Beta 2 (αMβ₂). Aquest heterodímer, també conegut com a antigen del Macròfag-1 i receptor del complement 3, està compost per la subunitat Integrina Alfa M (CD11b) i la subunitat Integrina Beta 2, amb el codi de diferenciació CD18.[5]

La Integrina Alfa M és codificada pel gen ITGAM present en el cromosoma 16, més concretament es troba localitzada a la regió 16p11.2.[6][7] L'antigen CD11b s'expressa en la superfície de diversos leucòcits, es troba en granulòcits, monòcits, i macròfags, així com en la micròglia del teixit nerviós. També es pot trobar en un 8% de les cèl·lules de la melsa i en un 44% de les cèl·lules de la medul·la òssia.[8]

Estructura

Pel que fa a la seva estructura, la Integrina Alfa M està formada per un conjunt de 6 làmines β i un total de 14 hèlixs α.[9] Té un pes molecular de 155 KDa i està constituïda per una seqüència de 1136 aminoàcids. En primer lloc, hi ha una seqüència hidrofòbica de 16 aminoàcids que corresponen a la seqüència senyal. En segon lloc, a l'aminoterminal es presenta una llarga cadena que correspon a la part extracel·lular (posició 17-1104), tot seguit d'un segment transmembrana hidrofòbic (posició 1105-1128) i per últim, una petita cadena a la regió citoplasmàtica al carboxil-terminal (posició 1129-1152).[10]

Per una banda, la part citosòlica de la proteïna conté una serina la qual funciona com una zona amb potencial per fosforilar-se, també és rica en aminoàcids àcids i en prolines. Cal destacar el domini citoplasmàtic el qual presenta receptors del procés d'endocitosi, així com alguns receptors de membrana lisosomal. Aquests receptors estan directament relacionats amb la capacitat fagocítica que tenen moltes de les cèl·lules que presenten aquest antigen.

D'altra banda, a la part extracel·lular la proteïna presenta quatre suposats dominis on es poden enganxar ions, els anomenats metal-binding domains. En segon lloc, la cadena extracel·lular presenta una seqüència d'aminoàcids que fa que la Integrina Alfa M es pugui diferenciar de les altres Integrines Alfa homòlogues a aquesta. Hi ha una excepció, una subunitat que també presenta aquesta seqüència, la Integrina Alfa X. La Integrina Alfa X, també coneguda com a CD11c, és la integrina més semblant a la Integrina Alfa M i es creu que els metal-binidng domains presents en aquesta seqüència idèntica en totes dues proteïnes tenen una funció específica que les dues comparteixen. Aquestes dues integrines comparteixen idènticament un 57% dels aminoàcids. Per últim, en la regió extracel·lular també es troba la seqüència d'aminoàcids que comparteixen totes les cadenes d'integrines alfa.

Funcions

La Integrina Alfa M té un paper molt important en la resposta immunitària innata. És l'encarregada de l'adherència dels leucòcits a l'endoteli per poder passar al teixit on s'està produint la inflamació.[11]

També té un paper important en la fagocitosi, durant el procés d'opsonització el complex receptor-opsina pot segregar proteïnes de complement, les quals són posteriorment reconegudes pels leucòcits amb capacitat fagocítica perquè aquesta es dugui a terme. La Integrina Alfa M és una receptora de complement 3, quan aquesta detecta la proteïna de complement iC3b s'uneix i facilita la fagocitosi del patogen. A més, participa en altres processos com la citotoxicitat mediada per cèl·lules, la quimiotaxi i l'activació de limfocits T.

Pel que fa a la recerca, CD11b s'utilitza com un marcador de macròfags i micròglies principalment en tècniques de immunohistoquímica i immunofluorescència.[12]

Nomenclatura

Imatge de fluorescència confocal d'una mostra de teixit nerviós de ratolí amb glioblastoma induït tractada amb immunofluorescència on s'observa un macròfag activat a causa de la presència del tumor.
CD11b present en la superfície d'un macròfag

Els Grups de diferenciació o Antígens de diferenciació (cluster of differentiation en anglès), normalment abreujat CD, és un protocol utilitzat per a la identificació i recerca de molècules de la superfície cel·lular presents en els leucòcits. La nomenclatura CD ha estat universalment adoptada en la comunitat científica, sent oficialment aprovada per la Internacional Union of Immunological Societies (IUIS) i acceptats per l' Organització Mundial de la Salut (OMS). Aquest fet ha permès a la comunitat científica comunicar resultats en un llenguatge universal.[13][14]

Un grup no descriptiu de número de diferenciació (CD seguit d'un número) s'assigna als diferents antígens que poden ser reconeguts per un grup d'anticossos monoclonals, fet que es dona per la presència de cadenes comunes. Per exemple, totes les molècules que tinguin el grup de diferenciació CD11 tindran en comú alguna cadena proteica en la seva estructura.

Per diferenciar diverses molècules que comparteixen una cadena s'afegeix una lletra minúscula precedida del grup no descriptiu de número de diferenciació, per exemple, CD11b. El que significa que comparteix família genètica amb les molècules CD11 però que té una funció diferent de les altres molècules CD11.

Aplicació com a tractament contra el càncer

La integrina CD11b, no és únicament una simple proteïna, pot intervenir en diversos processos mèdics, com per exemple, tractaments mèdics, diagnòstics, investigacions mèdiques etc. L'activació de la integrina CD11b, és un exemple de com aquesta glicoproteïna ajuda als tractaments mèdics. La seva activació impulsa la immunitat innatacontra el tumor.

La CD11b pertany al grup de les integrines que recluten les cèl·lules mieloides als teixits danyats. En casos d'inflamació aguda, la CD11b intervé en el reclutament de les cèl·lules mieloides cap al teixit inflamat, però això no sempre passa, la seva funció pot canviar. En algunes situacions específiques, controla la polarització de macròfagstumorals, la vasculogènesi i el reclutament de cèl·lules T. Això succeeix essencialment a causa de possibles diferències que poden sorgir de les senyals del microambient i d'alteracions en la biologia dels vasos sanguinis observades en tumors versus teixit inflamat.

Amb una petita però molt important molècula, la LA1 es va aconseguir l'activació farmacèutica de la CD11b.

La lligadura / activació CD11b inhibeix la senyal transcripcional immunosupressora de macròfags derivats del tumor, estimula l'acumulació de CD8 + Cèl·lules T en tumors i suprimeix el creixement tumoral. Tot això en conjunt, contribueix a impedir que la mida del tumor creixi.

Aquest estudi identifiquen la CD11b com a reguladora negativa de la supressió immunitària i com un objectiu per la teràpia immunològica del càncer. Aquesta teràpia està tenint resultats positius en un nombre confortable de tipus de càncer.

En un altre estudi[15] més concret, referent al tractament del càncer de pulmó, es van fer servir ratolins CD11b knock-in (KI) amb la mutació I332G (isoleucina activadora per substitució de glicina el R-332) que va provocar la modulació al·lostèrica positiva de CD11b, és a dir, va incrementar l'activitat del receptor. A més, va reduir la intensitat dels macròfags associats a tumors (TAM) i els va reprogramar per millorar la resposta immunitària adaptativa en lloc de suprimir-la i promoure el creixement tumoral per neovascularització.

Concretament, es va estudiar la reducció tumoral del carcinoma de pulmó de Lewis (LLC) pel GB1275 que és el nou modulador de molècules CD11b. Com a resultat, els ratolins CD11b KI van mostrar una reducció significativa de la mida i de la taxa de creixement del tumor LLC.

Referències

  1. 1,0 1,1 1,2 GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000169896 - Ensembl, May 2017
  2. 2,0 2,1 2,2 GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000030786 – Ensembl, May 2017
  3. «Human PubMed Reference:». National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  4. «Mouse PubMed Reference:». National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  5. «OMIM Entry - * 120980 - INTEGRIN, ALPHA-M; ITGAM» (en anglès americà). [Consulta: 30 octubre 2020].
  6. «ITGAM Gene - GeneCards | ITAM Protein | ITAM Antibody». [Consulta: 30 octubre 2020].
  7. «Gene: ITGAM (ENSG00000169896) - Summary - Homo sapiens - Ensembl genome browser 89». [Consulta: 9 novembre 2020].
  8. «CD11b Expression, Leukocyte Adhesion and the Innate Immune System», 18-05-2011. [Consulta: 30 octubre 2020].
  9. «ITGAM - Integrin alpha-M precursor - Homo sapiens (Human) - ITGAM gene & protein» (en anglès). [Consulta: 30 octubre 2020].
  10. Arnaout, M. A.; Gupta, S. K.; Pierce, M. W.; Tenen, D. G. «Amino acid sequence of the alpha subunit of human leukocyte adhesion receptor Mo1 (complement receptor type 3)». The Journal of Cell Biology, 106, 6, 1988-06, pàg. 2153–2158. DOI: 10.1083/jcb.106.6.2153. ISSN: 0021-9525. PMC: 2115146. PMID: 2454931.
  11. Solovjov, Dmitry A.; Pluskota, Elzbieta; Plow, Edward F. «Distinct Roles for the α and β Subunits in the Functions of Integrin αMβ2» (en anglès). Journal of Biological Chemistry, 280, 2, 14-01-2005, pàg. 1336–1345. DOI: 10.1074/jbc.M406968200. ISSN: 0021-9258. PMID: 15485828.
  12. «CD11b Antibody». [Consulta: 9 novembre 2020].
  13. «CD Protein | Sino Biological». [Consulta: 9 novembre 2020].
  14. «CD Nomenclature | Immunopaedia» (en anglès). [Consulta: 9 novembre 2020].
  15. Geraghty, T., Rajagopalan A., Aslam, R., Pohlam, A., Venkatesh, I., Zloza, A.,…Gupta, V. «Positive Allosteric Modulation of CD11b as a Novel Therapeutic Strategy Against Lung Cancer». Frontiers in Oncology, 10, 748, 21-06-2020, pàg. 1-15. DOI: 10.3389/fonc.2020.00748.