MSH6

Infotaula de gen MSH6
Estructures disponibles
PDBCerca ortòloga: PDBe RCSB
Llista de codis id de PDB

2O8F, 2GFU, 2O8B, 2O8C, 2O8D, 2O8E

Identificadors
ÀliesMSH6 (HUGO), mutS homolog 6, GTBP, GTMBP, HNPCC5, HSAP, p160, MMRCS3, MSH-6
Identif. externsOMIM: 600678   MGI: 1343961   HomoloGene: 149   GeneCards: MSH6   OMA: MSH6 - orthologs
Localització del gen (humà)
Cromosoma 2 (humà)
Crom.Cromosoma 2 (humà)[1]
Cromosoma 2 (humà)
Localització genòmica per MSH6
Localització genòmica per MSH6
Banda2p16.3Inici47.695.530 bp[1]
Fi47.810.063 bp[1]
Localització del gen (ratolí)
Cromosoma 17 (ratolí)
Crom.Cromosoma 17 (ratolí)[2]
Cromosoma 17 (ratolí)
Localització genòmica per MSH6
Localització genòmica per MSH6
Banda17 E4|17 57.87 cMInici88.282.490 bp[2]
Fi88.298.320 bp[2]
Patró d'expressió d'ARN
Bgee
humàratolí (ortòleg)
Més explicacions
Més explicacions
  • zigot

  • epiblast Podeu corregir-lo

  • secondary oocyte Podeu traduir-lo

  • primitive streak Podeu traduir-lo

  • primary oocyte Podeu traduir-lo

  • tail of embryo Podeu traduir-lo

  • genital tubercle Podeu traduir-lo

  • abdominal wall Podeu traduir-lo

  • Gonadal ridge Podeu traduir-lo

  • tim
Més referències a dades d'expressió
BioGPS


Més referències a dades d'expressió
Ontologia genètica
Funció molecular
  • unió de nucleòtids Podeu corregir-lo
  • DNA binding Podeu traduir-lo
  • protein homodimerization activity Podeu traduir-lo
  • mismatched DNA binding Podeu traduir-lo
  • ADP binding Podeu traduir-lo
  • chromatin binding Podeu traduir-lo
  • oxidized purine DNA binding Podeu traduir-lo
  • methylated histone binding Podeu traduir-lo
  • damaged DNA binding Podeu traduir-lo
  • activitat ATPasa Podeu corregir-lo
  • unió proteica 
  • single thymine insertion binding Podeu traduir-lo
  • four-way junction DNA binding Podeu traduir-lo
  • MutLalpha complex binding Podeu traduir-lo
  • double-stranded DNA binding Podeu traduir-lo
  • unió d'ATP Podeu corregir-lo
  • magnesium ion binding Podeu traduir-lo
  • single guanine insertion binding Podeu traduir-lo
  • guanine/thymine mispair binding Podeu traduir-lo
  • ATP-dependent activity, acting on DNA Podeu traduir-lo
  • enzyme binding Podeu traduir-lo
Component cel·lular
  • aparell de Golgi 
  • intracellular membrane-bounded organelle Podeu traduir-lo
  • MutSalpha complex Podeu traduir-lo
  • nucleoplasma 
  • cromosoma 
  • nucli cel·lular 
  • citosol 
  • mismatch repair complex Podeu traduir-lo
Procés biològic
  • determination of adult lifespan Podeu traduir-lo
  • cellular response to DNA damage stimulus Podeu traduir-lo
  • positive regulation of isotype switching Podeu traduir-lo
  • intrinsic apoptotic signaling pathway Podeu traduir-lo
  • maintenance of DNA repeat elements Podeu traduir-lo
  • positive regulation of helicase activity Podeu traduir-lo
  • somatic recombination of immunoglobulin gene segments Podeu traduir-lo
  • negative regulation of DNA recombination Podeu traduir-lo
  • DNA mismatch repair Podeu traduir-lo
  • procés viral Podeu corregir-lo
  • reparació de l'ADN 
  • meiotic mismatch repair Podeu traduir-lo
  • intrinsic apoptotic signaling pathway in response to DNA damage Podeu traduir-lo
  • response to UV Podeu traduir-lo
  • somatic hypermutation of immunoglobulin genes Podeu traduir-lo
  • canvi de classe d'immunoglobulina 
  • pyrimidine dimer repair Podeu traduir-lo
  • mitotic G2 DNA damage checkpoint signaling Podeu traduir-lo
  • negative regulation of DNA endoreduplication Podeu traduir-lo
  • interstrand cross-link repair Podeu traduir-lo
  • replication fork arrest Podeu traduir-lo
Fonts:Amigo / QuickGO
Ortòlegs
EspèciesHumàRatolí
Entrez

2956

17688

Ensembl

ENSG00000116062

ENSMUSG00000005370

UniProt

P52701

P54276

RefSeq (ARNm)

NM_000179
NM_001281492
NM_001281493
NM_001281494

NM_010830

RefSeq (proteïna)

NP_000170
NP_001268421
NP_001268422
NP_001268423

NP_034960

Localització (UCSC)Chr 2: 47.7 – 47.81 MbChr 17: 88.28 – 88.3 Mb
Cerca a PubMed[3][4]
Wikidata
Veure/Editar gen humàVeure/Editar gen del ratolí

El gen MSH6, altrament conegut com a G-T binding protein, G/T mismatch-binding protein o GTBP, codifica per a una proteïna que participa en la reparació dels errors originats en la replicació de l'ADN. Les mutacions en aquest gen poden provocar l'acumulació d'errors sense reparar a l'ADN, el que en alguns casos pot derivar al desenvolupament d'un càncer o cèl·lules anormals. El gen MSH6 forma part del conjunt de gens que codifiquen per a proteïnes de reparació d'errors, concretament, la família MutS.[5]


Funció

MSH6 com a part del dímer MutSα, una proteïna reparadora d'errors d'emparellament

La funció principal de la proteïna codificada per al gen MSH6 es pot apreciar durant la replicació de l'ADN i la recombinació genètica. Aquesta proteïna ajuda a corregir els errors que es produeixen durant la divisió cel·lular i altres processos implicant la correcta replicació i recombinació de l'ADN. Les errades en la inserció, incorporació o correcta degradació de brins complementaris en els processos mitòtics, són coneguts com a errors d'emparellament de bases nitrogenades (mismatch errors) i poden tenir conseqüències sobre l'expressió del genoma si no són corregides. Aquests errors d'emparellament poden ser reconeguts i corregits via un conjunt de procediments de control/correcció coneguts en anglès com "DNA mismatch repair" (MMR). Un exemple d'aquests processos de control són les proteïnes reparadores d'errors d'emparellament, també conegudes com a "mismatch repair proteins". Aquest gran grup presenta en particular tres proteïnes essencials en la coordinació de la maquinària de correcció del "mismatching" de bases: MutS, MutH i MutL.

MutS s'encarrega del reconeixement d'errors en una dinàmica on les tres proteïnes anteriorment mencionades juguen un rol precís:

  • MutS reconeix les bases desemparellades o danyades en el bri d'ADN neosintetizat unint-se al ADN mutat localitzant-lo i assenyalant-lo per a la resta de "mismatch repair proteins".
  • MutH és una endonucleasa que s'uneix al bri reconegut per MutS i s'activa només en presència de MutL.
  • MutL actua com a mediador, formant i, últimament, activant un complex proteic funcional compost de la trinitat MutS, MutH i MutL (MutSHL).

MutSHL s'encarregarà llavors d'obrir la cadena d'ADN per permetre'n la correcció, implicant més enzims nuclears (DNA Polimerasa III, DNA ligasa...).

En eucariotes, l'heterodímer MutS presenta dues formes homòlogues: Msh2/Msh6 (MutSα) i Msh2/Msh3 (MutSβ). La proteïna MSH6 sent una de les subunitats de l'heterodímer MSH2/MSH6, la correcta expressió del gen MSH6 esdevé essencial per al bon funcionament d'aquest procés de correcció del "mismatch" de bases.

Funcions de MSH6

A més a més, a part de la reparació, la proteïna codificada pel gen MSH6 també és capaç de reconèixer aquests errors. Aquest reconeixement es regula mitjançant la transformació d'ADP a ATP. L'ADN té dos parells de bases nitrogenades complementàries: l'adenina (A) s'uneix amb la timina (T) i la citosina (C) amb la guanina (G). A vegades, una base s'aparella amb la base que no li correspon, especialment, quan la timina s'uneix amb la guanina, el que s'anomena desajust G/T. Davant aquest error, la proteïna MSH6 s'uneix a una altra proteïna anomenada MSH2 (expressada a partir del gen MSH2) per formar un complex de dues proteïnes anomenat dímer.[6] Aquest complex identifica les ubicacions de l'ADN on s'ha patit algun error durant la replicació de l'ADN.[7] L'heterodímer MSH2/MSH6, també anomenat MustSα reconeix els desajustaments d'una sola base, com també els desajustos creats per supressions o insercions d'una sola base, i els repara canviant una ADP per una ATP.[8] Quan MutS alfa s'uneix doblega l'hèlix d'ADN i pot arribar a protegir fins a 20 parells de bases nitrogenades reconeixent els mismatchings de les bases individuals i els bucles d'inserció i supressió de dinucleòtids, també coneguts com a IDL. Seguidament, forma un complex actiu amb l'heterodímer alfa de MutL. Aquesta acció provoca un canvi que permet a la hMutS (heterodímer MSH2/MSH6) difondre's per la columna vertebral de l'ADN i reparar la part danyada.[9]

Tot i això, també hem de tenir en compte que MutS alfa també té un paper important en la reparació de la recombinació homòloga de l'ADN. S'uneix a la cromatina en la fase inicial G1 de la replicació permetent així una identificació ràpida del desajustament per iniciar la reacció de reparació.

Estructura de la proteïna codificada

MSH6 presenta 5 dominis peptídics:

  1. Domini d'unió amb el "mismatch" (mismatch binding site): domini que presenta motius d'unió específica amb les bases mal emparellades. Aquests motius s'uneixen a residus mal emparellats capturant-los en el domini central (canals) de l'heterodímer MutSα. Estructura α/β mixta.
  2. Domini connector: domini que participa en la regulació al·lostèrica dels altres dominis funcionals de la proteïna. Estructura α/β mixta.
  3. Domini "lever": participa en l'allargament de l'estructura general de la proteïna, principalment gràcies a una α-hèlix d'aproximadament 60 aminoàcids a més de poder tenir funcions en la transducció de senyals entre els dominis d'unió i el domini ATPasa de la proteïna. És un domini α-helical.
  4. Domini pinça: petit domini majoritàriament compost de làmines β que entra en contacte amb l'ADN de forma inespecífica i tanca per sota l'estructura global un cop dimeritzada MutSα
  5. Domini ABC-ATPasa: Estructura α/β mixta que conforma una zona catalítica que permet el canvi conformacional de MutSHL que provoca la correcció d'errors.

No obstant això, la proteïna MSH6 assoleix una conformació tridimensional funcional sols en presència d'una proteïna MSH2, a la qual s'uneix per formar un heterodímer que presenta varis dominis associats a les funcions de MutSα (reconeixement de bases danyades i "mismatchs", unió al bri d'ADN, funció ATPasica...). L'heterodímer format pren una conformació oval travessada per dos dominis, en forma de canals, retrobant MSH6 i MSH2 a cada costat de l'eix d'aquests canals.

Només MSH6 té la capacitat d'unir-se específicament a les bases mal emparellades i, per tant, roman essencial per a la funció d'unió amb el bri d'ADN mutat/danyat.

Descobriment

Inicialment, aquest gen va ser descobert en un llevat anomenat S. cerevisiae i posteriorment va ser identificat en els humans per Joseph Jiricny i altres col·laboradors. J. Jiricny va analitzar regions de la proteïna MSH6 del llevat i de ratolí, descobrint que encaixaven exactament amb regions de la seqüència d'aminoàcids de la GTBP humana. Posteriorment, es va poder accedir a regions més extenses de la GTBP humana i es va comprovar que la MSH6 del S.cerevisiae i la proteïna humana eren idèntiques en un 26,6% d'aminoàcids. Això va demostrar que el gen humà i el del llevat estan més emparentats del que es pensava.[10]

Localització

Com bé s'ha esmentat anteriorment, MSH6 és un gen, i, per tant, el trobem en l'ADN, més concretament el podem localitzar en el braç curt del cromosoma 2, a la zona 2p16.3.

Tot i que aquest gen només codifiqui per a una sola proteïna, aquesta no pot exercir la seva funció si no està unida a MSH2, mentre que aquest darrer és independent de MSH6, ja que també es pot unir a altres proteïnes com MSH3.

Seqüència d'aminoàcids[11]

MSRQSTLYSFFPKSPALSDANKASARASREGGRAAAAPGASPSPGGDAAWSEAGPGPRPLARSASPPKAKNLNGGLRRSVAPAAPTRFKIKGSPEGRSFLQCKA

Localització cromosòmica del gen MSH6 (humà)
Descripció visual de la funció del dímer de MSH6 i MSH2.

Mutacions

Una mutació al gen MSH6 causa la malaltia anomenada Síndrome de Lynch, una malaltia autosòmica dominant. Aquesta síndrome genera més riscos a l'hora de patir un càncer colorectal o uterí. Concretament, les mutacions d'aquest gen que impliquen una inactivació del complex MutSα, són responsables de la formació de tumors en quasi la meitat de càncers colorectals hereditaris que no es relacionen amb un pòlip [12][13]Tanmateix, aquesta síndrome també pot augmentar el risc de patir altres càncers com el d'ovari, estómac, intestí prim, entre altres. Concretament, el risc de l'aparició de neoplàsies colorectals és d'un 12%, i augmenta a un 16% en carcinoma endometrial.[14]

D'altra banda, també se sospita que té un paper important a la síndrome Muir-Torre, una genodermatosi autosòmica dominant caracteritzada per l'aparició de tumors sebacis, queratoacantomes i neoplàsies malignes viscerals.[15]

Referències

  1. 1,0 1,1 1,2 GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000116062 - Ensembl, May 2017
  2. 2,0 2,1 2,2 GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000005370 – Ensembl, May 2017
  3. «Human PubMed Reference:». National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  4. «Mouse PubMed Reference:». National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  5. Edelmann, Winfried; Yang, Kan; Umar, Asad; Heyer, Joerg; Lau, Kirkland «Mutation in the Mismatch Repair Gene Msh6 Causes Cancer Susceptibility» (en anglès). Cell, 91, 4, 1997-11, pàg. 467–477. DOI: 10.1016/S0092-8674(00)80433-X.
  6. DuPrie, Matthew L.; Palacio, Tatiana; Calil, Felipe A.; Kolodner, Richard D.; Putnam, Christopher D. «Mlh1 interacts with both Msh2 and Msh6 for recruitment during mismatch repair» (en anglès). DNA Repair, 119, 2022-11, pàg. 103405. DOI: 10.1016/j.dnarep.2022.103405.
  7. Edelbrock, Michael A.; Kaliyaperumal, Saravanan; Williams, Kandace J. «Structural, molecular and cellular functions of MSH2 and MSH6 during DNA mismatch repair, damage signaling and other noncanonical activities» (en anglès). Mutation Research/Fundamental and Molecular Mechanisms of Mutagenesis, 743-744, 2013-03, pàg. 53–66. DOI: 10.1016/j.mrfmmm.2012.12.008. PMC: PMC3659183. PMID: 23391514.
  8. Wiesendanger, Margrit; Kneitz, Burkhard; Edelmann, Winfried; Scharff, Matthew D. «Somatic Hypermutation in Muts Homologue (Msh)3-, Msh6-, and Msh3/Msh6-Deficient Mice Reveals a Role for the Msh2–Msh6 Heterodimer in Modulating the Base Substitution Pattern» (en anglès). Journal of Experimental Medicine, 191, 3, 07-02-2000, pàg. 579–584. DOI: 10.1084/jem.191.3.579. ISSN: 0022-1007. PMC: PMC2195810. PMID: 10662804.
  9. Tajima, Akihiro; Hess, Martin T.; Cabrera, Betty L.; Kolodner, Richard D.; Carethers, John M. «The mismatch repair complex hMutSα recognizes 5-fluorouracil-modified DNA: Implications for chemosensitivity and resistance» (en anglès). Gastroenterology, 127, 6, 2004-12, pàg. 1678–1684. DOI: 10.1053/j.gastro.2004.10.001.
  10. Marsischky, G T; Filosi, N; Kane, M F; Kolodner, R «Redundancy of Saccharomyces cerevisiae MSH3 and MSH6 in MSH2-dependent mismatch repair.» (en anglès). Genes & Development, 10, 4, 15-02-1996, pàg. 407–420. DOI: 10.1101/gad.10.4.407. ISSN: 0890-9369.
  11. «UniProt». [Consulta: 15 octubre 2022].
  12. Rey, Jean-Marc; Noruzinia, Mehrdad; Brouillet, Jean-Paul; Sarda, Pierre; Maudelonde, Thierry «Six novel heterozygous MLH1, MSH2, and MSH6 and one homozygous MLH1 germline mutations in hereditary nonpolyposis colorectal cancer» (en anglès). Cancer Genetics and Cytogenetics, 155, 2, 2004-12, pàg. 149–151. DOI: 10.1016/j.cancergencyto.2004.03.012.
  13. Yin, Jing Mutation of hMSH3 and hMSH6 mismatch repair genes in genetically unstable human colorectal and gastric carcinomas, 08-01-1999.
  14. Bonadona, Valérie «Cancer Risks Associated With Germline Mutations in MLH1, MSH2, and MSH6 Genes in Lynch Syndrome» (en anglès). JAMA, 305, 22, 08-06-2011, pàg. 2304. DOI: 10.1001/jama.2011.743. ISSN: 0098-7484.
  15. Mahalingam, Meera «MSH6, Past and Present and Muir–Torre Syndrome—Connecting the Dots» (en anglès). The American Journal of Dermatopathology, 39, 4, 2017-04, pàg. 239–249. DOI: 10.1097/DAD.0000000000000633. ISSN: 0193-1091.
  • Tachiki, Hidehisa; Kato, Ryuichi; Kuramitsu, Seiki «DNA Binding and Protein-Protein Interaction Sites in MutS, a Mismatched DNA Recognition Protein from Thermus thermophilus HB8» (en anglès). Journal of Biological Chemistry, 275, 52, 2000-12, pàg. 40703–40709. DOI: 10.1074/jbc.M007124200.