Nebulette

Infotaula de genNebulette
Estructures disponibles
PDBCerca ortòloga: PDBe RCSB
Llista de codis id de PDB

4F14

Identificadors
ÀliesNEBL (HUGO), nebulette, LASP2, LNEBL
IDs externesOMIM: 605491   MGI: 1921353   HomoloGene: 31379   GeneCards: NEBL   OMA: NEBL - orthologs
Localització del gen (humà)
Cromosoma 10 (humà)
Crom.Cromosoma 10 (humà)[1]
Cromosoma 10 (humà)
Localització genòmica per Nebulette
Localització genòmica per Nebulette
Banda10p12.31Inici20.779.973 bp[1]
Fi21.174.187 bp[1]
Localització del gen (ratolí)
Cromosoma 2 (ratolí)
Crom.Cromosoma 2 (ratolí)[2]
Cromosoma 2 (ratolí)
Localització genòmica per Nebulette
Localització genòmica per Nebulette
Banda2|2 A3Inici17.343.909 bp[2]
Fi17.731.464 bp[2]
Patró d'expressió d'ARN
Bgee
HumàRatolí (ortòleg)
Més explicacions
Més explicacions
  • septe interventricular Podeu corregir-lo

  • aurícula

  • myocardium of ventricle Podeu traduir-lo

  • atrioventricular valve Podeu traduir-lo

  • vestibular sensory epithelium Podeu traduir-lo

  • cos ciliar

  • right lung lobe Podeu traduir-lo

  • left lung lobe Podeu traduir-lo

  • mammillary body Podeu traduir-lo

  • deep cerebellar nuclei Podeu traduir-lo
Més dades d'expressió de referència
BioGPS
n/a
Ontologia genètica
Funció molecular
  • filamin binding Podeu traduir-lo
  • cytoskeletal protein binding Podeu traduir-lo
  • actin filament binding Podeu traduir-lo
  • actin binding Podeu traduir-lo
  • structural constituent of muscle Podeu traduir-lo
  • tropomyosin binding Podeu traduir-lo
  • unió proteica 
Component cel·lular
  • citoplasma 
  • Z discdkac Podeu traduir-lo
  • exosoma extracel·lular Podeu corregir-lo
  • I band Podeu traduir-lo
  • stress fiber Podeu traduir-lo
Procés biològic
  • cardiac muscle thin filament assembly Podeu traduir-lo
Fonts:Amigo / QuickGO
Ortòlegs
EspèciesHumàRatolí
Entrez

10529

74103

Ensembl

ENSG00000078114

ENSMUSG00000053702

UniProt

O76041
Q5JUU7

Q9DC07
Q0II04

RefSeq (ARNm)

NM_001173484
NM_006393
NM_016365
NM_213569

NM_028757
NM_001362722

RefSeq (proteïna)
NP_001166955
NP_006384
NP_998734
NP_001364251
NP_001364252

NP_001364253
NP_001364254
NP_001364255
NP_001364256
NP_001364257

NP_083033.1
NP_083033
NP_001349651

Localització (UCSC)Chr 10: 20.78 – 21.17 MbChr 2: 17.34 – 17.73 Mb
Cerca a PubMed[3][4]
Wikidata
Veure/Editar HumàVeure/Editar Ratolí

La nebulette és una isoforma cardíaca específica que pertany a la família de proteïnes de les nebulines. Està codificat pel gen NEBL. Aquesta família està formada per 5 membres: nebulette, nebulina, N-RAP, LASP-1 i LASP-2. Nebulette es localitza als discs Z del múscul cardíac i sembla que regula la longitud dels filaments prims d'actina.

Estructura

Nebulette és una proteïna de 116,4 kDa composta per 1014 aminoàcids.[5][6] Com a membre de la família de proteïnes de les nebulines, la nebulette es caracteritza per 35 trams d'aminoàcids de "repeticions de nebulines", que són dominis d'unió a l'actina que contenen un motiu S Dxx Y K conservat.[7] Igual que la nebulina, la nebulette té una regió àcida amb una estructura desconeguda al seu N-terminal i una regió rica en serina adjacent a un domini SH3 al seu C-terminal.[8] Tot i que la nebulette comparteix característiques estructurals amb la nebulina, la nebulina s'expressa preferentment en el múscul esquelètic i té una mida enorme (600-900 kDa), mentre que la nebulette s'expressa en el múscul cardíac a les regions del disc Z i és significativament més petita (aproximadament 1/6 del mida).[9] La nebulette interacciona amb l'actina, la tropomiosina i l'alfa-actinina.[10] Xin i XIRP2.[11]

Funció

Nebulette va ser identificada el 1995 per Moncman i Wang mitjançant cultius primaris de cardiomiòcits embrionaris de pollastre mitjançant immunoprecipitacions amb certs anticossos monoclonals anti-nebulina.[12] L'expressió normal de la nebulette és essencial per al muntatge i la funció contràctil de les miofibril·les.[13] Concretament, sembla que la nebulette regula l'estabilitat i la longitud dels filaments prims d'actina, així com les freqüències de batec dels cardiomiòcits; la reducció de la proteïna nebulette de longitud completa en els cardiomiòcits va donar lloc a una reducció de la longitud del filament prim, a les freqüències de batecs deprimides i a la pèrdua de les proteïnes reguladores del filament prim troponina I i tropomiosina.[14][15]

Importància clínica

Les mutacions en el gen NEBL s'han associat amb la miocardiopatia dilatada.[16] Els estudis en ratolins transgènics han recolzat el seu paper causant en la fibroelastosi endocàrdica i la miocardiopatia dilatada.[17]

Bibliografia

  • «Mass spectrometry characterization of NEBL at COPaKB». Cardiac Organellar Protein Atlas Knowledgebase (COPaKB). Arxivat de l'original el 2016-03-03. [Consulta: 6 novembre 2021].[18]

Referències

  1. 1,0 1,1 1,2 GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000078114 - Ensembl, May 2017
  2. 2,0 2,1 2,2 GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000053702 – Ensembl, May 2017
  3. «Human PubMed Reference:». National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  4. «Mouse PubMed Reference:». National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  5. «Nebulette». Cardiac Organellar Protein Atlas Knowledgebase (COPaKB). Arxivat de l'original el 2016-03-03. [Consulta: 6 novembre 2021].
  6. Zong, N. C.; Li, H; Li, H; Lam, M. P.; Jimenez, R. C. Circulation Research, 113, 9, 2013, pàg. 1043–53. DOI: 10.1161/CIRCRESAHA.113.301151. PMC: 4076475. PMID: 23965338.
  7. FEBS Letters, 282, 2, maig 1991, pàg. 313–6. DOI: 10.1016/0014-5793(91)80503-u. PMID: 2037050 [Consulta: free].
  8. Trends in Cell Biology, 21, 1, Jan 2011, pàg. 29–37. DOI: 10.1016/j.tcb.2010.09.005. PMC: 3014390. PMID: 20951588.
  9. Cell Motility and the Cytoskeleton, 32, 3, 1995, pàg. 205–25. DOI: 10.1002/cm.970320305. PMID: 8581976.
  10. Cell Motility and the Cytoskeleton, 44, 1, 1999, pàg. 1–22. DOI: 10.1002/(SICI)1097-0169(199909)44:1<1::AID-CM1>3.0.CO;2-8. PMID: 10470015.
  11. Eulitz, S; Sauer, F; Pelissier, M. C.; Boisguerin, P; Molt, S Molecular Biology of the Cell, 24, 20, 2013, pàg. 3215–26. DOI: 10.1091/mbc.E13-04-0202. PMC: 3810769. PMID: 23985323.
  12. Cell Motility and the Cytoskeleton, 32, 3, 1995, pàg. 205–25. DOI: 10.1002/cm.970320305. PMID: 8581976.
  13. Experimental Cell Research, 273, 2, Feb 2002, pàg. 204–18. DOI: 10.1006/excr.2001.5423. PMID: 11822876.
  14. Experimental Cell Research, 314, 19, Nov 2008, pàg. 3519–30. DOI: 10.1016/j.yexcr.2008.09.001. PMID: 18823973.
  15. Experimental Cell Research, 273, 2, Feb 2002, pàg. 204–18. DOI: 10.1006/excr.2001.5423. PMID: 11822876.
  16. Human Genetics, 107, 5, Nov 2000, pàg. 440–51. DOI: 10.1007/s004390000389. PMID: 11140941.
  17. Journal of the American College of Cardiology, 56, 18, Oct 2010, pàg. 1493–502. DOI: 10.1016/j.jacc.2010.05.045. PMC: 2957670. PMID: 20951326.
  18. Circulation Research, 113, 9, Oct 2013, pàg. 1043–1053. DOI: 10.1161/CIRCRESAHA.113.301151. PMC: 4076475. PMID: 23965338.

Enllaços externs