Otoferlina

Infotaula de genOtoferlina
Identificadors
ÀliesOTOF (HUGO), AUNB1, DFNB6, DFNB9, FER1L2, NSRD9, otoferlin
IDs externesOMIM: 603681   MGI: 1891247   HomoloGene: 12892   GeneCards: OTOF   OMA: OTOF - orthologs
Localització del gen (humà)
Cromosoma 2 (humà)
Crom.Cromosoma 2 (humà)[1]
Cromosoma 2 (humà)
Localització genòmica per Otoferlina
Localització genòmica per Otoferlina
Banda2p23.3Inici26.457.203 bp[1]
Fi26.558.756 bp[1]
Patró d'expressió d'ARN
Bgee
HumàRatolí (ortòleg)
Més explicacions
Més explicacions
  • vestibular sensory epithelium Podeu traduir-lo

  • utricle

  • olfactory tubercle Podeu traduir-lo

  • lumbar subsegment of spinal cord Podeu traduir-lo

  • vestibular membrane of cochlear duct Podeu traduir-lo

  • queixal

  • superior frontal gyrus Podeu traduir-lo

  • primary visual cortex Podeu traduir-lo

  • Neurona

  • gray matter layer of cerebellum Podeu traduir-lo
Més dades d'expressió de referència
BioGPS
Més referències a dades d'expressió
Ontologia genètica
Funció molecular
  • calcium ion binding Podeu traduir-lo
  • funció molecular Podeu corregir-lo
Component cel·lular
  • component integral de la membrana Podeu corregir-lo
  • citosol 
  • Unió cel·lular 
  • membrana plasmàtica 
  • membrana plasmàtica basolateral Podeu corregir-lo
  • sinapsi 
  • synaptic vesicle membrane Podeu traduir-lo
  • membrana del reticle endoplasmàtic Podeu corregir-lo
  • reticle endoplasmàtic 
  • membrana Podeu corregir-lo
  • cytoplasmic vesicle Podeu traduir-lo
Procés biològic
  • membrane fusion Podeu traduir-lo
  • oïda 
  • synaptic vesicle exocytosis Podeu traduir-lo
Fonts:Amigo / QuickGO
Ortòlegs
EspèciesHumàRatolí
Entrez

9381

83762

Ensembl

ENSG00000115155

ENSMUSG00000062372

UniProt

Q9HC10

Q9ESF1

RefSeq (ARNm)

NM_001287489
NM_004802
NM_194248
NM_194322
NM_194323

NM_001100395
NM_001286421
NM_031875
NM_001313767

RefSeq (proteïna)

NP_001274418
NP_004793
NP_919224
NP_919303
NP_919304

NP_001093865
NP_001273350
NP_001300696
NP_114081

Localització (UCSC)Chr 2: 26.46 – 26.56 Mbn/a
Cerca a PubMed[2][3]
Wikidata
Veure/Editar HumàVeure/Editar Ratolí

L'otoferlina és una proteïna que en humans està codificada pel gen OTOF .[4][5][6] Està implicat en la fusió de la membrana de les vesícules, i les mutacions en el gen OTOF s'associen amb una forma genètica de sordesa .

Funció

Hi ha dues formes de proteïna otoferlina. La forma curta de la proteïna té tres dominis C2 i un domini transmembrana carboxi-terminal únic que es troba també en el factor d'espermatogènesi de Caenorhabditis elegans FER-1 i la disferlina humana. La forma llarga té sis dominis C2.

La disferlina i la mioferlina són proteïnes que es troben en humans que són homòlogues a l'otoferlina. Tant la disferlina com la mioferlina tenen set dominis C2. Un domini C2 és un domini estructural de proteïnes implicat en l'orientació de proteïnes a les membranes cel·lulars .

C2A en la forma més llarga d'otoferlina, amb sis dominis C2, és estructuralment similar a la disferlina C2A. Tanmateix, el bucle 1 al lloc d'unió de calci (Ca 2+ ) de l'otoferlina C2A és significativament més curt que el bucle homòleg als dominis de disferlina i mioferlina C2A. Per tant, és incapaç d'unir-se al calci. L'otoferlina C2A tampoc és capaç d'unir-se als fosfolípids i, per tant, es diferencia estructuralment i funcionalment d'altres dominis C2.[7] No obstant això, l' homologia suggereix que aquesta proteïna pot estar implicada en la fusió de la membrana de la vesícula .

Similar a la disferlina i la mioferlina, l'otoferlina té un domini FerA i s'ha demostrat que el seu domini FerA interacciona amb lípids zwitteriònics de manera dependent del calci i amb lípids carregats negativament de manera independent del calci.[8] La càrrega estimada del domini FerA entre les proteïnes de ferlina varia significativament. A pH 7, la càrrega estimada de la disferlina és de -8,4 mentre que l'otoferlina FerA és de +8,5.[8] S'han trobat diverses variants de transcripció que codifiquen múltiples isoformes per a aquest gen.[6]

Paper en la sordesa

Les mutacions en el gen que codifica l'otoferlina són una causa d'una sordesa recessiva no sindròmica neurosensorial, DFNB9. El diagnòstic s'identifica mitjançant proves genètiques moleculars.

A l'octubre de 2023 s'han anunciat dos petits assaigs clínics per a una teràpia gènica que restaura l'Otoferlin defectuosa mitjançant un virus adenoassociat (AAV). Les dues teràpies gèniques experimentals són AAVAnc80-hOTOF i DB-OTO .[9][10]

Referències

  1. ↑ 1,0 1,1 1,2 GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000115155 - Ensembl, May 2017
  2. ↑ «Human PubMed Reference:». National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  3. ↑ «Mouse PubMed Reference:». National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  4. ↑ Nature Genetics, 21, 4, abril 1999, pàg. 363–9. DOI: 10.1038/7693. PMID: 10192385.
  5. ↑ Human Mutation, 29, 6, juny 2008, pàg. 823–31. DOI: 10.1002/humu.20708. PMID: 18381613 [Consulta: free].
  6. ↑ 6,0 6,1 «Entrez Gene: OTOF otoferlin».
  7. ↑ Journal of Molecular Biology, 406, 3, febrer 2011, pàg. 479–90. DOI: 10.1016/j.jmb.2010.12.031. PMID: 21216247.
  8. ↑ 8,0 8,1 Scientific Reports, 8, 1, juliol 2018, pàg. 10949. Bibcode: 2018NatSR...810949H. DOI: 10.1038/s41598-018-29184-1. PMC: 6053371. PMID: 30026467.
  9. ↑ «Some deaf children in China can hear after gene therapy treatment» (en anglès). MIT Technology Review. [Consulta: 9 novembre 2023].
  10. ↑ «REGENERON SHARES PRELIMINARY RESULTS SHOWING GENE THERAPY IMPROVES AUDITORY RESPONSES IN CHILD WITH PROFOUND GENETIC HEARING LOSS». , 26-10-2023.

Bibliografia

  • «An autosomal recessive nonsyndromic form of sensorineural hearing loss maps to 3p-DFNB6». Genome Research, 5, 3, octubre 1995, pàg. 305–8. DOI: 10.1101/gr.5.3.305. PMID: 8593615.
  • «Physical map of the region surrounding the OTOFERLIN locus on chromosome 2p22-p23». Genomics, 66, 1, maig 2000, pàg. 110–2. DOI: 10.1006/geno.2000.6185. PMID: 10843812.
  • «Deafness heterogeneity in a Druze isolate from the Middle East: novel OTOF and PDS mutations, low prevalence of GJB2 35delG mutation and indication for a new DFNB locus». European Journal of Human Genetics, 8, 6, juny 2000, pàg. 437–42. DOI: 10.1038/sj.ejhg.5200489. PMID: 10878664.
  • «OTOF encodes multiple long and short isoforms: genetic evidence that the long ones underlie recessive deafness DFNB9». American Journal of Human Genetics, 67, 3, setembre 2000, pàg. 591–600. DOI: 10.1086/303049. PMC: 1287519. PMID: 10903124.
  • «Q829X, a novel mutation in the gene encoding otoferlin (OTOF), is frequently found in Spanish patients with prelingual non-syndromic hearing loss». Journal of Medical Genetics, 39, 7, juliol 2002, pàg. 502–6. DOI: 10.1136/jmg.39.7.502. PMC: 1735186. PMID: 12114484.
  • «Substitutions in the conserved C2C domain of otoferlin cause DFNB9, a form of nonsyndromic autosomal recessive deafness». Neurobiology of Disease, 10, 2, juliol 2002, pàg. 157–64. DOI: 10.1006/nbdi.2002.0488. PMID: 12127154.
  • «Uncommon cytidine-homopolymer dimorphism in 5'-UTR of the human otoferlin gene». International Journal of Molecular Medicine, 11, 1, gener 2003, pàg. 63–4. DOI: 10.3892/ijmm.11.1.63. PMID: 12469219.
  • «Non-syndromic recessive auditory neuropathy is the result of mutations in the otoferlin (OTOF) gene». Journal of Medical Genetics, 40, 1, gener 2003, pàg. 45–50. DOI: 10.1136/jmg.40.1.45. PMC: 1735255. PMID: 12525542.
  • «Characterization of the interaction of the stress kinase SPAK with the Na+-K+-2Cl- cotransporter in the nervous system: evidence for a scaffolding role of the kinase». The Journal of Biological Chemistry, 278, 52, desembre 2003, pàg. 52848–56. DOI: 10.1074/jbc.M309436200. PMID: 14563843.
  • «OTOF mutations revealed by genetic analysis of hearing loss families including a potential temperature sensitive auditory neuropathy allele». Journal of Medical Genetics, 43, 7, juliol 2006, pàg. 576–81. DOI: 10.1136/jmg.2005.038612. PMC: 2593030. PMID: 16371502.
  • «Otoferlin, defective in a human deafness form, is essential for exocytosis at the auditory ribbon synapse». Cell, 127, 2, octubre 2006, pàg. 277–89. DOI: 10.1016/j.cell.2006.08.040. PMID: 17055430.

Enllaços externs

  • Entrada GeneReviews/NCBI/NIH/UW sobre sordesa relacionada amb OTOF