TSC1

Infotaula de genTSC1
Estructures disponibles
PDBCerca ortòloga: PDBe RCSB
Llista de codis id de PDB

5EJC, 4Z6Y

Identificadors
ÀliesTSC1 (HUGO), LAM, TSC, tuberous sclerosis 1, TSC complex subunit 1
IDs externesOMIM: 605284   MGI: 1929183   HomoloGene: 314   GeneCards: TSC1   OMA: TSC1 - orthologs
Localització del gen (humà)
Cromosoma 9 (humà)
Crom.Cromosoma 9 (humà)[1]
Cromosoma 9 (humà)
Localització genòmica per TSC1
Localització genòmica per TSC1
Banda9q34.13Inici132.891.348 bp[1]
Fi132.946.874 bp[1]
Localització del gen (ratolí)
Cromosoma 2 (ratolí)
Crom.Cromosoma 2 (ratolí)[2]
Cromosoma 2 (ratolí)
Localització genòmica per TSC1
Localització genòmica per TSC1
Banda2|2 A3Inici28.531.240 bp[2]
Fi28.581.179 bp[2]
Patró d'expressió d'ARN
Bgee
HumàRatolí (ortòleg)
Més explicacions
  • Pars compacta Podeu traduir-lo

  • músculs glutis

  • external globus pallidus Podeu traduir-lo

  • Region I of hippocampus proper Podeu traduir-lo

  • pars reticulata Podeu traduir-lo

  • lateral nuclear group of thalamus Podeu traduir-lo

  • dorsal motor nucleus of vagus nerve Podeu traduir-lo

  • inferior olivary nucleus Podeu traduir-lo

  • superior vestibular nucleus Podeu traduir-lo

  • middle temporal gyrus Podeu traduir-lo
Més explicacions
  • ventromedial nucleus Podeu traduir-lo

  • lateral hypothalamus Podeu traduir-lo

  • lateral septal nucleus Podeu traduir-lo

  • anterior amygdaloid area Podeu traduir-lo

  • supraoptic nucleus Podeu traduir-lo

  • Rostral migratory stream Podeu traduir-lo

  • paraventricular nucleus of hypothalamus Podeu traduir-lo

  • substància negra

  • mammillary body Podeu traduir-lo

  • arcuate nucleus Podeu traduir-lo
Més dades d'expressió de referència
BioGPS
Més referències a dades d'expressió
Ontologia genètica
Funció molecular
  • chaperone binding Podeu traduir-lo
  • unió proteica 
  • protein N-terminus binding Podeu traduir-lo
  • Hsp70 protein binding Podeu traduir-lo
  • ATPase inhibitor activity Podeu traduir-lo
  • Hsp90 protein binding Podeu traduir-lo
  • GTPase activating protein binding Podeu traduir-lo
Component cel·lular
  • citoplasma 
  • cell cortex Podeu traduir-lo
  • growth cone Podeu traduir-lo
  • intracellular membrane-bounded organelle Podeu traduir-lo
  • lamel·lipodi 
  • membrana Podeu corregir-lo
  • Microfilament 
  • TSC1-TSC2 complex Podeu traduir-lo
  • citoesquelet 
  • citosol 
  • nucli cel·lular 
  • perinuclear region of cytoplasm Podeu traduir-lo
  • Lipid droplet 
  • membrana plasmàtica 
  • cell projection Podeu traduir-lo
  • complex macromolecular Podeu corregir-lo
  • chaperone complex Podeu traduir-lo
  • postsynaptic density Podeu traduir-lo
Procés biològic
  • rRNA export from nucleus Podeu traduir-lo
  • regulation of cell cycle Podeu traduir-lo
  • neural tube closure Podeu traduir-lo
  • cerebral cortex development Podeu traduir-lo
  • memory T cell differentiation Podeu traduir-lo
  • regulation of protein kinase activity Podeu traduir-lo
  • positive regulation of focal adhesion assembly Podeu traduir-lo
  • myelination Podeu traduir-lo
  • negative regulation of insulin receptor signaling pathway Podeu traduir-lo
  • synapse organization Podeu traduir-lo
  • regulation of translation Podeu traduir-lo
  • hippocampus development Podeu traduir-lo
  • regulation of phosphoprotein phosphatase activity Podeu traduir-lo
  • cell-matrix adhesion Podeu traduir-lo
  • potassium ion transport Podeu traduir-lo
  • adaptive immune response Podeu traduir-lo
  • protein heterooligomerization Podeu traduir-lo
  • kidney development Podeu traduir-lo
  • desenvolupament neuronal Podeu corregir-lo
  • cell projection organization Podeu traduir-lo
  • activation of GTPase activity Podeu traduir-lo
  • regulation of focal adhesion assembly Podeu traduir-lo
  • glucose import Podeu traduir-lo
  • regulation of cell-matrix adhesion Podeu traduir-lo
  • negative regulation of cell size Podeu traduir-lo
  • response to insulin Podeu traduir-lo
  • cardiac muscle cell differentiation Podeu traduir-lo
  • negative regulation of translation Podeu traduir-lo
  • negative regulation of cell population proliferation Podeu traduir-lo
  • cellular response to oxygen-glucose deprivation Podeu traduir-lo
  • adult locomotory behavior Podeu traduir-lo
  • negative regulation of TOR signaling Podeu traduir-lo
  • regulation of neuron death Podeu traduir-lo
  • negative regulation of macroautophagy Podeu traduir-lo
  • negative regulation of neuron projection development Podeu traduir-lo
  • positive regulation of macroautophagy Podeu traduir-lo
  • negative regulation of GTPase activity Podeu traduir-lo
  • regulation of stress fiber assembly Podeu traduir-lo
  • positive regulation of stress fiber assembly Podeu traduir-lo
  • negative regulation of oxidative stress-induced neuron death Podeu traduir-lo
  • negative regulation of ATP-dependent activity Podeu traduir-lo
  • protein stabilization Podeu traduir-lo
Fonts:Amigo / QuickGO
Ortòlegs
EspèciesHumàRatolí
Entrez

7248

64930

Ensembl

ENSG00000165699

ENSMUSG00000026812

UniProt

Q92574

Q9EP53

RefSeq (ARNm)

NM_000368
NM_001008567
NM_001162426
NM_001162427
NM_001362177

NM_022887
NM_001289575
NM_001289576

RefSeq (proteïna)

NP_000359
NP_001155898
NP_001155899
NP_001349106

NP_001276504
NP_001276505
NP_075025

Localització (UCSC)Chr 9: 132.89 – 132.95 MbChr 2: 28.53 – 28.58 Mb
Cerca a PubMed[3][4]
Wikidata
Veure/Editar HumàVeure/Editar Ratolí

L'esclerosi tuberosa 1 (TSC1), també coneguda com hamartina, és una proteïna que en humans està codificada pel gen TSC1.[5]

Funció

TSC1 funciona com una co-chaperona que inhibeix l'activitat ATPasa de la chaperona Hsp90 (proteïna de xoc tèrmic-90) i desaccelera el seu cicle de chaperona. Tsc1 funciona com a facilitador de Hsp90 en l'acompanyament de clients de cinases i no quinases, inclòs Tsc2, evitant per tant la seva ubiqüitinació i degradació al proteasoma.[6] TSC1, TSC2 i TBC1D7 és un complex multiproteic també conegut com a complex TSC. Aquest complex regula negativament la senyalització de mTORC1 funcionant com una proteïna activadora de GTPase (GAP) per a la petita GTPase Rheb, un activador essencial de mTORC1. El complex TSC ha estat implicat com a supressor de tumors.[7]

Importància clínica

Els defectes d'aquest gen poden causar esclerosi tuberosa, a causa d'un deteriorament funcional del complex TSC.Els defectes en TSC1 també poden ser una causa de displàsia cortical focal. TSC1 pot estar implicat en la protecció de les neurones cerebrals a la regió CA3 de l'hipocamp dels efectes de l'ictus.[8]

Interaccions

S'ha demostrat que TSC1 interactua amb:

Referències

  1. 1,0 1,1 1,2 GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000165699 - Ensembl, May 2017
  2. 2,0 2,1 2,2 GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000026812 – Ensembl, May 2017
  3. «Human PubMed Reference:». National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  4. «Mouse PubMed Reference:». National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  5. «Entrez Gene: TSC1 tuberous sclerosis 1» (en anglès).
  6. The EMBO Journal, 36, 24, December 2017, pàg. 3650–3665. DOI: 10.15252/embj.201796700. PMC: 5730846. PMID: 29127155.
  7. «TSC1 gene: MedlinePlus Genetics» (en anglès). [Consulta: 16 febrer 2024].
  8. Nature Medicine, 19, 3, March 2013, pàg. 351–7. DOI: 10.1038/nm.3097. PMC: 3744134. PMID: 23435171.