7-Aminoactinomycine D

7-Aminoactinomycine D
Image illustrative de l’article 7-Aminoactinomycine D
Structure de la 7-aminoactinomycine D
Identification
Synonymes

7-amino-AMD,
FLU 402,
7-AAD

No CAS 7240-37-1
No ECHA 100.163.188
No RTECS AU1579000
PubChem 65180
ChEBI 52304
SMILES
[H][C@@]12CCCN1C(=O)[C@H](NC(=O)[C@@H](NC(=O)c1cc(N)c(C)c3oc4c(C)c(=O)c(N)c(C(=O)N[C@H]5[C@@H](C)OC(=O)[C@H](C(C)C)N(C)C(=O)CN(C)C(=O)[C@]6([H])CCCN6C(=O)[C@H](NC5=O)C(C)C)c4nc13)[C@@H](C)OC(=O)[C@H](C(C)C)N(C)C(=O)CN(C)C2=O)C(C)C
PubChem, vue 3D
InChI
Std. InChI : vue 3D
InChI=1S/C62H87N13O16/c1-26(2)42-59(85)74-21-17-19-36(74)57(83)70(13)24-38(76)72(15)48(28(5)6)61(87)89-32(11)44(55(81)66-42)68-53(79)34-23-35(63)30(9)51-46(34)65-47-40(41(64)50(78)31(10)52(47)91-51)54(80)69-45-33(12)90-62(88)49(29(7)8)73(16)39(77)25-71(14)58(84)37-20-18-22-75(37)60(86)43(27(3)4)67-56(45)82/h23,26-29,32-33,36-37,42-45,48-49H,17-22,24-25,63-64H2,1-16H3,(H,66,81)(H,67,82)(H,68,79)(H,69,80)/t32-,33-,36+,37+,42-,43-,44+,45+,48+,49+/m1/s1
Std. InChIKey :
YXHLJMWYDTXDHS-IRFLANFNSA-N
Propriétés chimiques
Formule C62H87N13O16  [Isomères]
Masse molaire[1] 1 270,431 7 ± 0,063 1 g/mol
C 58,62 %, H 6,9 %, N 14,33 %, O 20,15 %,
Précautions
SGH[2]
SGH06 : Toxique
Danger
H300, H310, H315, H319, H330, H335, P260, P264, P280, P284, P301+P310 et P302+P350
H300 : Mortel en cas d'ingestion
H310 : Mortel par contact cutané
H315 : Provoque une irritation cutanée
H319 : Provoque une sévère irritation des yeux
H330 : Mortel par inhalation
H335 : Peut irriter les voies respiratoires
P260 : Ne pas respirer les poussières/fumées/gaz/brouillards/vapeurs/aérosols.
P264 : Se laver … soigneusement après manipulation.
P280 : Porter des gants de protection/des vêtements de protection/un équipement de protection des yeux/du visage.
P284 : Porter un équipement de protection respiratoire.
P301+P310 : En cas d'ingestion : appeler immédiatement un CENTRE ANTIPOISON ou un médecin.
P302+P350 : En cas de contact avec la peau : laver avec précaution et abondamment à l’eau et au savon.
Transport[2]
-
   3462   
Numéro ONU :
3462 : TOXINES EXTRAITES D'ORGANISMES VIVANTS, SOLIDES, N.S.A.
Classe :
6.1
Étiquette :
pictogramme ADR 6.1
6.1 : Matières toxiques
Emballage :
Groupe d'emballage II : matières moyennement dangereuses ;

Unités du SI et CNTP, sauf indication contraire.
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La 7-aminoactinomycine D (7-AAD) est un composé chimique fluorescent dérivé de l'actinomycine D, avec laquelle elle partage une forte affinité pour l'ADN. La 7-AAD est utilisée comme marqueur fluorescent pour la microscopie à fluorescence et la cytométrie en flux (CMF). Elle s'intercale dans les ADN bicaténaires avec une forte affinité pour les régions riches en paires de bases GC[3], ce qui en fait un outil intéressant dans les cadres des études de banding sur les chromosomes[4].

Avec un pic d'absorption à 546 nm, la 7-AAD est excitée efficacement par un laser hélium-néon à 543 nm ; elle peut également être excitée, un peu moins efficacement, à l'aide des raies à 488 nm et 514 nm d'un laser à argon. Ses émissions ont un très fort déplacement de Stokes avec un maximum dans le rouge profond, à 647 nm. La 7-AAD est par conséquent compatible avec la plupart des fluorophores bleus et verts — voire rouges — dans des applications multicolores.

La 7-AAD ne franchit pas aisément la membrane plasmique intacte, de sorte que la membrane des cellules à colorer doit être perméabilisée ou rompue. Cette méthode peut être utilisée avec la fixation des échantillons au formaldéhyde.

La 7-AAD permet par conséquent de repérer les cellules ayant une membrane plasmique endommagée, car le matériel génétique des cellules dont la membrane est intacte ne sera pas coloré par la 7-AAD, qui ne pourra pas pénétrer dans la cellule.

Notes et références

  1. Masse molaire calculée d’après « Atomic weights of the elements 2007 », sur www.chem.qmul.ac.uk.
  2. a b et c Fiche Sigma-Aldrich du composé 7-Aminoactinomycin D ~97% (HPLC), powder, consultée le 2 juin 2014.
  3. (en) Xiucai Liu, Huifen Chen et Dinshaw J. Patel, « Solution structure of actinomycin-DNA complexes: Drug intercalation at isolated G-C sites », Journal of Biomolecular NMR, vol. 1, no 4,‎ , p. 323-347 (PMID 1841703, DOI 10.1007/BF02192858, lire en ligne)
  4. (en) Samuel A. Latt, « Fluorescent probes of chromosome structure and replication », Canadian Journal of Genetics and Cytology, vol. 19, no 4,‎ , p. 603-623 (PMID 76502, DOI 10.1139/g77-065, lire en ligne)
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