Dicer

DICER1
Structures disponibles PDB Recherche d'orthologue: PDBe RCSB Identifiants PDB 2EB1, 4NGB, 4NGC, 4NGD, 4NGF, 4NGG, 4NH3, 4NH5, 4NH6, 4NHA, 4WYQ
Identifiants
Aliases	DICER1
IDs externes	OMIM: 606241 MGI: 2177178 HomoloGene: 13251 GeneCards: DICER1
Position du gène (Homme) Chr. Chromosome 14 humain[1] Locus 14q32.13 Début 95,086,228 bp[1] Fin 95,158,010 bp[1]
Position du gène (Souris) Chr. Chromosome 12 (souris)[2] Locus 12 E|12 54.83 cM Début 104,654,001 bp[2] Fin 104,718,211 bp[2]
Expression génétique Bgee Humain Souris (orthologue) Fortement exprimé dans tail of epididymis caput epididymis nerf optique os spongieux corpus epididymis mucosa of paranasal sinus pleura viscéral cavité buccale parietal pleura ganglion inférieur du nerf vague Fortement exprimé dans zygote secondary oocyte primary oocyte tail of embryo tubercule génital mandibular prominence medullary collecting duct corpuscule rénal paroi abdominale ligne primitive Plus de données d'expression de référence BioGPS n/a
Gene Ontology Fonction moléculaire liaison nucléotide helicase activity protein domain specific binding pre-miRNA binding liaison ion métal endoribonuclease activity endoribonuclease activity, producing 5'-phosphomonoesters liaison protéique liaison pARNi liaison ARN activité nucléase liaison ARN double brin endonuclease activity activité hydrolase liaison ATP ribonuclease III activity liaison ADN deoxyribonuclease I activity Composant cellulaire cytoplasme cytosol RNA-induced silencing complex cône de croissance ARC complex RISC-loading complex axone dendrite noyau endoplasmic reticulum-Golgi intermediate compartment exosome Processus biologique neuron projection morphogenesis maturation de l'ARN negative regulation of transcription by RNA polymerase II peripheral nervous system myelin formation pre-miRNA processing positive regulation of myelination nerve development RNA phosphodiester bond hydrolysis, endonucleolytic positive regulation of Schwann cell differentiation negative regulation of Schwann cell proliferation production of miRNAs involved in gene silencing by miRNA miRNA metabolic process production of siRNA involved in RNA interference extinction de gène apoptotic DNA fragmentation negative regulation of tumor necrosis factor production NIK/NF-kappaB signaling negative regulation of gene expression formation d'un tube Sources:Amigo / QuickGO
Orthologues Espèces Homme Souris Entrez 23405 192119 Ensembl ENSG00000100697 ENSMUSG00000041415 UniProt Q9UPY3 Q8R418 RefSeq (mRNA) NM_001195573 NM_001271282 NM_001291628 NM_030621 NM_177438 NM_148948 RefSeq (protéine) NP_001182502 NP_001258211 NP_001278557 NP_085124 NP_803187 NP_683750 Localisation (UCSC) Chr 14: 95.09 – 95.16 Mb Chr 12: 104.65 – 104.72 Mb Publication PubMed [3] [4]
Wikidata
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Dicer est une enzyme impliquée dans le processus d'ARN interférence. Ses quatre domaines protéiques sont encodés par le gène DICER1^[5]. La protéine dicer composée de 1922 acides aminés, aussi connue sous le nom d’endoribonucléase dicer, est une ribonucléase de classe 3 qui clive les fragments doubles brins d’ARN et les pré-microARN afin d’obtenir des petits ARN interférant et des microARN. Ces fragments ont une longueur d’environ 25 paires de bases et la coupure laisse une extrémité cohésive 3’ débordante de deux bases. La protéine dicer sert à faciliter l’activation du complexe RISC qui est essentiel à une activité d’ARN interférente. Le complexe RISC possède le composant argonaute qui est capable de dégrader les ARN messager. Son gène, DICER1, est situé sur le chromosome 14 humain.

Domaines fonctionnels

La protéine dicer humaine aussi connue sous le nom de DICER1 est une ribonucléase de type 3, car elle contient des hélicases et les domaines Piwi, Argonaute et Zwille (PAZ)^[6]. En plus de ces domaines, dicer contient aussi les domaines d’attachement d’ARNdb DUF283 et dsRBD^[7] et le domaine de dimérisation dicer (DDD)^[8].

Rôle de Dicer

La protéine encodée par DICER1 joue un rôle dans l’interférence à l’ARN de deux façons soit avec les miARN et les siARN. La première méthode implique la fragmentation d’ARN en microARN afin d’inhiber l’expression génique séquence spécifique de l'ARN messager. La deuxième méthode utilise dicer pour cliver des ARNdb en siARN afin d’activer le complexe RISC et permettre l’inactivation du gène cible^[9],[10].

Dicer et le Cancer

Certains individus atteints de tumeurs malignes vont présenter des profils d’expression de miARN altérés ce qui suggère que les miARN jouent un rôle dans le développement du cancer et son pronostic. Il a été démontré qu’une faible expression des ARNm de dicer corrèle avec un stade avancé du cancer et un mauvais pronostic chez des individus atteints de cancer des poumons ou des ovaires. Cependant, pour d’autres types de cancer tels que le cancer de la prostate^[11] ou de l’œsophage, une corrélation a été établie entre un niveau d’expression élevé de dicer et un mauvais pronostic. Cette différence selon le type de cancer suggère que les processus de régulation au petit ARN interférant varient selon le type de tumeur^[9]. De plus, certains cancers particuliers sont associés à des mutations de DICER1 (syndrome DICER1).

Syndrome de DICER1

Le syndrome DICER1 (aussi connu sous le nom de syndrome de prédisposition au blastome pleuropulmonaire relié à DICER1) est une condition rare avec une prévalence inconnue qui est causée par multiples mutations du gène DICER1. Ces mutations font en sorte que la protéine dicer produite est trop courte et donc n’est plus en mesure d’assister à la production de micro ARN. Ce manque de micro ARN mène généralement à une mauvaise régulation de certains gènes et donc une expression anormale de ceux-ci menant à la formation de tumeurs.

Ce syndrome est transmis de manière autosomique dominante^[12]. C’est-à-dire qu’une seule copie du gène muté a besoin d’être présent chez un individu afin que celui-ci soit plus à risque de développer des tumeurs.

Le syndrome DICER1 contribue à augmenter le risque de formation de tumeurs cancéreuse et non cancéreuse. Cette mutation cause seulement une augmentation moyenne du risque de développement de tumeur, lorsque comparer à la population générale. En effet, beaucoup d’individus qui sont affectés par ce syndrome ne développeront pas de tumeur au cours de leur vie. Cette condition augmente le risque d’être atteint par des tumeurs pulmonaires, des reins, des ovaires ou de la glande thyroïde. De tous les types possibles, les individus à risques, vont être le plus souvent affecté par des blastomes pleuropulmonaires. Ce type de cancer affecte les jeunes enfants et est caractérisé par la formation de tumeur sur la plèvre qui va former rapidement des métastases au cerveau, au foie ou à l’os^[12]. Le syndrome DICER1 a aussi été lié aux néphrome kystiques (affecte les reins), cellule tumorale de Sertoli-Leydig (affecte les ovaires), goitre multinodulaire (affecte la glande thyroïde), rhabdomyosarcome (affecte les tissus musculaires), hamartome du foie^[13] ainsi qu’au cancer de la thyroïde. La majorité des mutations connues pour le syndrome DICER1 affectent les domaines connus de la protéine (domaine d’hélicase, domaine de dimérisation dicer, domaine PAZ et domaine d’ARNase III). Pour l’instant, quatre-vingt-huit mutations germinales différentes possibles ont été identifiées comme pouvant mener au syndrome DICER1^[8].

Références

Voir aussi

Liens internes

• ARN interférent
• Petit ARN interférent
• MicroARN

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