Pleiotrophine

PTN
Structures disponibles
PDBRecherche d'orthologue: PDBe RCSB
Identifiants PDB

2N6F

Identifiants
AliasesPTN, Pleiotrophine
IDs externesOMIM: 162095 MGI: 97804 HomoloGene: 2117 GeneCards: PTN
Position du gène (Homme)
Chromosome 7 humain
Chr.Chromosome 7 humain[1]
Chromosome 7 humain
Localisation génomique pour PTN
Localisation génomique pour PTN
Locus7q33Début137,227,341 bp[1]
Fin137,343,774 bp[1]
Position du gène (Souris)
Chromosome 6 (souris)
Chr.Chromosome 6 (souris)[2]
Chromosome 6 (souris)
Localisation génomique pour PTN
Localisation génomique pour PTN
Locus6 B1|6 15.48 cMDébut36,691,864 bp[2]
Fin36,787,155 bp[2]
Expression génétique
Bgee
HumainSouris (orthologue)
Fortement exprimé dans
  • ventricular zone

  • éminence ganglionnaire

  • Ganglion de Gasser

  • nerf optique

  • Aire tegmentale ventrale

  • amygdale

  • ligament alvéolo-dentaire

  • corps calleux

  • noyau accumbens

  • pont
Fortement exprimé dans
  • tubercule génital

  • nerf optique

  • efferent ductule

  • vestibular sensory epithelium

  • éminence médiane

  • crête génitale

  • gastrula

  • canal déférent

  • paroi abdominale

  • ventricular zone
Plus de données d'expression de référence
BioGPS




Plus de données d'expression de référence
Gene Ontology
Fonction moléculaire
  • glycosaminoglycan binding
  • protein phosphatase inhibitor activity
  • heparan sulfate binding
  • heparin binding
  • growth factor activity
  • chondroitin sulfate binding
  • protein kinase binding
  • chondroitin sulfate proteoglycan binding
  • vascular endothelial growth factor binding
  • proteoglycan binding
Composant cellulaire
  • cytoplasme
  • membrane
  • Plaque motrice
  • membrane basale
  • surface cellulaire
  • région extracellulaire
  • réticulum endoplasmique
  • perinuclear region of cytoplasm
  • milieu extracellulaire
  • complexe macromoléculaire
  • présynapse
  • postsynapse
Processus biologique
  • positive regulation of hepatocyte proliferation
  • minéralisation osseuse
  • response to estradiol
  • ostéogenèse
  • développement des poumons
  • thalamus development
  • response to kainic acid
  • cycle œstral
  • cellular response to UV
  • negative regulation of glial cell proliferation
  • response to ciliary neurotrophic factor
  • response to progesterone
  • response to nerve growth factor
  • cellular response to organic cyclic compound
  • hindbrain development
  • cellular response to platelet-derived growth factor stimulus
  • cellular response to vitamin D
  • apprentissage
  • response to activity
  • negative regulation of membrane potential
  • cerebellum development
  • neurodéveloppement
  • positive regulation of skeletal muscle acetylcholine-gated channel clustering
  • rod bipolar cell differentiation
  • développement du cœur
  • transmembrane receptor protein tyrosine phosphatase signaling pathway
  • développement cérébral
  • negative regulation of cell migration
  • retina development in camera-type eye
  • negative regulation of neuromuscular junction development
  • spinal cord development
  • regulation of cell shape
  • positive regulation of neuron projection development
  • positive regulation of apoptotic process
  • negative regulation of epithelial cell proliferation
  • negative regulation of angiogenesis
  • retinal rod cell differentiation
  • endothelial cell differentiation
  • liver development
  • negative regulation of mesenchymal cell proliferation
  • cellular response to hypoxia
  • positive regulation of cell division
  • potentialisation à long terme
  • positive regulation of cell-substrate adhesion
  • positive regulation of cell population proliferation
  • regulation of signaling receptor activity
  • negative regulation of phosphoprotein phosphatase activity
Sources:Amigo / QuickGO
Orthologues
EspècesHommeSouris
Entrez

5764

19242

Ensembl

ENSG00000105894

ENSMUSG00000029838

UniProt

P21246

P63089

RefSeq (mRNA)

NM_002825
NM_001321386
NM_001321387

NM_008973

RefSeq (protéine)

NP_001308315
NP_001308316
NP_002816

NP_032999

Localisation (UCSC)Chr 7: 137.23 – 137.34 MbChr 6: 36.69 – 36.79 Mb
Publication PubMed[3][4]
Wikidata
Voir/Editer HumainVoir/Editer Souris

La pleiotrophine est une protéine de type facteur de croissance qui a une forte affinité pour l'héparine. Son gène est le PTN situé sur le chromosome 7 humain.

Ses autres noms sont HBBM (pour « heparin-binding brain mitogen »), HBGF-8 (pour « heparin-binding growth factor 8 ») ou NEGF1 (pour « neurite growth-promoting factor 1 »), HARP (pour « heparin affinity regulatory peptide » ou HB-GAM (pour « heparin binding growth associated molecule »).

Rôles

Elle favorise l'expansion des cellules souches hématopoïétiques[5] et le maintien de ces dernières dans la moelle osseuse[6].

Notes et références

  1. a b et c GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000105894 - Ensembl, May 2017
  2. a b et c GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000029838 - Ensembl, May 2017
  3. « Publications PubMed pour l'Homme », sur National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine
  4. « Publications PubMed pour la Souris », sur National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine
  5. Himburg HA, Muramoto GG, Daher P et al. Pleiotrophin regulates the expansion and regeneration of hematopoietic stem cells, Nat Med, 2010;16:475–482
  6. Himburg HA, Harris JR, Ito T et al. Pleiotrophin regulates the retention and self-renewal of hematopoietic stem cells in the bone marrow vascular niche, Cell Rep, 2012;2:964–975
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