Cresciuto nelle file del RWD Molenbeek, nel 1996 ha debuttato in prima squadra. Nella stagione 1998-1999 ha giocato in prestito al Wallonia Walhain, mentre la stagione successiva ha è stato ceduto con la stessa formula all'Union Saint-Gilloise. Rientrato al RWD Molenbeek nel 2000, è stato confermato nella rosa del club, disputando la stagione 2000-2001 da titolare. Nell'estate 2001 è passato al Roeselare. Ha militato nel club bianconero per sei stagioni. Nel gennaio 2008 è passato al Dender[1]. Il 29 agosto 2008 si è trasferito in prestito all'OH Lovanio[2]. Il 13 luglio 2009 è passato a titolo definitivo all'Ostenda[3], club con cui ha concluso la propria carriera da calciatore nel 2011.
Allenatore
Il 16 febbraio 2011 è stato nominato allenatore dell'Ostenda. Dopo quattro stagioni, nel 2015 è diventato allenatore del Cercle Bruges[4]. Nell'estate 2016 è diventato tecnico dell'Anversa[5]. L'11 ottobre 2016 è stato sollevato dall'incarico[6]. Il 1º novembre 2016 è stato ufficializzato come nuovo tecnico dell'Aris Limassol[7], club cipriota. Il 4 gennaio 2017 ha risolto il proprio contratto[8]. Il 17 marzo 2017 è diventato allenatore del Lierse[9]. Il 6 ottobre ha risolto il proprio contratto[10]. Il successivo 9 ottobre è diventato vice allenatore del Roeselare[11], club allenato da Dennis van Wijk. Il 25 gennaio 2018 ha seguito van Wijk, diventando vice allenatore del Malines[12]. Confermato nel ruolo anche con il nuovo tecnico Wouter Vrancken, ha mantenuto l'incarico fino all'agosto 2019. Il 29 agosto 2019 è diventato allenatore del RWD Molenbeek[13]. Il 21 gennaio 2020 ha lasciato il ruolo per tornare nella posizione di vice allenatore del Malines[14]. Il 2 novembre 2023 ha assunto il ruolo di tecnico ad interim del club giallorosso[15], in sostituzione dell'esonerato Steven Defour. L'11 novembre 2023, dopo la nomina del nuovo tecnico Besnik Hasi[16], è tornato al ruolo di vice allenatore.
^Frederik Vanderbiest (Roeselare) tekent voor Dender, su nieuwsblad.be.
^DPG Media Privacy Gate, su myprivacy.dpgmedia.be. URL consultato il 18 agosto 2024.
^Fred Vanderbiest is na transfer opnieuw dichter bij huis, su nieuwsblad.be.
^(FR) Belga, Frederik Vanderbiest nouvel entraîneur du Cercle de Bruges, su lavenir.net, 15 agosto 2024. URL consultato il 18 agosto 2024.
^(NL) Antwerp stelt Fred Vanderbiest voor als nieuwe coach | sporza, su sporza.be. URL consultato il 18 agosto 2024.
^(FR) Frederik Vanderbiest et son adjoint remerciés à l'Antwerp, su RTBF. URL consultato il 18 agosto 2024.
^(FR) Frederik Vanderbiest nommé entraîneur de l’Aris Limassol (Chypre), su Le Soir, 3 novembre 2016. URL consultato il 18 agosto 2024.
^(FR) Vanderbiest quitte Limassol deux mois après son arrivée, su RTBF. URL consultato il 18 agosto 2024.
^(NL) Vanderbiest moet Lierse volgend seizoen naar 1A loodsen | sporza, su sporza.be. URL consultato il 18 agosto 2024.
^(NL) Lierse en coach Vanderbiest zijn uit elkaar | sporza, su sporza.be. URL consultato il 18 agosto 2024.
^(NL) Vanderbiest wordt als assistent herenigd met Van Wijk bij Roeselare | sporza, su sporza.be. URL consultato il 18 agosto 2024.
^Fred Vanderbiest volgde Dennis van Wijk naar KV Mechelen: “Ik wilde niet overnemen in Roeselare”, su nieuwsblad.be.
^(FR) La rédaction sportive, RWDM: Vanderbiest T1, Stilmant T2, su DHnet, 18 agosto 2024. URL consultato il 18 agosto 2024.
^(FR) Louise Tessier, Football: Fred Vanderbiest quitte le RWDM pour retourner à Malines, su BX1, 21 gennaio 2020. URL consultato il 18 agosto 2024.
^(FR) Deux jours après 'l’humiliation' de Knokke, Malines se sépare de Steven Defour, Fred Vanderbiest assurera l’intérim, su RTBF. URL consultato il 18 agosto 2024.
^(FR) La Rédaction, Besnik Hasi, ex-Anderlecht, va succéder à Steven Defour à la tête de Malines, su DHnet, 18 agosto 2024. URL consultato il 18 agosto 2024.