CD47 |
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사용 가능한 구조 |
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PDB | 동원체 검색: PDBe RCSB |
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PDB ID 코드 목록 |
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2JJS, 2JJT, 2VSC, 4CMM, 4KJY, 5IWL |
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식별자 |
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다른 이름 | CD47, IAP, MER6, OA3, CD47 molecule |
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외부 ID | OMIM: 601028 MGI: 96617 HomoloGene: 1346 GeneCards: CD47 |
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유전자 위치 (쥐) |
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| 염색체 | 16번 염색체 (쥐)[2] |
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| 자리 | 16|16 B5 | 시작 | 49,620,896 bp[2] |
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끝 | 49,735,373 bp[2] |
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RNA 발현 패턴 |
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Bgee | 인간 | 쥐(동원체) |
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최상위 발현 | - gingival epithelium
- 눈꺼풀결막
- germinal epithelium
- 내장가슴막
- 오른자궁관
- pancreatic epithelial cell
- epithelium of nasopharynx
- Brodmann area 23
- 정강뼈
- 이자관세포
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| 최상위 발현 | - fetal liver hematopoietic progenitor cell
- tibiofemoral joint
- 혈액
- medial dorsal nucleus
- 띠이랑
- 외측슬상핵
- 궁둥신경
- cerebellar vermis
- gastrula
- 비장
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| 추가 참조 발현 데이터 |
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BioGPS | |
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유전자 온톨로지 |
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분자 함수 | - thrombospondin receptor activity
- 단백질 결합
- protein binding involved in heterotypic cell-cell adhesion
- cell-cell adhesion mediator activity
| 세포 성분 | - integral component of membrane
- 세포막
- integral component of plasma membrane
- 세포막
- specific granule membrane
- tertiary granule membrane
- 엑소좀
- 세포 표면
| 생물학적 과정 | - integrin-mediated signaling pathway
- positive regulation of phagocytosis
- 세포 접착
- extracellular matrix organization
- positive regulation of inflammatory response
- positive regulation of T cell activation
- response to bacterium
- leukocyte migration
- positive regulation of cell population proliferation
- opsonization
- positive regulation of cell-cell adhesion
- 호중구 탈과립
- cell migration
- regulation of interferon-gamma production
- regulation of interleukin-10 production
- regulation of interleukin-12 production
- regulation of interleukin-6 production
- 종양괴사인자 생산 조절
- heterotypic cell-cell adhesion
- monocyte extravasation
- regulation of nitric oxide biosynthetic process
- positive regulation of stress fiber assembly
- cellular response to interferon-gamma
- cellular response to interleukin-1
- cellular response to interleukin-12
- cell-cell adhesion
- negative regulation of Fc-gamma receptor signaling pathway involved in phagocytosis
| 출처: Amigo / QuickGO |
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동원체 |
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종 | 인간 | 쥐 |
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앙트레 | | |
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앙상블 | | |
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유니프롯 | | |
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RefSeq (mRNA) | |
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NM_001025079 NM_001025080 NM_001777 NM_198793 NM_001382306 |
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NM_010581 NM_001368415 NM_001368416 NM_001368417 NM_001368418 |
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RefSeq(단백질) | |
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NP_001768 NP_942088 NP_001369235 |
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NP_034711 NP_001355344 NP_001355345 NP_001355346 NP_001355347 |
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위치(UCSC) | Chr 3: 108.04 – 108.09 Mb | Chr 16: 49.62 – 49.74 Mb |
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PubMed 검색 | [3] | [4] |
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위키데이터 |
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CD47(Cluster of Differentiation 47) 또는 인테그린 관련 단백질(IAP)는 인간에서 CD47 유전자에 의해 인코딩되는 막횡단 단백질이다. CD47은 면역글로불린 슈퍼패밀리에 속하며 막 인테그린과 파트너 관계를 맺고 리간드인 트롬보스폰딘-1(TSP-1)과 신호 조절 단백질 알파(SIRPα)에도 결합한다. CD-47은 면역체계의 대식세포에 나를 먹지 말라는 신호로 작용하여 일부 암에서 잠재적인 치료 표적이 되었으며, 보다 최근에는 폐섬유증 치료에 사용되었다.
CD47은 세포사멸, 증식, 부착 및 이동을 포함한 다양한 세포 과정에 관여한다. 더욱이 이는 인슐린 분비뿐만 아니라 면역 및 혈관 신생 반응에도 역할을 한다. CD47은 인간 세포에서 편재적으로 발현되며 다양한 종양 세포에서 과발현되는 것으로 밝혀졌다. 말 피부 종양에서의 발현도 보고되었다.
구조
CD47은 세포외 N-말단 IgV 도메인, 5개의 막횡단 도메인 및 짧은 C-말단 세포내 꼬리를 갖는 50 kDa 막 수용체이다. 세포질 꼬리의 길이만 다른 4개의 교대로 접합된 CD47 이소형이 있다.
2형은 모든 순환 세포와 면역 세포에서 발견되는 가장 널리 발현되는 형태이다. 두 번째로 풍부한 이소형은 형태 4이며, 이는 주로 뇌와 말초 신경계에서 발현된다. 각질세포만이 상당한 양의 형태 1을 발현했다. 이 대체 접합의 기능적 중요성에 대해서는 알려진 바가 거의 없다. 그러나 이러한 이소형은 마우스와 사람 사이에서 고도로 보존되어 CD47 기능에서 세포질 도메인의 중요한 역할을 암시한다.
같이 보기
각주
- ↑ 가 나 다 GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000196776 - 앙상블, May 2017
- ↑ 가 나 다 GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000055447 - 앙상블, May 2017
- ↑ “Human PubMed Reference:”. 《National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine》.
- ↑ “Mouse PubMed Reference:”. 《National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine》.
외부 링크
- 의학주제표목 (MeSH)의 CD47+protein,+human
- http://www.pathologyoutlines.com/topic/cdmarkerscd47.html
- 인간 CD47 게놈 위치와 CD47 유전자의 상세한 설명은 UCSC 게놈 브라우저에 있습니다.