Rho-onafhankelijke transcriptie-terminatie

Haarspeldstructuur bij een rho-onafhankelijke transcriptie-terminator

Rho-onafhankelijke transcriptie-terminatie of intrinsieke terminatie is een mechanisme bij prokaryoten, dat ervoor zorgt dat de RNA-transcriptie stopt en de nieuwe RNA-streng van het DNA loslaat.[1] Door dit mechanisme bevat het mRNA een sequentie dat met zichzelf kan paren en zo een haarspeldstructuur van 7 -20 basenparen vormt. Deze structuur is rijk aan cytosine-guanine basenparen. C-G basenparen hebben een duidelijke basestapelinginteractie (speciaal de G-C basenparen) en kunnen door hun drie waterstofbruggen een stabile RNA-duplex vormen,[2] waardoor het stabieler is dan de DNA-RNA-hybride. Het resultaat is dat de DNA-RNA-hybride van 8 basenparen van het transcriptiecomplex overgaat in een 4basenpaar-hybride. Deze 4bp-hybride heeft een zwakke A-U (adenine-uracil)-basenparing, waardoor het volledige RNA-transcript loslaat van het DNA.

  • Databank van intrinsieke terminators

Zie ook

  • Rhofactor
  • Trp-operon
Bronnen, noten en/of referenties
  1. ↑ Farnham, PJ, Platt, T (11 februari 1981). Rho-independent termination: dyad symmetry in DNA causes RNA polymerase to pause during transcription in vitro.. Nucleic Acids Research 9 (3): 563–77. PMID 7012794. PMC 327222. DOI: 10.1093/nar/9.3.563.
  2. ↑ Lewin, Benjamin (2007). Genes IX. Jones and Bartlett Publishers, Sudbury, MA. ISBN 0-7637-4063-2.