ARID1A

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AT rich interactive domain 1A (SWI-like)

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Busca de ortólogos: PDBe, RCSB

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1RYU

Identificadores

Símbolos

ARID1A; B120; BAF250; BAF250a; BM029; C1orf4; ELD; MRD14; OSA1; P270; SMARCF1; hELD; hOSA1

IDs externos

OMIM: 603024 MGI: 1935147 HomoloGene: 21216 GeneCards: ARID1A Gene

Ontologia do gene
Função molecular	•DNA binding •transcription coactivator activity •protein binding •ligand-dependent nuclear receptor binding •nucleosome binding
Componente celular	•nuclear chromatin •nucleus •nucleolus •SWI/SNF complex •npBAF complex •nBAF complex
Processo biológico	•negative regulation of transcription from RNA polymerase II promoter •neural tube closure •cardiac chamber development •optic cup formation involved in camera-type eye development •nucleosome disassembly •chromatin remodeling •transcription, DNA-templated •regulation of transcription from RNA polymerase II promoter •intracellular estrogen receptor signaling pathway •androgen receptor signaling pathway •forebrain development •nucleosome mobilization •glucocorticoid receptor signaling pathway •ATP-dependent chromatin remodeling •positive regulation of transcription, DNA-templated •chromatin-mediated maintenance of transcription •placenta blood vessel development
Sources: Amigo / QuickGO

Padrões de expressão do ARN

Mais dados de expressão

Ortólogos

Espécies

Humano

Rato

Entrez

8289

93760

Ensembl

ENSG00000117713

ENSMUSG00000007880

UniProt

O14497

A2BH40

RefSeq (mRNA)

NM_006015

NM_001080819

RefSeq (proteína)

NP_006006

NP_001074288

Localização (UCSC)

Chr 1:
27.02 – 27.11 Mb

Chr 4:
133.68 – 133.76 Mb

Busca PubMed

[1]

[2]

AT-rich interactive domain-containing protein 1A é uma proteína humana que é codificada pelo gene ARID1A.^[1]^[2]^[3] Este gene codifica uma proteína liga a família SWI/SNF, cujos membros possuem atividade do tipo helicase e ATPase e estão envolvidos na transcrição de determinados genes por meio da alteração da estrutura da cromatina na região que abriga os ditos genes.

Estudos do Centro para Câncer Johns Hopkins Kimmel publicados em setembro de 2010 na revista Science demonstraram que está relacionada com o câncer de ovário. Neste caso, impede a formação de tumores.^[4]

Interações

ARID1A mostrou interação com SMARCB1^[5]^[6] e SMARCA4.^[6]^[7]

Notas e referências

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↑ «Entrez Gene: ARID1A AT rich interactive domain 1A (SWI-like)»
↑ G1. «Estudo nos EUA identifica dois genes ligados ao câncer de ovário». Consultado em 9 de setembro de 2010
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Leitura de apoio

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Maruyama K, Sugano S (1994). «Oligo-capping: a simple method to replace the cap structure of eukaryotic mRNAs with oligoribonucleotides.». Gene. 138 (1-2): 171–4. PMID 8125298. doi:10.1016/0378-1119(94)90802-8
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