GenBank
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GenBank é um banco de dados de anotações de sequências de nucleotídeos publicamente disponíveis e suas traduções de proteínas. Esse banco de dados é produzido e mantido pelo National Center for Biotechnology Information (NCBI).
História
Em 1979, o pesquisador Walter Goad e colaboradores do Laboratório Nacional Los Alamos (LANL) estabeleceram a Base de Dados de Sequências de Los Alamos, que culminou em 1982 na criação do banco de dados públicos GenBank.[1] O projeto foi financiado pelo National Institutes of Health, National Science Foundation, Departamento de Energia e pelo Departamento de Defesa dos Estados Unidos. Contando com a colaboração entre LANL e a firma Bolt, Beranek, and Newman, o GenBank já possuía mais de 2000 sequências armazenadas no final de 1983.
Organismos armazenados no GenBank
Com o advento das novas tecnologias de sequenciamento de DNA, o banco de dados do GenBank passou a armazenar um número cada vez maior de sequências e anotações de genomas de organismos.
Organismo | Pares de base |
Homo sapiens | 16.310.774.187 |
Mus musculus | 9.974.977.889 |
Rattus norvegicus | 6.521.253.272 |
Bos taurus | 5.386.258.455 |
Zea mays | 5.062.731.057 |
Sus scrofa | 4.887.861.860 |
Danio rerio | 3.120.857.462 |
Strongylocentrotus purpuratus | 1.435.236.534 |
Macaca mulatta | 1.256.203.101 |
Oryza sativa Japonica Group | 1.255.686.573 |
Nicotiana tabacum | 1.197.357.811 |
Xenopus (Silurana) tropicalis | 1.249.938.611 |
Drosophila melanogaster | 1.119.965.220 |
Pan troglodytes | 1.008.323.292 |
Arabidopsis thaliana | 1.144.226.616 |
Canis lupus familiaris | 951.238.343 |
Vitis vinifera | 999.010.073 |
Gallus gallus | 899.631.338 |
Glycine max | 906.638.854 |
Triticum aestivum | 898.689.329 |
Referências
- ↑ Hanson, Todd (21 de novembro de 2000). «Walter Goad, GenBank founder, dies». Newsbulletin: obituary. Los Alamos National Laboratory
- ↑ Benson, Dennis A.; Karsch-Mizrachi, Ilene; Lipman, David J.; Ostell, James; Sayers, Eric W. (1 de janeiro de 2011). «GenBank». Nucleic Acids Research (em inglês). 39 (suppl_1): D32–D37. ISSN 0305-1048. PMID 21071399. doi:10.1093/nar/gkq1079
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