Матриксная металлопротеиназа 16

Матриксная металлопротеиназа 16
PDB rendering based on 1rm8.PDB rendering based on 1rm8.
Доступные структуры
PDB Поиск ортологов: PDBe, RCSB
Список идентификаторов PDB

1RM8

Идентификаторы
Символ MMP16 ; C8orf57; MMP-X2; MT-MMP2; MT-MMP3; MT3-MMP
Внешние ID OMIM: 602262 MGI: 1276107 HomoloGene: 55939 ChEMBL: 2200 GeneCards: Ген MMP16
номер EC 3.4.24.-
Функция • metalloendopeptidase activity

• calcium ion binding
• enzyme activator activity

• zinc ion binding
Компонент клетки • proteinaceous extracellular matrix

• Golgi lumen
• plasma membrane
• integral component of plasma membrane

• cell surface
Биологический процесс • proteolysis

• extracellular matrix disassembly
• extracellular matrix organization
• collagen catabolic process

• positive regulation of catalytic activity
Источники: Amigo / QuickGO
Профиль экспрессии РНК
Больше информации
Ортологи
Вид Человек Мышь
Entrez 4325 17389
Ensembl ENSG00000156103 ENSMUSG00000028226
UniProt P51512 Q9WTR0
RefSeq (мРНК) NM_005941 NM_019724
RefSeq (белок) NP_005932 NP_062698
Локус (UCSC) Chr 8:
89.04 – 89.34 Mb		 Chr 4:
17.85 – 18.12 Mb
Поиск в PubMed Искать Искать


Матриксная металлопротеиназа 16 (англ. matrix metallopeptidase 16, MMP16) — мембранная эндопептидаза подсемейства матриксных металлопротеиназ, кодируется геном человека MMP16.

Функция

MMP16 расщепляет различные компоненты внеклеточного матрикса, включая коллаген III типа и фибронектин. Активирует прожелатиназу A. Участвует в перестройке сосудов.

Взаимодействует с CSPG4 через хондроитинсульфат-гликозаминогликановую цепь последнего.

Структура

Синтезированный белок состоит из 607 аминокислот. После отщепления сигнального пептида и пропептида эндопептидазой фурином зрелый белок включает 488 аминокислот. Состоит из N-концевого внеклеточного участка (445 аминокислот), единственного трансмембранного фрагмента и короткого (22 аминокислоты) цитозольного участка. Внеклеточный участок включает 4 гемопексин-подобных доменов, цистеиновый переключатель, 4 участка связывания цинка и каталитический центр, 1 участок N-гликозилирования и 1 участок фосфорилирования (по тирозину-52).[1]

Тканевая специфичность

MMP15 экспрессируется в сердце, мозге, плаценте, яичниках и тонком кишечнике. Короткая изоформа синтезируется в яичниках.

См. также

Примечания

  1. ↑ Uniprot P51512  (неопр.). Дата обращения: 25 октября 2012. Архивировано 1 июня 2017 года.

Библиография

  • Strausberg R.L., Feingold E.A., Grouse L.H., et al. Generation and initial analysis of more than 15,000 full-length human and mouse cDNA sequences (англ.) // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America : journal. — 2003. — Vol. 99, no. 26. — P. 16899—16903. — doi:10.1073/pnas.242603899. — PMID 12477932. — PMC 139241.
  • Jung M., Römer A., Keyszer G., et al. mRNA expression of the five membrane-type matrix metalloproteinases MT1-MT5 in human prostatic cell lines and their down-regulation in human malignant prostatic tissue (англ.) // Prostate : journal. — 2003. — Vol. 55, no. 2. — P. 89—98. — doi:10.1002/pros.10194. — PMID 12661033.
  • Takino T., Koshikawa N., Miyamori H., et al. Cleavage of metastasis suppressor gene product KiSS-1 protein/metastin by matrix metalloproteinases (англ.) // Oncogene : journal. — 2003. — Vol. 22, no. 30. — P. 4617—4626. — doi:10.1038/sj.onc.1206542. — PMID 12879005.
  • Rozanov D.V., Hahn-Dantona E., Strickland D.K., Strongin A.Y. The low density lipoprotein receptor-related protein LRP is regulated by membrane type-1 matrix metalloproteinase (MT1-MMP) proteolysis in malignant cells (англ.) // J. Biol. Chem. : journal. — 2004. — Vol. 279, no. 6. — P. 4260—4268. — doi:10.1074/jbc.M311569200. — PMID 14645246.
  • Lang R., Braun M., Sounni N.E., et al. Crystal structure of the catalytic domain of MMP-16/MT3-MMP: characterization of MT-MMP specific features (англ.) // J. Mol. Biol.[англ.] : journal. — 2004. — Vol. 336, no. 1. — P. 213—225. — doi:10.1016/j.jmb.2003.12.022. — PMID 14741217.
  • Shofuda T., Shofuda K., Ferri N., et al. Cleavage of focal adhesion kinase in vascular smooth muscle cells overexpressing membrane-type matrix metalloproteinases (англ.) // Arterioscler. Thromb. Vasc. Biol.[англ.] : journal. — 2004. — Vol. 24, no. 5. — P. 839—844. — doi:10.1161/01.ATV.0000126680.78500.4c. — PMID 15044209.
  • Wang S.C., Lien H.C., Xia W., et al. Binding at and transactivation of the COX-2 promoter by nuclear tyrosine kinase receptor ErbB-2 (англ.) // Cancer Cell : journal. — 2004. — Vol. 6, no. 3. — P. 251—261. — doi:10.1016/j.ccr.2004.07.012. — PMID 15380516.
  • Gerhard D.S., Wagner L., Feingold E.A., et al. The Status, Quality, and Expansion of the NIH Full-Length cDNA Project: The Mammalian Gene Collection (MGC) (англ.) // Genome Res.[англ.] : journal. — 2004. — Vol. 14, no. 10B. — P. 2121—2127. — doi:10.1101/gr.2596504. — PMID 15489334. — PMC 528928.
  • Kimura K., Wakamatsu A., Suzuki Y., et al. Diversification of transcriptional modulation: Large-scale identification and characterization of putative alternative promoters of human genes (англ.) // Genome Res.[англ.] : journal. — 2006. — Vol. 16, no. 1. — P. 55—65. — doi:10.1101/gr.4039406. — PMID 16344560. — PMC 1356129.