Матриксная металлопротеиназа 9

Матриксная металлопротеиназа 9
Доступные структуры
PDBПоиск ортологов: PDBe RCSB
Список идентификаторов PDB

1GKC, 1GKD, 1ITV, 1L6J, 2OVX, 2OVZ, 2OW0, 2OW1, 2OW2, 4H1Q, 4H2E, 4H3X, 4H82, 4HMA, 4JIJ, 4JQG, 4WZV, 4XCT, 5CUH, 5I12

Идентификаторы
ПсевдонимыMMP9, CLG4B, GELB, MANDP2, MMP-9, 92 kDa type IV collagenase, 92 kDa gelatinase, gelatinase B, matrix metallopeptidase 9
Внешние IDOMIM: 120361 MGI: 97011 HomoloGene: 3659 GeneCards: MMP9
Расположение гена (человек)
20-я хромосома человека
Хр.20-я хромосома человека[1]
20-я хромосома человека
Расположение в геноме MMP9
Расположение в геноме MMP9
Локус20q13.12Начало46,008,908 bp[1]
Конец46,016,561 bp[1]
Расположение гена (Мышь)
2-я хромосома мыши
Хр.2-я хромосома мыши[2]
2-я хромосома мыши
Расположение в геноме MMP9
Расположение в геноме MMP9
Локус2 H3|2 85.27 cMНачало164,782,700 bp[2]
Конец164,797,770 bp[2]
Паттерн экспрессии РНК
Bgee
ЧеловекМышь (ортолог)
Наибольшая экспрессия в
  • skin of hip
Наибольшая экспрессия в
  • tibiofemoral joint

  • body of femur

  • Dermatocranium

  • trophoblast giant cell
Дополнительные справочные данные
BioGPS
Дополнительные справочные данные
Генная онтология
Молекулярная функция
  • collagen binding
  • zinc ion binding
  • связывание с ионом металла
  • peptidase activity
  • связывание с белками плазмы
  • связывание похожих белков
  • гидролазная активность
  • metallopeptidase activity
  • endopeptidase activity
  • serine-type endopeptidase activity
  • metalloendopeptidase activity
Компонент клетки
  • внеклеточный матрикс
  • экзосома
  • внеклеточное пространство
  • tertiary granule lumen
  • ficolin-1-rich granule lumen
  • внеклеточная область
  • collagen-containing extracellular matrix
Биологический процесс
  • skeletal system development
  • negative regulation of cation channel activity
  • positive regulation of protein phosphorylation
  • endodermal cell differentiation
  • negative regulation of cysteine-type endopeptidase activity involved in apoptotic signaling pathway
  • оссификация
  • negative regulation of intrinsic apoptotic signaling pathway
  • ephrin receptor signaling pathway
  • extracellular matrix disassembly
  • негативная регуляция апоптоза
  • протеолиз
  • macrophage differentiation
  • positive regulation of keratinocyte migration
  • positive regulation of apoptotic process
  • collagen catabolic process
  • positive regulation of release of cytochrome c from mitochondria
  • positive regulation of receptor binding
  • positive regulation of DNA binding
  • positive regulation of epidermal growth factor receptor signaling pathway
  • embryo implantation
  • leukocyte migration
  • positive regulation of vascular associated smooth muscle cell proliferation
  • extracellular matrix organization
  • positive regulation of cell migration
  • neutrophil degranulation
  • cellular response to reactive oxygen species
  • cellular response to cadmium ion
  • cytokine-mediated signaling pathway
  • regulation of neuroinflammatory response
  • negative regulation of epithelial cell differentiation involved in kidney development
  • response to amyloid-beta
Источники: Amigo, QuickGO
Ортологи
ВидЧеловекМышь
Entrez

4318

17395

Ensembl

ENSG00000100985

ENSMUSG00000017737

UniProt

P14780

P41245

RefSeq (мРНК)

NM_004994

NM_013599

RefSeq (белок)

NP_004985

NP_038627

Локус (UCSC)Chr 20: 46.01 – 46.02 MbChr 2: 164.78 – 164.8 Mb
Поиск по PubMedИскать[3]Искать[4]
Логотип Викиданных Информация в Викиданных
Смотреть (человек)Смотреть (мышь)

Матриксная металлопротеиназа 9 (MMP9; «желатиназа B») - один из ферментов, участвующих в ремоделинге структур внеклеточного матрикса.

Клиническое значение

По данным одного исследования, один missense-полиморфизм гена MMP9 ассоциирован с риском развития межпозвоночной грыжи поясничного отдела[5].

См. также

  • MMP2, «желатиназа A»

Примечания

  1. 1 2 3 GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000100985 - Ensembl, May 2017
  2. 1 2 3 GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000017737 - Ensembl, May 2017
  3. Ссылка на публикацию человека на PubMed:  (неопр.) Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  4. Ссылка на публикацию мыши на PubMed:  (неопр.) Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  5. Hirose Y., Chiba K., Karasugi T., Nakajima M., Kawaguchi Y., Mikami Y., Furuichi T., Mio F., Miyake A., Miyamoto T., Ozaki K., Takahashi A., Mizuta H., Kubo T., Kimura T., Tanaka T., Toyama Y., Ikegawa S. A functional polymorphism in THBS2 that affects alternative splicing and MMP binding is associated with lumbar-disc herniation (англ.) // Am. J. Hum. Genet.[англ.] : journal. — 2008. — May (vol. 82, no. 5). — P. 1122—1129. — doi:10.1016/j.ajhg.2008.03.013. — PMID 18455130. — PMC 2427305.