CD302 |
---|
|
Идентификаторы |
---|
Псевдонимы | CD302, BIMLEC, CLEC13A, DCL-1, DCL1, CD302 molecule |
---|
Внешние ID | OMIM: 612246 MGI: 1913455 HomoloGene: 8919 GeneCards: CD302 |
---|
|
Расположение гена (Мышь) |
---|
![2-я хромосома мыши](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/b/bb/Ideogram_house_mouse_chromosome_2.svg/260px-Ideogram_house_mouse_chromosome_2.svg.png) | Хр. | 2-я хромосома мыши[2] |
---|
| Локус | 2|2 C1.1 | Начало | 60,082,337 bp[2] |
---|
Конец | 60,114,832 bp[2] |
---|
|
Паттерн экспрессии РНК |
---|
Bgee | Человек | Мышь (ортолог) |
---|
Наибольшая экспрессия в | - lower lobe of lung
- right lobe of liver
|
| Наибольшая экспрессия в | - left lobe of liver
- stroma of bone marrow
- tunica adventitia of aorta
- right lung lobe
- skin of external ear
|
| Дополнительные справочные данные |
|
---|
BioGPS | |
---|
|
Генная онтология |
---|
Молекулярная функция | - связывание углеводов
- transmembrane signaling receptor activity
| Компонент клетки | - filopodium
- цитоплазма
- часть мембраны
- Микроворсинка
- cell projection
- cell cortex
- мембрана
- часть клеточной мембраны
| Биологический процесс | - Фагоцитоз
- передача сигнала
| Источники: Amigo, QuickGO |
|
Ортологи |
---|
Вид | Человек | Мышь |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | |
---|
NM_014880 NM_001198763 NM_001198764 |
| |
---|
RefSeq (белок) | |
---|
NP_001185692 NP_001185693 NP_055695 |
| |
---|
Локус (UCSC) | Chr 2: 159.77 – 159.8 Mb | Chr 2: 60.08 – 60.11 Mb |
---|
Поиск по PubMed | Искать[3] | Искать[4] |
---|
|
Информация в Викиданных |
Смотреть (человек) | Смотреть (мышь) |
|
CD302, или CLEC13A (англ. C-type lectin domain family 13 member A, лектин С-типа домен семейство 13 член A) — мембранный белок, лектин типа С. Продукт гена человека CD302[5][6].
Тканевая специфичность
Экспрессирован в умеренном количестве на моноцитах, миелоидных дендритных клетках крови, низкий уровень обнаружен на плазмацитоидных дендритных клетках крови, а также макрофагах и дендритных клетках моноцитарного происхождения. Наивысший уровень находится в печени, лёгких, лейкоцитах периферической крови, селезёнке. При лимфоме Ходжкина изоформы 2 и 3 экспрессируются клетками Ходжкина-Рида-Штернберга.
Функции
Белок относится к суперсемейству белков CTL/CTLD (лектин типа С/лектин типа С-подобный домен). Члены этого семейства имеют сходную белковую структуру и обладают разнообразными функциями, такими как адгезия клеток, межклеточная передача сигнала, метаболизм гликопротеинов, роль в воспалении и иммунном ответе. CD302 является мультифункциональным рецептором, который играет роль в клеточной адгезии, миграции, а также в эндоцитозе и фагоцитозе.[7].
Структура
Является трансмембранным белком 1-го типа. Белок состоит из 210 аминокислот, содержит один трансмембранный домен. Внеклеточный домен содержит 1 участока N-гликозилирования аспарагинового остатка и 1 дисульфидную связь.
Примечания
- ↑ 1 2 3 GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000241399 - Ensembl, May 2017
- ↑ 1 2 3 GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000060703 - Ensembl, May 2017
- ↑ Ссылка на публикацию человека на PubMed: (неопр.) Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
- ↑ Ссылка на публикацию мыши на PubMed: (неопр.) Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
- ↑ Nomura N., Miyajima N., Sazuka T., Tanaka A., Kawarabayasi Y., Sato S., Nagase T., Seki N., Ishikawa K., Tabata S. Prediction of the coding sequences of unidentified human genes. I. The coding sequences of 40 new genes (KIAA0001-KIAA0040) deduced by analysis of randomly sampled cDNA clones from human immature myeloid cell line KG-1 (англ.) // DNA Res.[англ.] : journal. — 1994. — Vol. 1, no. 1. — P. 27—35. — doi:10.1093/dnares/1.1.27. — PMID 7584026.
- ↑ Nomura N., Miyajima N., Sazuka T., Tanaka A., Kawarabayasi Y., Sato S., Nagase T., Seki N., Ishikawa K., Tabata S. Prediction of the coding sequences of unidentified human genes. I. The coding sequences of 40 new genes (KIAA0001-KIAA0040) deduced by analysis of randomly sampled cDNA clones from human immature myeloid cell line KG-1 (supplement) (англ.) // DNA Res.[англ.] : journal. — 1994. — Vol. 1, no. 1. — P. 47—56. — doi:10.1093/dnares/1.1.47. — PMID 7584028.
- ↑ Kato M., Khan S., d'Aniello E., McDonald K.J., Hart D.N. The novel endocytic and phagocytic C-Type lectin receptor DCL-1/CD302 on macrophages is colocalized with F-actin, suggesting a role in cell adhesion and migration (англ.) // J. Immunol.[англ.] : journal. — 2007. — November (vol. 179, no. 9). — P. 6052—6063. — doi:10.4049/jimmunol.179.9.6052. — PMID 17947679.
Литература
- Hillier L.W., Graves T.A., Fulton R.S. et al. Generation and annotation of the DNA sequences of human chromosomes 2 and 4. (англ.) // Nature : journal. — 2005. — Vol. 434, no. 7034. — P. 724—731. — doi:10.1038/nature03466. — PMID 15815621.
- Gerhard D.S., Wagner L., Feingold E.A. et al. The Status, Quality, and Expansion of the NIH Full-Length cDNA Project: The Mammalian Gene Collection (MGC) (англ.) // Genome Res.[англ.] : journal. — 2004. — Vol. 14, no. 10B. — P. 2121—2127. — doi:10.1101/gr.2596504. — PMID 15489334. — PMC 528928.
- Yang S., Noble C.G., Yang D. Characterization of DLC1-SAM equilibrium unfolding at the amino acid residue level (англ.) // Biochemistry : journal. — 2009. — Vol. 48, no. 19. — P. 4040—4049. — doi:10.1021/bi9000936. — PMID 19317456.
- Kato M., Khan S., Gonzalez N. et al. Hodgkin's lymphoma cell lines express a fusion protein encoded by intergenically spliced mRNA for the multilectin receptor DEC-205 (CD205) and a novel C-type lectin receptor DCL-1 (англ.) // J. Biol. Chem. : journal. — 2003. — Vol. 278, no. 36. — P. 34035—34041. — doi:10.1074/jbc.M303112200. — PMID 12824192.
- Bonaldo M.F., Lennon G., Soares M.B. Normalization and subtraction: two approaches to facilitate gene discovery (англ.) // Genome Res.[англ.] : journal. — 1996. — Vol. 6, no. 9. — P. 791—806. — doi:10.1101/gr.6.9.791. — PMID 8889548.
- Strausberg R.L., Feingold E.A., Grouse L.H. et al. Generation and initial analysis of more than 15,000 full-length human and mouse cDNA sequences (англ.) // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America : journal. — 2002. — Vol. 99, no. 26. — P. 16899—16903. — doi:10.1073/pnas.242603899. — PMID 12477932. — PMC 139241.
![Перейти к шаблону «Кластеры дифференцировки»](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/c/c9/Wikipedia_interwiki_section_gear_icon.svg/14px-Wikipedia_interwiki_section_gear_icon.svg.png) |
---|
1-50 | - CD1 (a-c, 1A, 1D, 1E)
- CD2
- CD3 (γ, δ, ε)
- CD4
- CD5
- CD6
- CD7
- CD8 (a)
- CD9
- CD10
- CD11 (a, b, c, d)
- CD13
- CD14
- CD15
- CD16 (A, B)
- CD18
- CD19
- CD20
- CD21
- CD22
- CD23
- CD24
- CD25
- CD26
- CD27
- CD28
- CD29
- CD30
- CD31
- CD32 (A, B)
- CD33
- CD34
- CD35
- CD36
- CD37
- CD38
- CD39
- CD40
- CD41
- CD42 (a, b, c, d)
- CD43
- CD44
- CD45
- CD46
- CD47
- CD48
- CD49 (a, b, c, d, e, f)
- CD50
|
---|
51-100 | - CD51
- CD52
- CD53
- CD54
- CD55
- CD56
- CD57
- CD58
- CD59
- CD61
- CD62 (E, L, P)
- CD63
- CD64 (A, B, C)
- CD66 (a, b, c, d, e, f)
- CD68
- CD69
- CD70
- CD71
- CD72
- CD73
- CD74
- CD78
- CD79 (a, b)
- CD80
- CD81
- CD82
- CD83
- CD84
- CD85 (a, d, e, h, j, k)
- CD86
- CD87
- CD88
- CD89
- CD90
- CD91
- CD92
- CD93
- CD94
- CD95
- CD96
- CD97
- CD98
- CD99
- CD100
|
---|
101-150 | |
---|
151-200 | - CD151
- CD152
- CD153
- CD154
- CD155
- CD156 (a, b, c)
- CD157
- CD158 (a, d, e, i, k)
- CD159 (a, c)
- CD160
- CD161
- CD162
- CD163
- CD164
- CD166
- CD167 (a, b)
- CD168
- CD169
- CD170
- CD171
- CD172 (a, b, g)
- CD174
- CD177
- CD178
- CD179 (a, b)
- CD181
- CD182
- CD183
- CD184
- CD185
- CD186
- CD191
- CD192
- CD193
- CD194
- CD195
- CD196
- CD197
- CDw198
- CDw199
- CD200
|
---|
201-250 | |
---|
251-300 | |
---|
301-350 | |
---|
351-400 | |
---|