CD3D |
---|
![](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/5/5c/Protein_CD3D_PDB_1xiw.png/250px-Protein_CD3D_PDB_1xiw.png) |
Доступные структуры |
---|
PDB | Поиск ортологов: PDBe RCSB |
---|
Список идентификаторов PDB |
---|
1XIW |
|
|
Идентификаторы |
---|
Псевдонимы | CD3D, CD3-DELTA, IMD19, T3D, CD3d molecule, CD3 delta subunit of T-cell receptor complex, CD3DELTA |
---|
Внешние ID | OMIM: 186790 MGI: 88331 HomoloGene: 585 GeneCards: CD3D |
---|
|
Расположение гена (Мышь) |
---|
![9-я хромосома мыши](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/4/41/Ideogram_house_mouse_chromosome_9.svg/260px-Ideogram_house_mouse_chromosome_9.svg.png) | Хр. | 9-я хромосома мыши[2] |
---|
| Локус | 9 A5.2|9 24.84 cM | Начало | 44,893,084 bp[2] |
---|
Конец | 44,898,637 bp[2] |
---|
|
Паттерн экспрессии РНК |
---|
Bgee | Человек | Мышь (ортолог) |
---|
Наибольшая экспрессия в | - epithelium of nasopharynx
- mucosa of ileum
|
| Наибольшая экспрессия в | - subcutaneous adipose tissue
- right lung lobe
- superior surface of tongue
|
| Дополнительные справочные данные |
|
---|
BioGPS | ![](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/d/d6/PBB_GE_CD3D_213539_at_fs.png/250px-PBB_GE_CD3D_213539_at_fs.png) | Дополнительные справочные данные |
|
---|
|
Генная онтология |
---|
Молекулярная функция | - transcription coactivator activity
- protein heterodimerization activity
- transmembrane signaling receptor activity
- гомодимеризация белка
| Компонент клетки | - мембрана
- цитоплазма
- alpha-beta T cell receptor complex
- часть мембраны
- T cell receptor complex
- clathrin-coated vesicle membrane
- клеточная мембрана
- наружная сторона клеточной мембраны
| Биологический процесс | - положительная регуляция транскрипции РНК полимеразой II промотор
- regulation of immune response
- T cell receptor signaling pathway
- T cell differentiation
- positive thymic T cell selection
- cell surface receptor signaling pathway
- membrane organization
- protein homooligomerization
- adaptive immune response
- immune system process
| Источники: Amigo, QuickGO |
|
Ортологи |
---|
Вид | Человек | Мышь |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | |
---|
RefSeq (белок) | | |
---|
Локус (UCSC) | Chr 11: 118.34 – 118.34 Mb | Chr 9: 44.89 – 44.9 Mb |
---|
Поиск по PubMed | Искать[3] | Искать[4] |
---|
|
Информация в Викиданных |
Смотреть (человек) | Смотреть (мышь) |
|
CD3d (англ. T-cell surface glycoprotein CD3 delta chain) — трансмембранный белок семейства гликопротеинов CD3, локализованных на поверхности T-лимфоцитов. Продукт гена человека CD3D[5].
Функции
Часть мультимолекулярного комплекса TCR-CD3 на поверхности T-лимфоцитов, играющего ключевую роль в приобретённом иммунитете. Когда антигенпредставляющие клетки активируют TCR, сигнал переносится через мембрану полипептидными цепями рецепторного комплекса CD3: CD3D (δ-цепь), CD3E (ε-цепь), CD3G (γ-цепь) и CD3Z (ζ-цепь). Все эти цепи содержат активирующие ITAM-мотивы в своих цитопламатических доменах. После активации рецептора ITAM-мотивы фосфорилируются тирозинкиназами LCK и FYN семейства Src, что приводит к активации дальнейшего сигнального каскада[6]. Кроме этого, CD3D играет ключевую роль в дифференцировке тимоцитов. Участвует в корректной сборке комплекса TCR-CD3 и его экспрессии на клеточной поверхности. Без TCR тимоциты не способны к нормальной дифференцировке. Взаимодействует с ко-рецепторами CD4 и CD8, что является необходимым условием для активации и положительной селекции CD4- или CD8-T-клеток[7].
Патология
Мутации гена приводят к тяжёлому иммунодефициту 19-го типа[7].
Взаимодействия
CD3D взаимодействует с белком CD8A, который является ко-рецептором T-клеточного рецептора[7].
Структура
Белок состоит из 171 аминокислоты, молекулярная масса 18,9 кДа.
Примечания
- ↑ 1 2 3 GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000167286 - Ensembl, May 2017
- ↑ 1 2 3 GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000032094 - Ensembl, May 2017
- ↑ Ссылка на публикацию человека на PubMed: (неопр.) Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
- ↑ Ссылка на публикацию мыши на PubMed: (неопр.) Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
- ↑ Entrez Gene: CD3D CD3d molecule, delta (CD3-TCR complex) (неопр.). Архивировано 5 декабря 2010 года.
- ↑ Barber E. K., Dasgupta J. D., Schlossman S. F., Trevillyan J. M., Rudd C. E. The CD4 and CD8 antigens are coupled to a protein-tyrosine kinase (p56lck) that phosphorylates the CD3 complex. (англ.) // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America : journal. — 1989. — Vol. 86, no. 9. — P. 3277—3281. — doi:10.1073/pnas.86.9.3277. — PMID 2470098. — PMC 287114.
- ↑ 1 2 3 Doucey M. A., Goffin L., Naeher D., Michielin O., Baumgärtner P., Guillaume P et al. CD3 delta establishes a functional link between the T cell receptor and CD8. (англ.) // J Biol Chem : journal. — 2003. — Vol. 278, no. 5. — P. 3257—3264. — doi:10.1074/jbc.M208119200. — PMID 12215456.
Литература
- Balk S. P., Polischuk J. E., Probert C. et al. Composition of TCR-CD3 complex in human intestinal intraepithelial lymphocytes: lack of Fc epsilon RI gamma chain. (англ.) // Int. Immunol.[англ.] : journal. — 1996. — Vol. 7, no. 8. — P. 1237—1241. — doi:10.1093/intimm/7.8.1237. — PMID 7495730.
- Li C. J. Therapeutic biology: checkpoint pathway activation therapy, HIV Tat, and transkingdom RNA interference. (англ.) // J. Cell. Physiol.[англ.] : journal. — 2007. — Vol. 209, no. 3. — P. 695—700. — doi:10.1002/jcp.20817. — PMID 17001685.
- Phillips J. H., Hori T., Nagler A. et al. Ontogeny of human natural killer (NK) cells: fetal NK cells mediate cytolytic function and express cytoplasmic CD3 epsilon, delta proteins. (англ.) // J. Exp. Med.[англ.] : journal. — Rockefeller University Press[англ.], 1992. — Vol. 175, no. 4. — P. 1055—1066. — doi:10.1084/jem.175.4.1055. — PMID 1372642. — PMC 2119193.
- Luzzati A. L., Giacomini E., Giordani L. et al. The antigen-specific induction of normal human lymphocytes in vitro is down-regulated by a conserved HIV p24 epitope. (англ.) // Immunol. Lett.[англ.] : journal. — 1992. — Vol. 33, no. 3. — P. 307—314. — doi:10.1016/0165-2478(92)90078-3. — PMID 1385321.
- Alarcón B., Ley S. C., Sánchez-Madrid F. et al. The CD3-gamma and CD3-delta subunits of the T cell antigen receptor can be expressed within distinct functional TCR/CD3 complexes. (англ.) // EMBO J. : journal. — 1991. — Vol. 10, no. 4. — P. 903—912. — doi:10.1002/j.1460-2075.1991.tb08023.x. — PMID 1826255. — PMC 452733.
- Hori T., de Waal Malefyt R., Duncan B. W. et al. Cloning of a novel cell type from human fetal liver expressing cytoplasmic CD3 delta and epsilon but not membrane CD3. (англ.) // Int. Immunol.[англ.] : journal. — 1991. — Vol. 3, no. 4. — P. 353—357. — doi:10.1093/intimm/3.4.353. — PMID 1831653.
- Ruegg C. L., Strand M. A synthetic peptide with sequence identity to the transmembrane protein GP41 of HIV-1 inhibits distinct lymphocyte activation pathways dependent on protein kinase C and intracellular calcium influx. (англ.) // Cell. Immunol. : journal. — 1991. — Vol. 137, no. 1. — P. 1—13. — doi:10.1016/0008-8749(91)90051-C. — PMID 1832084.
- Cefai D., Debre P., Kaczorek M. et al. Human immunodeficiency virus-1 glycoproteins gp120 and gp160 specifically inhibit the CD3/T cell-antigen receptor phosphoinositide transduction pathway. (англ.) // J. Clin. Invest.[англ.] : journal. — 1991. — Vol. 86, no. 6. — P. 2117—2124. — doi:10.1172/JCI114950. — PMID 1979339. — PMC 329852.
- Luzzati A. L., Pugliese O., Giacomini E. et al. Immunoregulatory effect of a synthetic peptide corresponding to a region of protein p24 of HIV. (англ.) // Folia Biol. (Praha) : journal. — 1990. — Vol. 36, no. 1. — P. 71—7. — PMID 2111780.
- Koning F., Maloy W. L., Coligan J. E. The implications of subunit interactions for the structure of the T cell receptor-CD3 complex. (англ.) // Eur. J. Immunol.[англ.] : journal. — 1990. — Vol. 20, no. 2. — P. 299—305. — doi:10.1002/eji.1830200211. — PMID 2138083.
- Alexander D., Goris J., Marais R. et al. Dephosphorylation of the human T lymphocyte CD3 antigen. (англ.) // Eur. J. Biochem.[англ.] : journal. — 1989. — Vol. 181, no. 1. — P. 55—65. — doi:10.1111/j.1432-1033.1989.tb14693.x. — PMID 2540970.
- Tunnacliffe A., Buluwela L., Rabbitts T. H. Physical linkage of three CD3 genes on human chromosome 11. (англ.) // EMBO J. : journal. — 1988. — Vol. 6, no. 10. — P. 2953—2957. — doi:10.1002/j.1460-2075.1987.tb02600.x. — PMID 2826124. — PMC 553731.
- van den Elsen P., Shepley B. A., Cho M., Terhorst C. Isolation and characterization of a cDNA clone encoding the murine homologue of the human 20K T3/T-cell receptor glycoprotein. (англ.) // Nature : journal. — 1985. — Vol. 314, no. 6011. — P. 542—544. — doi:10.1038/314542a0. — Bibcode: 1985Natur.314..542V. — PMID 2859526.
- van den Elsen P., Georgopoulos K., Shepley B. A. et al. Exon/intron organization of the genes coding for the delta chains of the human and murine T-cell receptor/T3 complex. (англ.) // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America : journal. — 1986. — Vol. 83, no. 9. — P. 2944—2948. — doi:10.1073/pnas.83.9.2944. — PMID 2939461. — PMC 323423.
- Gold D. P., Clevers H., Alarcon B. et al. Evolutionary relationship between the T3 chains of the T-cell receptor complex and the immunoglobulin supergene family. (англ.) // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America : journal. — 1987. — Vol. 84, no. 21. — P. 7649—7653. — doi:10.1073/pnas.84.21.7649. — Bibcode: 1987PNAS...84.7649G. — PMID 3478717. — PMC 299357.
- Tunnacliffe A., Sims J. E., Rabbitts T. H. T3 delta pre-mRNA is transcribed from a non-TATA promoter and is alternatively spliced in human T cells. (англ.) // EMBO J. : journal. — 1986. — Vol. 5, no. 6. — P. 1245—1252. — doi:10.1002/j.1460-2075.1986.tb04353.x. — PMID 3488209. — PMC 1166934.
- van den Elsen P., Shepley B. A., Borst J. et al. Isolation of cDNA clones encoding the 20K T3 glycoprotein of human T-cell receptor complex. (англ.) // Nature : journal. — 1985. — Vol. 312, no. 5993. — P. 413—418. — doi:10.1038/312413a0. — Bibcode: 1984Natur.312..413V. — PMID 6095101.
- Oravecz T., Norcross M. A. Costimulatory properties of the human CD4 molecule: enhancement of CD3-induced T cell activation by human immunodeficiency virus type 1 through viral envelope glycoprotein gp120. (англ.) // AIDS Res. Hum. Retroviruses[англ.] : journal. — 1994. — Vol. 9, no. 10. — P. 945—955. — doi:10.1089/aid.1993.9.945. — PMID 7506554.
- Luzzati A. L., Giacomini E., Giordani L. et al. An HIV p24 heptapeptide down-regulates antigen-specific responses in vitro interfering at the level of the T3-Ti complex. (англ.) // Cell. Immunol. : journal. — 1994. — Vol. 156, no. 2. — P. 286—295. — doi:10.1006/cimm.1994.1175. — PMID 7517794.
![Перейти к шаблону «Кластеры дифференцировки»](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/c/c9/Wikipedia_interwiki_section_gear_icon.svg/14px-Wikipedia_interwiki_section_gear_icon.svg.png) |
---|
1-50 | - CD1 (a-c, 1A, 1D, 1E)
- CD2
- CD3 (γ, δ, ε)
- CD4
- CD5
- CD6
- CD7
- CD8 (a)
- CD9
- CD10
- CD11 (a, b, c, d)
- CD13
- CD14
- CD15
- CD16 (A, B)
- CD18
- CD19
- CD20
- CD21
- CD22
- CD23
- CD24
- CD25
- CD26
- CD27
- CD28
- CD29
- CD30
- CD31
- CD32 (A, B)
- CD33
- CD34
- CD35
- CD36
- CD37
- CD38
- CD39
- CD40
- CD41
- CD42 (a, b, c, d)
- CD43
- CD44
- CD45
- CD46
- CD47
- CD48
- CD49 (a, b, c, d, e, f)
- CD50
|
---|
51-100 | - CD51
- CD52
- CD53
- CD54
- CD55
- CD56
- CD57
- CD58
- CD59
- CD61
- CD62 (E, L, P)
- CD63
- CD64 (A, B, C)
- CD66 (a, b, c, d, e, f)
- CD68
- CD69
- CD70
- CD71
- CD72
- CD73
- CD74
- CD78
- CD79 (a, b)
- CD80
- CD81
- CD82
- CD83
- CD84
- CD85 (a, d, e, h, j, k)
- CD86
- CD87
- CD88
- CD89
- CD90
- CD91
- CD92
- CD93
- CD94
- CD95
- CD96
- CD97
- CD98
- CD99
- CD100
|
---|
101-150 | |
---|
151-200 | - CD151
- CD152
- CD153
- CD154
- CD155
- CD156 (a, b, c)
- CD157
- CD158 (a, d, e, i, k)
- CD159 (a, c)
- CD160
- CD161
- CD162
- CD163
- CD164
- CD166
- CD167 (a, b)
- CD168
- CD169
- CD170
- CD171
- CD172 (a, b, g)
- CD174
- CD177
- CD178
- CD179 (a, b)
- CD181
- CD182
- CD183
- CD184
- CD185
- CD186
- CD191
- CD192
- CD193
- CD194
- CD195
- CD196
- CD197
- CDw198
- CDw199
- CD200
|
---|
201-250 | |
---|
251-300 | |
---|
301-350 | |
---|
351-400 | |
---|