CLEC7A |
---|
|
Доступные структуры |
---|
PDB | Поиск ортологов: PDBe RCSB |
---|
Список идентификаторов PDB |
---|
2BPD, 2BPE, 2BPH, 2CL8 |
|
|
Идентификаторы |
---|
Псевдонимы | CLEC7A, BGR, CANDF4, CLECSF12, DECTIN1, CD369, SCARE2, C-type lectin domain family 7 member A, C-type lectin domain containing 7A |
---|
Внешние ID | OMIM: 606264 MGI: 1861431 HomoloGene: 49606 GeneCards: CLEC7A |
---|
|
Расположение гена (Мышь) |
---|
![6-я хромосома мыши](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/c/c0/Ideogram_house_mouse_chromosome_6.svg/260px-Ideogram_house_mouse_chromosome_6.svg.png) | Хр. | 6-я хромосома мыши[2] |
---|
| Локус | 6|6 F3 | Начало | 129,438,554 bp[2] |
---|
Конец | 129,449,742 bp[2] |
---|
|
Паттерн экспрессии РНК |
---|
Bgee | Человек | Мышь (ортолог) |
---|
Наибольшая экспрессия в | - buccal mucosa cell
- tendon of biceps brachii
- upper lobe of left lung
|
| Наибольшая экспрессия в | - right lung lobe
- tibiofemoral joint
- mucous cell of stomach
- subcutaneous adipose tissue
|
| Дополнительные справочные данные |
|
---|
BioGPS | ![](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/2/23/PBB_GE_CLEC7A_221698_s_at_fs.png/250px-PBB_GE_CLEC7A_221698_s_at_fs.png) | Дополнительные справочные данные |
|
---|
|
Генная онтология |
---|
Молекулярная функция | - MHC protein binding
- pattern recognition receptor activity
- связывание с ионом металла
- связывание с белками плазмы
- связывание углеводов
| Компонент клетки | - цитоплазма
- часть мембраны
- intracellular membrane-bounded organelle
- мембрана
- клеточная мембрана
- нуклеоплазма
| Биологический процесс | - cell recognition
- immune system process
- carbohydrate mediated signaling
- phagocytosis, recognition
- воспалительная реакция
- T cell activation
- defense response to protozoan
- pattern recognition receptor signaling pathway
- врождённый иммунитет
- positive regulation of protein-containing complex assembly
- positive regulation of interleukin-1 beta production
- positive regulation of cysteine-type endopeptidase activity involved in apoptotic process
- positive regulation of phagocytosis
- positive regulation of killing of cells of other organism
- positive regulation of cytokine production involved in inflammatory response
| Источники: Amigo, QuickGO |
|
Ортологи |
---|
Вид | Человек | Мышь |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | NM_022570 NM_197947 NM_197948 NM_197949 NM_197950
|
---|
NM_197951 NM_197952 NM_197953 NM_197954 |
| |
---|
RefSeq (белок) | NP_072092 NP_922938 NP_922939 NP_922940 NP_922941
|
---|
NP_922945 |
| |
---|
Локус (UCSC) | Chr 12: 10.12 – 10.13 Mb | Chr 6: 129.44 – 129.45 Mb |
---|
Поиск по PubMed | Искать[3] | Искать[4] |
---|
|
Информация в Викиданных |
Смотреть (человек) | Смотреть (мышь) |
|
CLEC7A (англ. C-type lectin domain family 7 member A, лектин С-типа домен семейство 7 член A; CD369), или дектин-1 (англ. Dectin-1) — мембранный белок семейства лектинов типа С. Продукт гена человека CLEC7A[5].
Структура
CLEC7A состоит из 247 аминокислот, молекулярная масса 27,6 кДа. Содержит лектиновый домен типа C и активирующий ITAM-подобный мотив.
Функции
CLEC7A является мембранным белком 2-го типа из семейства лектинов типа С. Внеклеточный лектиновый домен распознаёт β-1,3- и β-1,6-связанные глюканы и, таким образом, служит как рецептор опознавания паттерна глюканов растительного и грибкового происхождения. Участвует во врождённом иммунитете. Связывание лиганда приводит к стимулированию переноса сигнала, опосредованного ITAM-мотивом. CLEC7A может индуцировать как Syk-зависимый, так и Syk-независимый сигнальные пути. Димеризация белка приводит к фосфорилированию киназ семейства Src и рекрутированию тирозинкиназы Syk, которая активирует фактор транскрипции NF-κB. NF-κB отвечает за синтез множества воспалительных цитокинов и хемокинов, включая TNF, IL-23, IL-6, IL-2. Кроме воспалительной реакции это приводит к оксидативному стрессу, образованию метаболитов арахидоновой кислоты, созреванию дендритных клеток и фагоцитозу лиганда[6][7].
Противогрибковый иммунитет
CLEC7A распознаёт виды нескольких родов грибков, включая Saccharomyces, Candida, Pneumocystis, Coccidioides, Penicillium и другие. Распознавание этих патогенов вызывает такие защитные реакции, как фагоцитоз и окислительный стресс, а также образование противогрибковых цито- и хемокинов (TNF, CXCL2, IL-1b, IL-1a, CCL3, GM-CSF, G-CSF и IL-6) и развитие Т-хелперов 17.[7]
Ко-стимулирующая молекула
CLEC7A может играть роль ко-стимулирующей молекулы путём распознавания лиганда на поверхности T-лимфоцитов, что приводит к клеточной активации и пролиферации. Дектин-1 также связывает CD4+ и CD8+ T-клетки.[7]
Тканевая специфичность
Белок экспрессирован на дендритных клетках, моноцитах, макрофагах и B-лимфоцитах[5].
Примечания
- ↑ 1 2 3 GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000172243 - Ensembl, May 2017
- ↑ 1 2 3 GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000079293 - Ensembl, May 2017
- ↑ Ссылка на публикацию человека на PubMed: (неопр.) Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
- ↑ Ссылка на публикацию мыши на PubMed: (неопр.) Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
- ↑ 1 2 Entrez Gene: CLEC7A C-type lectin domain family 7, member A (неопр.).
- ↑ Drummond R.A., Brown G.D. The role of Dectin-1 in the host defence against fungal infections. (англ.) // Curr Opin Microbiol : journal. — 2011. — Vol. 14, no. 4. — P. 392—399. — doi:10.1016/j.mib.2011.07.001. — PMID 21803640.
- ↑ 1 2 3 Huysamen C., Brown G.D. The fungal pattern recognition receptor, Dectin-1, and the associated cluster of C-type lectin-like receptors. (англ.) // FEMS Microbiol Lett : journal. — 2009. — Vol. 290, no. 2. — P. 121—128. — doi:10.1111/j.1574-6968.2008.01418.x. — PMID 19025564. — PMC 2704933.
Литература
- Drickamer K. C-type lectin-like domains (англ.) // Curr. Opin. Struct. Biol.. — 1999. — Vol. 9, no. 5. — P. 585—590. — doi:10.1016/S0959-440X(99)00009-3. — PMID 10508765.
- Brown G.D. Dectin-1: a signalling non-TLR pattern-recognition receptor (англ.) // Nat. Rev. Immunol. : journal. — Nature Publishing Group, 2006. — Vol. 6, no. 1. — P. 33—43. — doi:10.1038/nri1745. — PMID 16341139.
- Adams M.D., Kerlavage A.R., Fleischmann R.D., Fuldner R.A., Bult C.J., Lee N.H., Kirkness E.F., Weinstock K.G., Gocayne J.D., White O. Initial assessment of human gene diversity and expression patterns based upon 83 million nucleotides of cDNA sequence (англ.) // Nature : journal. — 1995. — Vol. 377, no. 6547 Suppl. — P. 3—174. — PMID 7566098.
- Ariizumi K., Shen G.L., Shikano S., Xu S., Ritter R., Kumamoto T., Edelbaum D., Morita A., Bergstresser P.R., Takashima A. Identification of a novel, dendritic cell-associated molecule, dectin-1, by subtractive cDNA cloning (англ.) // J. Biol. Chem. : journal. — 2000. — Vol. 275, no. 26. — P. 20157—20167. — doi:10.1074/jbc.M909512199. — PMID 10779524.
- Yokota K., Takashima A., Bergstresser P.R., Ariizumi K. Identification of a human homologue of the dendritic cell-associated C-type lectin-1, dectin-1 (англ.) // Gene[англ.] : journal. — Elsevier, 2001. — Vol. 272, no. 1—2. — P. 51—60. — doi:10.1016/S0378-1119(01)00528-5. — PMID 11470510.
- Hermanz-Falcón P., Arce I., Roda-Navarro P., Fernández-Ruiz E. Cloning of human DECTIN-1, a novel C-type lectin-like receptor gene expressed on dendritic cells (англ.) // Immunogenetics : journal. — 2001. — Vol. 53, no. 4. — P. 288—295. — doi:10.1007/s002510100326. — PMID 11491532.
- Brown G.D., Gordon S. Immune recognition. A new receptor for beta-glucans (англ.) // Nature : journal. — 2001. — Vol. 413, no. 6851. — P. 36—7. — doi:10.1038/35092620. — PMID 11544516.
- Willment J.A., Gordon S., Brown G.D. Characterization of the human beta -glucan receptor and its alternatively spliced isoforms (англ.) // J. Biol. Chem. : journal. — 2001. — Vol. 276, no. 47. — P. 43818—43823. — doi:10.1074/jbc.M107715200. — PMID 11567029.
- Sobanov Y., Bernreiter A., Derdak S., Mechtcheriakova D., Schweighofer B., Düchler M., Kalthoff F., Hofer E. A novel cluster of lectin-like receptor genes expressed in monocytic, dendritic and endothelial cells maps close to the NK receptor genes in the human NK gene complex (англ.) // Eur. J. Immunol.[англ.] : journal. — 2002. — Vol. 31, no. 12. — P. 3493—3503. — doi:10.1002/1521-4141(200112)31:12<3493::AID-IMMU3493>3.0.CO;2-9. — PMID 11745369.
- Grünebach F., Weck M.M., Reichert J., Brossart P. Molecular and functional characterization of human Dectin-1 (англ.) // Exp. Hematol.[англ.] : journal. — 2002. — Vol. 30, no. 11. — P. 1309—1315. — doi:10.1016/S0301-472X(02)00928-1. — PMID 12423684.
- Ahrén I.L., Eriksson E., Egesten A., Riesbeck K. Nontypeable Haemophilus influenzae activates human eosinophils through beta-glucan receptors (англ.) // Am. J. Respir. Cell Mol. Biol.[англ.] : journal. — 2003. — Vol. 29, no. 5. — P. 598—605. — doi:10.1165/rcmb.2002-0138OC. — PMID 12689921.
- Ebner S., Sharon N., Ben-Tal N. Evolutionary analysis reveals collective properties and specificity in the C-type lectin and lectin-like domain superfamily (англ.) // Proteins : journal. — 2003. — Vol. 53, no. 1. — P. 44—55. — doi:10.1002/prot.10440. — PMID 12945048.
- Clark H.F., Gurney A.L., Abaya E., Baker K., Baldwin D., Brush J., Chen J., Chow B., Chui C., Crowley C., Currell B., Deuel B., Dowd P., Eaton D., Foster J., Grimaldi C., Gu Q., Hass P.E., Heldens S., Huang A., Kim H.S., Klimowski L., Jin Y., Johnson S., Lee J., Lewis L., Liao D., Mark M., Robbie E., Sanchez C., Schoenfeld J., Seshagiri S., Simmons L., Singh J., Smith V., Stinson J., Vagts A., Vandlen R., Watanabe C., Wieand D., Woods K., Xie M.H., Yansura D., Yi S., Yu G., Yuan J., Zhang M., Zhang Z., Goddard A., Wood W.I., Godowski P., Gray A. The secreted protein discovery initiative (SPDI), a large-scale effort to identify novel human secreted and transmembrane proteins: a bioinformatics assessment (англ.) // Genome Res.[англ.] : journal. — 2003. — Vol. 13, no. 10. — P. 2265—2270. — doi:10.1101/gr.1293003. — PMID 12975309. — PMC 403697.
- Taylor P.R., Brown G.D., Herre J., Williams D.L., Willment J.A., Gordon S. The role of SIGNR1 and the beta-glucan receptor (dectin-1) in the nonopsonic recognition of yeast by specific macrophages (англ.) // J. Immunol.[англ.] : journal. — 2004. — Vol. 172, no. 2. — P. 1157—1162. — doi:10.4049/jimmunol.172.2.1157. — PMID 14707091.
- Mantegazza A.R., Barrio M.M., Moutel S., Bover L., Weck M., Brossart P., Teillaud J.L., Mordoh J. CD63 tetraspanin slows down cell migration and translocates to the endosomal-lysosomal-MIICs route after extracellular stimuli in human immature dendritic cells (англ.) // Blood[англ.] : journal. — American Society of Hematology[англ.], 2005. — Vol. 104, no. 4. — P. 1183—1190. — doi:10.1182/blood-2004-01-0104. — PMID 15130945.
- de la Rosa G., Yáñez-Mó M., Samaneigo R., Serrano-Gómez D., Martínez-Muñoz L., Fernández-Ruiz E., Longo N., Sánchez-Madrid F., Corbí A.L., Sánchez-Mateos P. Regulated recruitment of DC-SIGN to cell-cell contact regions during zymosan-induced human dendritic cell aggregation (англ.) // J. Leukoc. Biol.[англ.] : journal. — 2005. — Vol. 77, no. 5. — P. 699—709. — doi:10.1189/jlb.0904529. — PMID 15728245.
- Willment J.A., Marshall A.S., Reid D.M., Williams D.L., Wong S.Y., Gordon S., Brown G.D. The human beta-glucan receptor is widely expressed and functionally equivalent to murine Dectin-1 on primary cells (англ.) // Eur. J. Immunol.[англ.] : journal. — 2005. — Vol. 35, no. 5. — P. 1539—1547. — doi:10.1002/eji.200425725. — PMID 15816015.
![Перейти к шаблону «Кластеры дифференцировки»](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/c/c9/Wikipedia_interwiki_section_gear_icon.svg/14px-Wikipedia_interwiki_section_gear_icon.svg.png) |
---|
1-50 | - CD1 (a-c, 1A, 1D, 1E)
- CD2
- CD3 (γ, δ, ε)
- CD4
- CD5
- CD6
- CD7
- CD8 (a)
- CD9
- CD10
- CD11 (a, b, c, d)
- CD13
- CD14
- CD15
- CD16 (A, B)
- CD18
- CD19
- CD20
- CD21
- CD22
- CD23
- CD24
- CD25
- CD26
- CD27
- CD28
- CD29
- CD30
- CD31
- CD32 (A, B)
- CD33
- CD34
- CD35
- CD36
- CD37
- CD38
- CD39
- CD40
- CD41
- CD42 (a, b, c, d)
- CD43
- CD44
- CD45
- CD46
- CD47
- CD48
- CD49 (a, b, c, d, e, f)
- CD50
|
---|
51-100 | - CD51
- CD52
- CD53
- CD54
- CD55
- CD56
- CD57
- CD58
- CD59
- CD61
- CD62 (E, L, P)
- CD63
- CD64 (A, B, C)
- CD66 (a, b, c, d, e, f)
- CD68
- CD69
- CD70
- CD71
- CD72
- CD73
- CD74
- CD78
- CD79 (a, b)
- CD80
- CD81
- CD82
- CD83
- CD84
- CD85 (a, d, e, h, j, k)
- CD86
- CD87
- CD88
- CD89
- CD90
- CD91
- CD92
- CD93
- CD94
- CD95
- CD96
- CD97
- CD98
- CD99
- CD100
|
---|
101-150 | |
---|
151-200 | - CD151
- CD152
- CD153
- CD154
- CD155
- CD156 (a, b, c)
- CD157
- CD158 (a, d, e, i, k)
- CD159 (a, c)
- CD160
- CD161
- CD162
- CD163
- CD164
- CD166
- CD167 (a, b)
- CD168
- CD169
- CD170
- CD171
- CD172 (a, b, g)
- CD174
- CD177
- CD178
- CD179 (a, b)
- CD181
- CD182
- CD183
- CD184
- CD185
- CD186
- CD191
- CD192
- CD193
- CD194
- CD195
- CD196
- CD197
- CDw198
- CDw199
- CD200
|
---|
201-250 | |
---|
251-300 | |
---|
301-350 | |
---|
351-400 | |
---|