ETS1 |
---|
|
Доступные структуры |
---|
PDB | Поиск ортологов: PDBe RCSB |
---|
Список идентификаторов PDB |
---|
1GVJ, 2NNY, 2STT, 2STW, 3MFK, 3RI4, 3WTS, 3WTT, 3WTU, 3WTV, 3WTW, 3WTX, 3WTY, 3WTZ, 3WU0, 3WU1, 4L0Y, 4L0Z, 4L18, 4LG0 |
|
|
Идентификаторы |
---|
Псевдонимы | ETS1, ETS-1, EWSR2, p54, c-ets-1, ETS proto-oncogene 1, transcription factor |
---|
Внешние ID | OMIM: 164720 MGI: 95455 HomoloGene: 3837 GeneCards: ETS1 |
---|
|
Расположение гена (Мышь) |
---|
| Хр. | 9-я хромосома мыши[2] |
---|
| Локус | 9 A4|9 17.97 cM | Начало | 32,636,221 bp[2] |
---|
Конец | 32,757,820 bp[2] |
---|
|
Паттерн экспрессии РНК |
---|
Bgee | Человек | Мышь (ортолог) |
---|
Наибольшая экспрессия в | - visceral pleura
- parietal pleura
- epithelium of nasopharynx
- lower lobe of lung
- epithelium of colon
|
| Наибольшая экспрессия в | - left lung lobe
- Gonadal ridge
- right lung lobe
- endocardial cushion
|
| Дополнительные справочные данные |
|
---|
BioGPS | | Дополнительные справочные данные |
|
---|
|
Генная онтология |
---|
Молекулярная функция | - ДНК-связывающий
- sequence-specific DNA binding
- DNA-binding transcription factor activity
- transcription factor binding
- связывание с белками плазмы
- связывание похожих белков
- transcription factor activity, RNA polymerase II core promoter proximal region sequence-specific binding
- RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding
- DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific
- sequence-specific double-stranded DNA binding
- DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific
- histone acetyltransferase binding
| Компонент клетки | - цитоплазма
- transcription regulator complex
- нуклеоплазма
- клеточное ядро
| Биологический процесс | - regulation of apoptotic process
- развитие гипофиза
- response to estradiol
- response to interleukin-1
- response to hypoxia
- ДНК-зависимая регуляция транскрипции
- positive regulation of erythrocyte differentiation
- движение клеток
- эструс
- immune system process
- regulation of transcription by RNA polymerase II
- response to antibiotic
- женская беременность
- angiogenesis involved in wound healing
- positive regulation of cell migration
- response to mechanical stimulus
- response to laminar fluid shear stress
- negative regulation of cell cycle
- regulation of angiogenesis
- transcription by RNA polymerase II
- regulation of extracellular matrix disassembly
- транскрипция, ДНК-зависимая
- positive regulation of endothelial cell migration
- ДНК-зависимая позитивная регуляция транскрипции
- PML body organization
- response to wounding
- иммунный ответ
- позитивная регуляция пролиферации клеток
- развитие гипоталамуса
- negative regulation of inflammatory response
- положительная регуляция транскрипции РНК полимеразой II промотор
- негативная регуляция пролиферации клеток
- cellular response to hydrogen peroxide
- positive regulation of inflammatory response
- pri-miRNA transcription by RNA polymerase II
- positive regulation of leukocyte adhesion to vascular endothelial cell
- positive regulation of gene expression
- positive regulation of blood vessel endothelial cell migration
- positive regulation of angiogenesis
- дифференцировка клеток
| Источники: Amigo, QuickGO |
|
Ортологи |
---|
Вид | Человек | Мышь |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | |
---|
NM_001143820 NM_001162422 NM_005238 NM_001330451 |
| |
---|
RefSeq (белок) | |
---|
NP_001137292 NP_001155894 NP_001317380 NP_005229 |
| NP_001033731 NP_035938 NP_001359463 NP_001359464 NP_001359465
|
---|
NP_001359466 |
|
---|
Локус (UCSC) | Chr 11: 128.46 – 128.59 Mb | Chr 9: 32.64 – 32.76 Mb |
---|
Поиск по PubMed | Искать[3] | Искать[4] |
---|
|
Информация в Викиданных |
Смотреть (человек) | Смотреть (мышь) |
|
Белок C-ets-1 (англ. Protein C-ets-1) — белок фактор транскрипции, продукт гена человека ETS1[5]. Входит в семейство факторов транскрипции ETS[6].
Функции
Фактор трансккрипции, который осуществляет прямой контроль экспрессии цитокинов и хемокинов в ходе множества клеточных процессов. Может контролировать дифференцировку, выживание и пролиферацию клеток лимфоидного ряда. Может регулировать ангиогенез за счёт регулирования экспрессии генов, отвечающих за миграцию и инвазию клеток.
Взаимодействия
Ets1 взаимодействует с рядом других факторов транскрипции, образуя мультимолекулярные комплексы. При взаимодействии Ets1 с другими факторами транскрипции (Runx1, Pax5, TFE3, USF1) конечный эффект комплекса зависит от статуса фосфорилирования C-концевого домена Ets1 (фосфорилирование инактивирует его). Ацетилтрансферазы CBP и p300 связывают Ets1. трансактивационный домен. AP1, STAT5 и VDR связываются с C-концевым доменом белка.
Кроме этого, Ets1 связывается с TTRAP,[7] UBE2I[8] и DAXX.[9]
Структура и внутриклеточная локализация
Белок C-ets-1 состоит из 441 аминокислоты, молекулярная масса 50,4 кДа. Локализован в клеточном ядре, может переходить в цитоплазму при связывании изоформы Ets-1 p27.
Экспрессия
Наиболее высокий уровеь экспрессии обнаружен в клетках лимфоидного ряда. Изоформы c-ETS-1A и Ets-1 p27 обнаружены во всех фетальных тканях. В тканях взрослого организма уровень может сильно различаться, отсутствует в мозге и почках.
Примечания
- ↑ 1 2 3 GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000134954 - Ensembl, May 2017
- ↑ 1 2 3 GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000032035 - Ensembl, May 2017
- ↑ Ссылка на публикацию человека на PubMed: (неопр.) Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
- ↑ Ссылка на публикацию мыши на PubMed: (неопр.) Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
- ↑ Delattre O., Zucman J., Plougastel B., Desmaze C., Melot T., Peter M., Kovar H., Joubert I., de Jong P., Rouleau G. Gene fusion with an ETS DNA-binding domain caused by chromosome translocation in human tumours (англ.) // Nature : journal. — 1992. — September (vol. 359, no. 6391). — P. 162—165. — doi:10.1038/359162a0. — PMID 1522903.
- ↑ Dwyer J., Li H., Xu D., Liu J. P. Transcriptional regulation of telomerase activity: roles of the Ets transcription factor family (англ.) // Annals of the New York Academy of Sciences[англ.] : journal. — 2007. — October (vol. 1114, no. 1). — P. 36—47. — doi:10.1196/annals.1396.022. — PMID 17986575.
- ↑ Pei H., Yordy J. S., Leng Q., Zhao Q., Watson D. K., Li R. EAPII interacts with ETS1 and modulates its transcriptional function (англ.) // Oncogene : journal. — 2003. — May (vol. 22, no. 18). — P. 2699—2709. — doi:10.1038/sj.onc.1206374. — PMID 12743594.
- ↑ Hahn S. L., Wasylyk B., Criqui-Filipe P., Criqui P. Modulation of ETS-1 transcriptional activity by huUBC9, a ubiquitin-conjugating enzyme (англ.) // Oncogene : journal. — 1997. — September (vol. 15, no. 12). — P. 1489—1495. — doi:10.1038/sj.onc.1201301. — PMID 9333025.
- ↑ Li R., Pei H., Watson D. K., Papas T. S. EAP1/Daxx interacts with ETS1 and represses transcriptional activation of ETS1 target genes (англ.) // Oncogene : journal. — 2000. — February (vol. 19, no. 6). — P. 745—753. — doi:10.1038/sj.onc.1203385. — PMID 10698492.
Литература
- Bonaldo M. F., Lennon G., Soares M. B. Normalization and subtraction: two approaches to facilitate gene discovery (англ.) // Genome Res. : journal. — 1997. — Vol. 6, no. 9. — P. 791—806. — doi:10.1101/gr.6.9.791. — PMID 8889548.
- Nishihara S., Iwasaki H., Kaneko M. et al. Alpha1,3-fucosyltransferase 9 (FUT9; Fuc-TIX) preferentially fucosylates the distal GlcNAc residue of polylactosamine chain while the other four alpha1,3FUT members preferentially fucosylate the inner GlcNAc residue (англ.) // FEBS Lett.[англ.] : journal. — 2000. — Vol. 462, no. 3. — P. 289—294. — doi:10.1016/S0014-5793(99)01549-5. — PMID 10622713.
- Cailleau-Thomas A., Coullin P., Candelier J. J. et al. FUT4 and FUT9 genes are expressed early in human embryogenesis (англ.) // Glycobiology : journal. — 2000. — Vol. 10, no. 8. — P. 789—802. — doi:10.1093/glycob/10.8.789. — PMID 10929005.
- Nakayama F., Nishihara S., Iwasaki H. et al. CD15 expression in mature granulocytes is determined by alpha 1,3-fucosyltransferase IX, but in promyelocytes and monocytes by alpha 1,3-fucosyltransferase IV (англ.) // J. Biol. Chem. : journal. — 2001. — Vol. 276, no. 19. — P. 16100—16106. — doi:10.1074/jbc.M007272200. — PMID 11278338.
- Roos C., Kolmer M., Mattila P., Renkonen R. Composition of Drosophila melanogaster proteome involved in fucosylated glycan metabolism (англ.) // J. Biol. Chem. : journal. — 2002. — Vol. 277, no. 5. — P. 3168—3175. — doi:10.1074/jbc.M107927200. — PMID 11698403.
- Toivonen S., Nishihara S., Narimatsu H. et al. Fuc-TIX: a versatile alpha1,3-fucosyltransferase with a distinct acceptor- and site-specificity profile (англ.) // Glycobiology : journal. — 2003. — Vol. 12, no. 6. — P. 361—368. — doi:10.1093/glycob/12.6.361. — PMID 12107078.
- Li H., Kong Y., Yan B. [Regulation by ovarian hormones of alpha 1,3-fucosyltransferase gene (FUT9) expression in human endometrium] (англ.) // Sheng Wu Hua Xue Yu Sheng Wu Wu Li Xue Bao : journal. — 2003. — Vol. 34, no. 6. — P. 775—779. — PMID 12417923.
- Strausberg R. L., Feingold E. A., Grouse L. H. et al. Generation and initial analysis of more than 15,000 full-length human and mouse cDNA sequences (англ.) // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America : journal. — 2003. — Vol. 99, no. 26. — P. 16899—16903. — doi:10.1073/pnas.242603899. — PMID 12477932. — PMC 139241.
- Nishihara S., Iwasaki H., Nakajima K. et al. Alpha1,3-fucosyltransferase IX (Fut9) determines Lewis X expression in brain (неопр.) // Glycobiology. — 2004. — Т. 13, № 6. — С. 445—455. — doi:10.1093/glycob/cwg048. — PMID 12626397.
- Mungall A. J., Palmer S. A., Sims S. K. et al. The DNA sequence and analysis of human chromosome 6 (англ.) // Nature : journal. — 2003. — Vol. 425, no. 6960. — P. 805—811. — doi:10.1038/nature02055. — PMID 14574404.
- Gerhard D. S., Wagner L., Feingold E. A. et al. The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC) (англ.) // Genome Res. : journal. — 2004. — Vol. 14, no. 10B. — P. 2121—2127. — doi:10.1101/gr.2596504. — PMID 15489334. — PMC 528928.
- Bogoevska V., Horst A., Klampe B. et al. CEACAM1, an adhesion molecule of human granulocytes, is fucosylated by fucosyltransferase IX and interacts with DC-SIGN of dendritic cells via Lewis x residues (англ.) // Glycobiology : journal. — 2006. — Vol. 16, no. 3. — P. 197—209. — doi:10.1093/glycob/cwj057. — PMID 16282604.