FCRL5 |
---|
|
Идентификаторы |
---|
Псевдонимы | FCRL5, BXMAS1, CD307, CD307e, FCRH5, IRTA2, PRO820, Fc receptor like 5 |
---|
Внешние ID | OMIM: 605877 MGI: 3053558 HomoloGene: 137404 GeneCards: FCRL5 |
---|
|
Расположение гена (Мышь) |
---|
![3-я хромосома мыши](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/0/08/Ideogram_house_mouse_chromosome_3.svg/260px-Ideogram_house_mouse_chromosome_3.svg.png) | Хр. | 3-я хромосома мыши[2] |
---|
| Локус | 3|3 F1 | Начало | 87,343,080 bp[2] |
---|
Конец | 87,407,985 bp[2] |
---|
|
Паттерн экспрессии РНК |
---|
Bgee | Человек | Мышь (ортолог) |
---|
Наибольшая экспрессия в | - mucosa of ileum
- buccal mucosa cell
- epithelium of nasopharynx
|
| | Дополнительные справочные данные |
|
---|
BioGPS | |
---|
|
Ортологи |
---|
Вид | Человек | Мышь |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | |
---|
RefSeq (белок) | | |
---|
Локус (UCSC) | Chr 1: 157.51 – 157.55 Mb | Chr 3: 87.34 – 87.41 Mb |
---|
Поиск по PubMed | Искать[3] | Искать[4] |
---|
|
Информация в Викиданных |
Смотреть (человек) | Смотреть (мышь) |
|
FCRL5 (англ. Fc receptor-like protein 5, Fc-рецептор-подобный белок, тип 5; CD307) — мембранный белок. Продукт гена человека FCRL5[5][6][7].
Функции
FCRL5 участвует в клеточной дифференцировке В-лимфоцитов, иммунном ответе и, возможно, в развитии В-клеточных опухолей.
Структура
Белок FCRL5 состоит из 977 аминокислот, содержит один трансмембранный домен. Молекулярная масса 100 кДа. Внеклеточный участок содержит 1 участок гликозилирования и 8 дисульфидных связей.
Тканевая локализция
Белок экспрессирован на B-клетках маргинальной зоны, иммунобластах, центроцитах герминального центра миндалин и во внутриэпителиальных и межфолликулярных зонах миндалин. Выявляется на многих клетках лимфомы. Изоформы 1, 3, 4 и 5 обнаруживается в лимфатических узлах, селезёнке, костном мозге и тонком кишечнике, причём превалирует 3-я изоформа. Экспрессирован на зрелых В-клетках и на В-клетках памяти.
Примечания
- ↑ 1 2 3 GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000143297 - Ensembl, May 2017
- ↑ 1 2 3 GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000048031 - Ensembl, May 2017
- ↑ Ссылка на публикацию человека на PubMed: (неопр.) Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
- ↑ Ссылка на публикацию мыши на PubMed: (неопр.) Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
- ↑ Nakayama Y., Iwamoto Y., Maher S.E., Tanaka Y., Bothwell A.L. Altered gene expression upon BCR cross-linking in Burkitt's lymphoma B cell line (англ.) // Biochem Biophys Res Commun[англ.] : journal. — 2000. — December (vol. 277, no. 1). — P. 124—127. — doi:10.1006/bbrc.2000.3639. — PMID 11027651.
- ↑ Hatzivassiliou G., Miller I., Takizawa J., Palanisamy N., Rao P.H., Iida S., Tagawa S., Taniwaki M., Russo J., Neri A., Cattoretti G., Clynes R., Mendelsohn C., Chaganti R.S., Dalla-Favera R. IRTA1 and IRTA2, novel immunoglobulin superfamily receptors expressed in B cells and involved in chromosome 1q21 abnormalities in B cell malignancy (англ.) // Immunity : journal. — Cell Press, 2001. — April (vol. 14, no. 3). — P. 277—289. — doi:10.1016/S1074-7613(01)00109-1. — PMID 11290337.
- ↑ Entrez Gene: FCRL5 Fc receptor-like 5 (неопр.).
Литература
- Nakayama Y., Weissman S.M., Bothwell A.L. BXMAS1 identifies a cluster of homologous genes differentially expressed in B cells. (англ.) // Biochem. Biophys. Res. Commun.[англ.] : journal. — 2001. — Vol. 285, no. 3. — P. 830—837. — doi:10.1006/bbrc.2001.5231. — PMID 11453668.
- Davis R.S., Wang Y.H., Kubagawa H., Cooper M.D. Identification of a family of Fc receptor homologs with preferential B cell expression (англ.) // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America : journal. — 2001. — Vol. 98, no. 17. — P. 9772—9777. — doi:10.1073/pnas.171308498. — PMID 11493702. — PMC 55528.
- Miller I., Hatzivassiliou G., Cattoretti G. et al. IRTAs: a new family of immunoglobulinlike receptors differentially expressed in B cells (англ.) // Blood[англ.] : journal. — American Society of Hematology[англ.], 2002. — Vol. 99, no. 8. — P. 2662—2669. — doi:10.1182/blood.V99.8.2662. — PMID 11929751.
- Strausberg R.L., Feingold E.A., Grouse L.H. et al. Generation and initial analysis of more than 15,000 full-length human and mouse cDNA sequences (англ.) // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America : journal. — 2003. — Vol. 99, no. 26. — P. 16899—16903. — doi:10.1073/pnas.242603899. — PMID 12477932. — PMC 139241.
- Clark H.F., Gurney A.L., Abaya E. et al. The Secreted Protein Discovery Initiative (SPDI), a Large-Scale Effort to Identify Novel Human Secreted and Transmembrane Proteins: A Bioinformatics Assessment (англ.) // Genome Res.[англ.] : journal. — 2003. — Vol. 13, no. 10. — P. 2265—2270. — doi:10.1101/gr.1293003. — PMID 12975309. — PMC 403697.
- Gerhard D.S., Wagner L., Feingold E.A. et al. The Status, Quality, and Expansion of the NIH Full-Length cDNA Project: The Mammalian Gene Collection (MGC) (англ.) // Genome Res.[англ.] : journal. — 2004. — Vol. 14, no. 10B. — P. 2121—2127. — doi:10.1101/gr.2596504. — PMID 15489334. — PMC 528928.
- Ise T., Maeda H., Santora K. et al. Immunoglobulin superfamily receptor translocation associated 2 protein on lymphoma cell lines and hairy cell leukemia cells detected by novel monoclonal antibodies (англ.) // Clin. Cancer Res.[англ.] : journal. — 2005. — Vol. 11, no. 1. — P. 87—96. — PMID 15671532.
- Mohan J., Dement-Brown J., Maier S. et al. Epstein-Barr virus nuclear antigen 2 induces FcRH5 expression through CBF1 (англ.) // Blood[англ.] : journal. — American Society of Hematology[англ.], 2006. — Vol. 107, no. 11. — P. 4433—4439. — doi:10.1182/blood-2005-09-3815. — PMID 16439682.
- Ise T., Kreitman R.J., Pastan I., Nagata S. Sandwich ELISAs for soluble immunoglobulin superfamily receptor translocation-associated 2 (IRTA2)/FcRH5 (CD307) proteins in human sera (англ.) // Clin. Chem. Lab. Med.[англ.] : journal. — 2006. — Vol. 44, no. 5. — P. 594—602. — doi:10.1515/CCLM.2006.115. — PMID 16681430.
- Gregory S.G., Barlow K.F., McLay K.E. et al. The DNA sequence and biological annotation of human chromosome 1 (англ.) // Nature : journal. — 2006. — Vol. 441, no. 7091. — P. 315—321. — doi:10.1038/nature04727. — PMID 16710414.
- Taylor A.I., Gould H.J., Sutton B.J., Calvert R.A. The first avian Ig-like Fc receptor family member combines features of mammalian FcR and FCRL (англ.) // Immunogenetics : journal. — 2007. — Vol. 59, no. 4. — P. 323—328. — doi:10.1007/s00251-007-0195-9. — PMID 17273841.
![Перейти к шаблону «Кластеры дифференцировки»](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/c/c9/Wikipedia_interwiki_section_gear_icon.svg/14px-Wikipedia_interwiki_section_gear_icon.svg.png) |
---|
1-50 | - CD1 (a-c, 1A, 1D, 1E)
- CD2
- CD3 (γ, δ, ε)
- CD4
- CD5
- CD6
- CD7
- CD8 (a)
- CD9
- CD10
- CD11 (a, b, c, d)
- CD13
- CD14
- CD15
- CD16 (A, B)
- CD18
- CD19
- CD20
- CD21
- CD22
- CD23
- CD24
- CD25
- CD26
- CD27
- CD28
- CD29
- CD30
- CD31
- CD32 (A, B)
- CD33
- CD34
- CD35
- CD36
- CD37
- CD38
- CD39
- CD40
- CD41
- CD42 (a, b, c, d)
- CD43
- CD44
- CD45
- CD46
- CD47
- CD48
- CD49 (a, b, c, d, e, f)
- CD50
|
---|
51-100 | - CD51
- CD52
- CD53
- CD54
- CD55
- CD56
- CD57
- CD58
- CD59
- CD61
- CD62 (E, L, P)
- CD63
- CD64 (A, B, C)
- CD66 (a, b, c, d, e, f)
- CD68
- CD69
- CD70
- CD71
- CD72
- CD73
- CD74
- CD78
- CD79 (a, b)
- CD80
- CD81
- CD82
- CD83
- CD84
- CD85 (a, d, e, h, j, k)
- CD86
- CD87
- CD88
- CD89
- CD90
- CD91
- CD92
- CD93
- CD94
- CD95
- CD96
- CD97
- CD98
- CD99
- CD100
|
---|
101-150 | |
---|
151-200 | - CD151
- CD152
- CD153
- CD154
- CD155
- CD156 (a, b, c)
- CD157
- CD158 (a, d, e, i, k)
- CD159 (a, c)
- CD160
- CD161
- CD162
- CD163
- CD164
- CD166
- CD167 (a, b)
- CD168
- CD169
- CD170
- CD171
- CD172 (a, b, g)
- CD174
- CD177
- CD178
- CD179 (a, b)
- CD181
- CD182
- CD183
- CD184
- CD185
- CD186
- CD191
- CD192
- CD193
- CD194
- CD195
- CD196
- CD197
- CDw198
- CDw199
- CD200
|
---|
201-250 | |
---|
251-300 | |
---|
301-350 | |
---|
351-400 | |
---|