Ku70

Ku70
Доступные структуры
PDBПоиск ортологов: PDBe RCSB
Список идентификаторов PDB

1JEQ, 1JEY, 1JJR, 3RZX

Идентификаторы
ПсевдонимыXRCC6, X-ray repair complementing defective repair in Chinese hamster cells 6, CTC75, CTCBF, G22P1, KU70, ML8, TLAA, X-ray repair cross complementing 6
Внешние IDOMIM: 152690 MGI: 95606 HomoloGene: 37483 GeneCards: XRCC6
Расположение гена (человек)
22-я хромосома человека
Хр.22-я хромосома человека[1]
22-я хромосома человека
Расположение в геноме XRCC6
Расположение в геноме XRCC6
Локус22q13.2Начало41,621,163 bp[1]
Конец41,664,048 bp[1]
Расположение гена (Мышь)
15-я хромосома мыши
Хр.15-я хромосома мыши[2]
15-я хромосома мыши
Расположение в геноме XRCC6
Расположение в геноме XRCC6
Локус15 E1|15 38.33 cMНачало81,872,036 bp[2]
Конец81,924,286 bp[2]
Паттерн экспрессии РНК
Bgee
ЧеловекМышь (ортолог)
Наибольшая экспрессия в
  • right testis

  • left testis

  • ventricular zone
Наибольшая экспрессия в
  • otic placode

  • saccule

  • otic vesicle

  • neural layer of retina

  • tail of embryo

  • ventricular zone

  • right lobe of liver
Дополнительные справочные данные
BioGPS
н/д
Генная онтология
Молекулярная функция
  • нуклеотид-связывающий
  • double-stranded telomeric DNA binding
  • telomeric DNA binding
  • helicase activity
  • 5'-deoxyribose-5-phosphate lyase activity
  • DNA helicase activity
  • protein C-terminus binding
  • активность катализатора
  • связывание с белками плазмы
  • активность лиазы
  • гидролазная активность
  • АТФ-связанные
  • ДНК-связывающий
  • double-stranded DNA binding
  • damaged DNA binding
  • RNA binding
  • cyclin binding
  • protein-containing complex binding
Компонент клетки
  • цитозоль
  • nuclear telomere cap complex
  • мембрана
  • transcription regulator complex
  • хромосома
  • нуклеоплазма
  • nonhomologous end joining complex
  • клеточное ядро
  • Ku70:Ku80 complex
  • цитоплазма
  • внеклеточная область
  • secretory granule lumen
  • ficolin-1-rich granule lumen
  • protein-DNA complex
  • ядрышко
  • protein-containing complex
Биологический процесс
  • double-strand break repair via classical nonhomologous end joining
  • protein heterotetramerization
  • ДНК-зависимая регуляция транскрипции
  • regulation of smooth muscle cell proliferation
  • транскрипция, ДНК-зависимая
  • cellular response to DNA damage stimulus
  • ДНК-зависимая позитивная регуляция транскрипции
  • DNA ligation
  • establishment of integrated proviral latency
  • метаболизм
  • negative regulation of transcription, DNA-templated
  • double-strand break repair via nonhomologous end joining
  • telomere maintenance
  • positive regulation of type I interferon production
  • положительная регуляция транскрипции РНК полимеразой II промотор
  • DNA duplex unwinding
  • репарация ДНК
  • cellular hyperosmotic salinity response
  • развитие мозга
  • DNA recombination
  • neutrophil degranulation
  • cellular response to gamma radiation
  • cellular response to X-ray
  • positive regulation of protein kinase activity
  • activation of innate immune response
  • immune system process
  • врождённый иммунитет
Источники: Amigo, QuickGO
Ортологи
ВидЧеловекМышь
Entrez

2547

14375

Ensembl

ENSG00000196419

ENSMUSG00000022471

UniProt

P12956

P23475

RefSeq (мРНК)

NM_001469
NM_001288976
NM_001288977
NM_001288978

NM_010247

RefSeq (белок)
NP_001275905
NP_001275906
NP_001275907
NP_001460
NP_001275905.1

NP_001460.1

NP_034377

Локус (UCSC)Chr 22: 41.62 – 41.66 MbChr 15: 81.87 – 81.92 Mb
Поиск по PubMedИскать[3]Искать[4]
Логотип Викиданных Информация в Викиданных
Смотреть (человек)Смотреть (мышь)

Ku70 — белок, в человеческом организме кодируемый геном XRCC6.[5][6]

Функция

Ku70 вместе с белком Ku80 составляют гетеродимерный Ku-белок, который связывается с двуцепочечными разрывами в ДНК и участвует в негомологичном соединении концов цепи (NHEJ — non homologous end joining). Этот белок играет роль также в V(D)J-рекомбинации, процессе, который использует NHEJ для cоздания антигенного разнообразия в иммунной системе млекопитающих.

Ku также необходим для поддержания длины теломер и заглушки субтеломерных участков цепи.[7]

Изначально Ku был найден у больных системной красной волчанкой, в организме которых был обнаружен высокий уровень аутоантител к этому белку.

Старение

Эмбриональные стволовые клетки (ЭСК) мышей, гомозиготные по мутации Ku70-/-, проявляют повышенную чувствительность к ионизирующей радиации по сравнению с гетерозиготными ЭСК (Ku70+/-) или диким типом (Ku70+/+).[8] Мутантные мыши с дефицитом Ku70 представляют собой пример раннего старения организма.[9] Мутантные мыши проявляли некоторые признаки старения в более раннем возрасте по сравнению с диким типом. Эти результаты позволяют предположить, что снижение способности к репарации двухцепочечных повреждений ДНК является причиной преждевременного старения, а нормальное функционирование гена, кодирующего белок Ku70, играет важную роль в целостности клетки.[10]

Номенклатура

Ku70 упоминается под несколькими названиями, в том числе:

  • Аутоантигенный белок р70
  • Субъединица 1, АТФ-зависимой ДНК-хеликазы 2
  • XRCC6 (англ. X- ray repair cross-complementing 6)

Взаимодействия

Ku70 был замечен во многих белок-белковых взаимодействиях: с CBX5, CREBBP, TERF2, NCF4, PCNA и многими другими.


Примечания

  1. 1 2 3 GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000196419 - Ensembl, May 2017
  2. 1 2 3 GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000022471 - Ensembl, May 2017
  3. Ссылка на публикацию человека на PubMed:  (неопр.) Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  4. Ссылка на публикацию мыши на PubMed:  (неопр.) Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  5. Entrez Gene: XRCC6 X-ray repair complementing defective repair in Chinese hamster cells 6 (Ku autoantigen, 70kDa)  (неопр.).
  6. Pace P., Mosedale G., Hodskinson M. R., Rosado I. V., Sivasubramaniam M., Patel K. J. Ku70 corrupts DNA repair in the absence of the Fanconi anemia pathway (англ.) // Science : journal. — 2010. — July (vol. 329, no. 5988). — P. 219—223. — doi:10.1126/science.1192277. — PMID 20538911.
  7. Boulton S. J., Jackson S. P. Components of the Ku-dependent non-homologous end-joining pathway are involved in telomeric length maintenance and telomeric silencing (англ.) // The EMBO Journal : journal. — 1998. — March (vol. 17, no. 6). — P. 1819—1828. — doi:10.1093/emboj/17.6.1819. — PMID 9501103. — PMC 1170529.
  8. Gu Y., Jin S., Gao Y., Weaver D. T., Alt F. W. Ku70-deficient embryonic stem cells have increased ionizing radiosensitivity, defective DNA end-binding activity, and inability to support V(D)J recombination (англ.) // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America : journal. — 1997. — July (vol. 94, no. 15). — P. 8076—8081. — doi:10.1073/pnas.94.15.8076. — PMID 9223317. — PMC 21559.
  9. Li H., Vogel H., Holcomb V. B., Gu Y., Hasty P. Deletion of Ku70, Ku80, or both causes early aging without substantially increased cancer (англ.) // Molecular and Cellular Biology : journal. — 2007. — December (vol. 27, no. 23). — P. 8205—8214. — doi:10.1128/MCB.00785-07. — PMID 17875923. — PMC 2169178.
  10. Bernstein H, Payne CM, Bernstein C, Garewal H, Dvorak K (2008).