PDCD1LG2 |
---|
|
Идентификаторы |
---|
Псевдонимы | PDCD1LG2, B7DC, Btdc, CD273, PD-L2, PDCD1L2, PDL2, bA574F11.2, programmed cell death 1 ligand 2 |
---|
Внешние ID | OMIM: 605723 MGI: 1930125 HomoloGene: 10973 GeneCards: PDCD1LG2 |
---|
|
Расположение гена (Мышь) |
---|
![19-я хромосома мыши](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/8/82/Ideogram_house_mouse_chromosome_19.svg/260px-Ideogram_house_mouse_chromosome_19.svg.png) | Хр. | 19-я хромосома мыши[2] |
---|
| Локус | 19|19 C1 | Начало | 29,388,319 bp[2] |
---|
Конец | 29,448,561 bp[2] |
---|
|
Паттерн экспрессии РНК |
---|
Bgee | Человек | Мышь (ортолог) |
---|
Наибольшая экспрессия в | - stromal cell of endometrium
- upper lobe of left lung
|
| Наибольшая экспрессия в | - lumbar spinal ganglion
- tibiofemoral joint
- skin of abdomen
|
| Дополнительные справочные данные |
|
---|
BioGPS | ![](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/6/61/PBB_GE_PDCD1LG2_220049_s_at_fs.png/250px-PBB_GE_PDCD1LG2_220049_s_at_fs.png) | Дополнительные справочные данные |
|
---|
|
Генная онтология |
---|
Молекулярная функция | - молекулярная функция
- связывание с белками плазмы
| Компонент клетки | - часть мембраны
- внеклеточная область
- система эндомембран
- мембрана
- клеточная мембрана
- наружная сторона клеточной мембраны
- поверхность клетки
| Биологический процесс | - negative regulation of activated T cell proliferation
- T cell costimulation
- negative regulation of interleukin-10 production
- negative regulation of T cell proliferation
- negative regulation of interferon-gamma production
- иммунный ответ
- positive regulation of T cell proliferation
- передача сигнала
- cell surface receptor signaling pathway
- cellular response to lipopolysaccharide
- adaptive immune response
- immune system process
| Источники: Amigo, QuickGO |
|
Ортологи |
---|
Вид | Человек | Мышь |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | |
---|
RefSeq (белок) | | |
---|
Локус (UCSC) | Chr 9: 5.51 – 5.57 Mb | Chr 19: 29.39 – 29.45 Mb |
---|
Поиск по PubMed | Искать[3] | Искать[4] |
---|
|
Информация в Викиданных |
Смотреть (человек) | Смотреть (мышь) |
|
PDCD1LG2 (англ. Programmed cell death 1 ligand 2; CD273) — мембранный белок суперсемейства иммуноглобулинов, продукт гена PDCD1LG2[5][6]. Лиганд рецептора PDCD1. Играет роль в ко-стимулирующем сигнале, критическим для пролиферации T-лимфоцитов и для продукции ими PDCD1-зависимого интерферона-гамма. Взаимодействие белка с PDCD1 ингибирует пролиферацию T-лимфоцитов и синтез цитокинов.
Структура
PDCD1LG2 состоит из 273 аминокислот, молекулярная масса 31 кДа. Белок имеет 5 участков гликозилирования и две дисульфидные связи. Внеклеточный фрагмент содержит два иммуноглобулино-подобных домена: V- и C2-типов. В результате альтернативного сплайсинга образуются 3 изоформы.
Тканевая локализация
Высокий уровень экспрессии белка обнаружен в сердце, плаценте, лёгких и печени, низкий уровень экспрессии представлен также в селезёнке, лимфатических узлах и вилочковой железе.
Примечания
- ↑ 1 2 3 GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000197646 - Ensembl, May 2017
- ↑ 1 2 3 GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000016498 - Ensembl, May 2017
- ↑ Ссылка на публикацию человека на PubMed: (неопр.) Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
- ↑ Ссылка на публикацию мыши на PubMed: (неопр.) Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
- ↑ Latchman Y., Wood C.R., Chernova T., Chaudhary D., Borde M., Chernova I., Iwai Y., Long A.J., Brown J.A., Nunes R., Greenfield E.A., Bourque K., Boussiotis V.A., Carter L.L., Carreno B.M., Malenkovich N., Nishimura H., Okazaki T., Honjo T., Sharpe A.H., Freeman G.J. PD-L2 is a second ligand for PD-1 and inhibits T cell activation (англ.) // Nat Immunol : journal. — 2001. — March (vol. 2, no. 3). — P. 261—268. — doi:10.1038/85330. — PMID 11224527.
- ↑ Entrez Gene: PDCD1LG2 programmed cell death 1 ligand 2 (неопр.).
Литература
- Tseng S.Y., Otsuji M., Gorski K., etal. B7-DC, a new dendritic cell molecule with potent costimulatory properties for T cells. (англ.) // Journal of Experimental Medicine[англ.] : journal. — Rockefeller University Press[англ.], 2001. — Vol. 193, no. 7. — P. 839—846. — doi:10.1084/jem.193.7.839. — PMID 11283156. — PMC 2193370.
- Strausberg R.L., Feingold E.A., Grouse L.H., etal. Generation and initial analysis of more than 15,000 full-length human and mouse cDNA sequences. (англ.) // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America : journal. — 2003. — Vol. 99, no. 26. — P. 16899—16903. — doi:10.1073/pnas.242603899. — PMID 12477932. — PMC 139241.
- Brown J.A., Dorfman D.M., Ma F.R., etal. Blockade of programmed death-1 ligands on dendritic cells enhances T cell activation and cytokine production. (англ.) // J. Immunol.[англ.] : journal. — 2003. — Vol. 170, no. 3. — P. 1257—1266. — doi:10.4049/jimmunol.170.3.1257. — PMID 12538684.
- Youngnak P., Kozono Y., Kozono H., etal. Differential binding properties of B7-H1 and B7-DC to programmed death-1. (англ.) // Biochem. Biophys. Res. Commun.[англ.] : journal. — 2003. — Vol. 307, no. 3. — P. 672—677. — doi:10.1016/S0006-291X(03)01257-9. — PMID 12893276.
- Tsushima F., Iwai H., Otsuki N., etal. Preferential contribution of B7-H1 to programmed death-1-mediated regulation of hapten-specific allergic inflammatory responses. (англ.) // Eur. J. Immunol.[англ.] : journal. — 2003. — Vol. 33, no. 10. — P. 2773—2782. — doi:10.1002/eji.200324084. — PMID 14515261.
- Ota T., Suzuki Y., Nishikawa T., etal. Complete sequencing and characterization of 21,243 full-length human cDNAs. (англ.) // Nat. Genet. : journal. — 2004. — Vol. 36, no. 1. — P. 40—5. — doi:10.1038/ng1285. — PMID 14702039.
- Aramaki O., Shirasugi N., Takayama T., etal. Programmed death-1-programmed death-L1 interaction is essential for induction of regulatory cells by intratracheal delivery of alloantigen. (англ.) // Transplantation : journal. — 2004. — Vol. 77, no. 1. — P. 6—12. — doi:10.1097/01.TP.0000108637.65091.4B. — PMID 14724428.
- Humphray S.J., Oliver K., Hunt A.R., etal. DNA sequence and analysis of human chromosome 9. (англ.) // Nature. — 2004. — Vol. 429, no. 6990. — P. 369—374. — doi:10.1038/nature02465. — PMID 15164053. — PMC 2734081.
- He X.H., Liu Y., Xu L.H., Zeng Y.Y. Cloning and identification of two novel splice variants of human PD-L2. (англ.) // Acta Biochim. Biophys. Sin. (Shanghai)[англ.] : journal. — 2004. — Vol. 36, no. 4. — P. 284—289. — doi:10.1093/abbs/36.4.284. — PMID 15253154.
- Zhang Z., Henzel W.J. Signal peptide prediction based on analysis of experimentally verified cleavage sites. (англ.) // Protein Sci.[англ.] : journal. — 2005. — Vol. 13, no. 10. — P. 2819—2824. — doi:10.1110/ps.04682504. — PMID 15340161. — PMC 2286551.
- Gerhard D.S., Wagner L., Feingold E.A., etal. The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). (англ.) // Genome Res.[англ.] : journal. — 2004. — Vol. 14, no. 10B. — P. 2121—2127. — doi:10.1101/gr.2596504. — PMID 15489334. — PMC 528928.
- Ohigashi Y., Sho M., Yamada Y., etal. Clinical significance of programmed death-1 ligand-1 and programmed death-1 ligand-2 expression in human esophageal cancer. (англ.) // Clin. Cancer Res.[англ.] : journal. — 2005. — Vol. 11, no. 8. — P. 2947—2953. — doi:10.1158/1078-0432.CCR-04-1469. — PMID 15837746.
- Saunders P.A., Hendrycks V.R., Lidinsky W.A., Woods M.L. PD-L2:PD-1 involvement in T cell proliferation, cytokine production, and integrin-mediated adhesion. (англ.) // Eur. J. Immunol.[англ.] : journal. — 2006. — Vol. 35, no. 12. — P. 3561—3569. — doi:10.1002/eji.200526347. — PMID 16278812.
- Pfistershammer K., Klauser C., Pickl W.F., etal. No evidence for dualism in function and receptors: PD-L2/B7-DC is an inhibitory regulator of human T cell activation. (англ.) // Eur. J. Immunol.[англ.] : journal. — 2006. — Vol. 36, no. 5. — P. 1104—1113. — doi:10.1002/eji.200535344. — PMID 16598819. — PMC 2975063.
- Abelson A.K., Johansson C.M., Kozyrev S.V., etal. No evidence of association between genetic variants of the PDCD1 ligands and SLE. (англ.) // Genes Immun.[англ.] : journal. — 2007. — Vol. 8, no. 1. — P. 69—74. — doi:10.1038/sj.gene.6364360. — PMID 17136123.
- Mataki N., Kikuchi K., Kawai T., etal. Expression of PD-1, PD-L1, and PD-L2 in the liver in autoimmune liver diseases. (англ.) // Am. J. Gastroenterol.[англ.] : journal. — 2007. — Vol. 102, no. 2. — P. 302—312. — doi:10.1111/j.1572-0241.2006.00948.x. — PMID 17311651.
- Wang S.C., Lin C.H., Ou T.T., etal. Ligands for programmed cell death 1 gene in patients with systemic lupus erythematosus. (англ.) // J. Rheumatol.[англ.] : journal. — 2007. — Vol. 34, no. 4. — P. 721—725. — doi:10.1093/rheumatology/34.8.721. — PMID 17343323.
![Перейти к шаблону «Кластеры дифференцировки»](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/c/c9/Wikipedia_interwiki_section_gear_icon.svg/14px-Wikipedia_interwiki_section_gear_icon.svg.png) |
---|
1-50 | - CD1 (a-c, 1A, 1D, 1E)
- CD2
- CD3 (γ, δ, ε)
- CD4
- CD5
- CD6
- CD7
- CD8 (a)
- CD9
- CD10
- CD11 (a, b, c, d)
- CD13
- CD14
- CD15
- CD16 (A, B)
- CD18
- CD19
- CD20
- CD21
- CD22
- CD23
- CD24
- CD25
- CD26
- CD27
- CD28
- CD29
- CD30
- CD31
- CD32 (A, B)
- CD33
- CD34
- CD35
- CD36
- CD37
- CD38
- CD39
- CD40
- CD41
- CD42 (a, b, c, d)
- CD43
- CD44
- CD45
- CD46
- CD47
- CD48
- CD49 (a, b, c, d, e, f)
- CD50
|
---|
51-100 | - CD51
- CD52
- CD53
- CD54
- CD55
- CD56
- CD57
- CD58
- CD59
- CD61
- CD62 (E, L, P)
- CD63
- CD64 (A, B, C)
- CD66 (a, b, c, d, e, f)
- CD68
- CD69
- CD70
- CD71
- CD72
- CD73
- CD74
- CD78
- CD79 (a, b)
- CD80
- CD81
- CD82
- CD83
- CD84
- CD85 (a, d, e, h, j, k)
- CD86
- CD87
- CD88
- CD89
- CD90
- CD91
- CD92
- CD93
- CD94
- CD95
- CD96
- CD97
- CD98
- CD99
- CD100
|
---|
101-150 | |
---|
151-200 | - CD151
- CD152
- CD153
- CD154
- CD155
- CD156 (a, b, c)
- CD157
- CD158 (a, d, e, i, k)
- CD159 (a, c)
- CD160
- CD161
- CD162
- CD163
- CD164
- CD166
- CD167 (a, b)
- CD168
- CD169
- CD170
- CD171
- CD172 (a, b, g)
- CD174
- CD177
- CD178
- CD179 (a, b)
- CD181
- CD182
- CD183
- CD184
- CD185
- CD186
- CD191
- CD192
- CD193
- CD194
- CD195
- CD196
- CD197
- CDw198
- CDw199
- CD200
|
---|
201-250 | |
---|
251-300 | |
---|
301-350 | |
---|
351-400 | |
---|