POLR2J

Полипептид J РНК-полимеразы II (управляемой ДНК), 13.3kDa
Идентификаторы
Символ POLR2J ; POLR2J1; RPB11; RPB11A; RPB11m; hRPB14
Внешние ID OMIM: 604150 MGI: 109582 HomoloGene: 4542 GeneCards: Ген POLR2J
номер EC 2.7.7.6
Функция • RNA polymerase II activity

• DNA binding
• DNA-directed RNA polymerase activity
• protein binding
• LRR domain binding

• protein dimerization activity
Компонент клетки • nucleus

• nucleoplasm

• DNA-directed RNA polymerase II, core complex
Биологический процесс • mRNA splicing, via spliceosome

• DNA repair
• transcription-coupled nucleotide-excision repair
• nucleotide-excision repair
• transcription from RNA polymerase II promoter
• transcription initiation from RNA polymerase II promoter
• transcription elongation from RNA polymerase II promoter
• 7-methylguanosine mRNA capping
• RNA splicing
• gene expression
• viral process

• positive regulation of viral transcription
Источники: Amigo / QuickGO
Профиль экспрессии РНК
Больше информации
Ортологи
Вид Человек Мышь
Entrez 5439 20022
Ensembl ENSG00000005075 ENSMUSG00000039771
UniProt P52435 O08740
RefSeq (мРНК) NM_006234 NM_011293
RefSeq (белок) NP_006225 NP_035423
Локус (UCSC) Chr 7:
102.11 – 102.12 Mb		 Chr 5:
136.12 – 136.12 Mb
Поиск в PubMed Искать Искать

Субъединица RPB11 ДНК-управляемой РНК-полимеразы II  — фермент, кодируемый у человека геном POLR2J .

Функция

Этот ген кодирует субъединицу РНК-полимеразы II, полимеразы, ответственной за синтез РНК у эукариот. Продукт этого гена существует в виде гетеродимера с другими полимеразными субъединицами; вместе они образуют основной блок полимеразы. Два аналогичных гена расположены рядом на хромосоме 7q22.1 и псевдоген находится на хромосоме 7p13.[1]

Взаимодействия

POLR2J, как было выявлено, взаимодействуют с:

  • Apoptosis antagonizing transcription factor[англ.],[2]
  • POLR2C,[3][4]
  • SATB1.[5]

Примечания

  1. ↑ Entrez Gene: POLR2J polymerase (RNA) II (DNA directed) polypeptide J, 13.3kDa  (неопр.).
  2. ↑ Fanciulli M., Bruno T., Di Padova M., De Angelis R., Iezzi S., Iacobini C., Floridi A., Passananti C. Identification of a novel partner of RNA polymerase II subunit 11, Che-1, which interacts with and affects the growth suppression function of Rb (англ.) // FASEB Journal[англ.] : journal. — 2000. — May (vol. 14, no. 7). — P. 904—912. — PMID 10783144.
  3. ↑ Acker J., de Graaff M., Cheynel I., Khazak V., Kedinger C., Vigneron M. Interactions between the human RNA polymerase II subunits (англ.) // Journal of Biological Chemistry : journal. — 1997. — July (vol. 272, no. 27). — P. 16815—16821. — doi:10.1074/jbc.272.27.16815. — PMID 9201987.
  4. ↑ Corbi N., Di Padova M., De Angelis R., Bruno T., Libri V., Iezzi S., Floridi A., Fanciulli M., Passananti C. The alpha-like RNA polymerase II core subunit 3 (RPB3) is involved in tissue-specific transcription and muscle differentiation via interaction with the myogenic factor myogenin (англ.) // FASEB Journal[англ.] : journal. — 2002. — October (vol. 16, no. 12). — P. 1639—1641. — doi:10.1096/fj.02-0123fje. — PMID 12207009.
  5. ↑ Durrin L.K., Krontiris T.G. The thymocyte-specific MAR binding protein, SATB1, interacts in vitro with a novel variant of DNA-directed RNA polymerase II, subunit 11 (англ.) // Genomics : journal. — 2002. — June (vol. 79, no. 6). — P. 809—817. — doi:10.1006/geno.2002.6772. — PMID 12036295.

Литература

  • Jeang K.T. Tat, Tat-associated kinase, and transcription. (англ.) // Journal of Biomedical Science[англ.] : journal. — 1998. — Vol. 5, no. 1. — P. 24—7. — doi:10.1007/BF02253352. — PMID 9570510.
  • Yankulov K., Bentley D. Transcriptional control: Tat cofactors and transcriptional elongation. (англ.) // Current Biology : journal. — Cell Press, 1998. — Vol. 8, no. 13. — P. R447—9. — doi:10.1016/S0960-9822(98)70289-1. — PMID 9651670.
  • Romano G., Kasten M., De Falco G., Micheli P., Khalili K., Giordano A. Regulatory functions of Cdk9 and of cyclin T1 in HIV tat transactivation pathway gene expression. (англ.) // Journal of Cellular Biochemistry[англ.] : journal. — 2000. — Vol. 75, no. 3. — P. 357—368. — doi:10.1002/(SICI)1097-4644(19991201)75:3<357::AID-JCB1>3.0.CO;2-K. — PMID 10536359.
  • Marcello A., Zoppé M., Giacca M. Multiple modes of transcriptional regulation by the HIV-1 Tat transactivator. (англ.) // IUBMB Life : journal. — 2002. — Vol. 51, no. 3. — P. 175—181. — doi:10.1080/152165401753544241. — PMID 11547919.
  • Stevens M., De Clercq E., Balzarini J. The regulation of HIV-1 transcription: molecular targets for chemotherapeutic intervention. (англ.) // Med Res Rev : journal. — 2007. — Vol. 26, no. 5. — P. 595—625. — doi:10.1002/med.20081. — PMID 16838299.
  • Harrich D., McMillan N., Munoz L., Apolloni A., Meredith L. Will diverse Tat interactions lead to novel antiretroviral drug targets? (англ.) // Current drug targets : journal. — 2007. — Vol. 7, no. 12. — P. 1595—1606. — doi:10.2174/138945006779025338. — PMID 17168834.
  • Kato H., Sumimoto H., Pognonec P., Chen C.H., Rosen C.A., Roeder R.G. HIV-1 Tat acts as a processivity factor in vitro in conjunction with cellular elongation factors. (англ.) // Genes & Development : journal. — 1992. — Vol. 6, no. 4. — P. 655—666. — doi:10.1101/gad.6.4.655. — PMID 1559613.
  • Southgate C., Zapp M.L., Green M.R. Activation of transcription by HIV-1 Tat protein tethered to nascent RNA through another protein. (англ.) // Nature : journal. — 1990. — Vol. 345, no. 6276. — P. 640—642. — doi:10.1038/345640a0. — PMID 2190099.
  • Wu-Baer F., Sigman D., Gaynor R.B. Specific binding of RNA polymerase II to the human immunodeficiency virus trans-activating region RNA is regulated by cellular cofactors and Tat (англ.) // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America : journal. — 1995. — Vol. 92, no. 16. — P. 7153—7157. — doi:10.1073/pnas.92.16.7153. — PMID 7638159. — PMC 41297.
  • Herrmann C.H., Rice A.P. Lentivirus Tat proteins specifically associate with a cellular protein kinase, TAK, that hyperphosphorylates the carboxyl-terminal domain of the large subunit of RNA polymerase II: candidate for a Tat cofactor (англ.) // Journal of Virology[англ.] : journal. — 1995. — Vol. 69, no. 3. — P. 1612—1620. — PMID 7853496. — PMC 188757.
  • Keen N.J., Gait M.J., Karn J. Human immunodeficiency virus type-1 Tat is an integral component of the activated transcription-elongation complex (англ.) // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America : journal. — 1996. — Vol. 93, no. 6. — P. 2505—2510. — doi:10.1073/pnas.93.6.2505. — PMID 8637904. — PMC 39827.
  • Yang X., Herrmann C.H., Rice A.P. The human immunodeficiency virus Tat proteins specifically associate with TAK in vivo and require the carboxyl-terminal domain of RNA polymerase II for function (англ.) // Journal of Virology[англ.] : journal. — 1996. — Vol. 70, no. 7. — P. 4576—4584. — PMID 8676484. — PMC 190394.
  • Fanciulli M., Bruno T., Cerboni C., Bonetto F., Iacobini C., Frati L., Piccoli M., Floridi A., Santoni A., Punturieri A. Cloning of a novel human RNA polymerase II subunit downregulated by doxorubicin: new potential mechanisms of drug related toxicity (англ.) // FEBS Letters[англ.] : journal. — 1996. — Vol. 384, no. 1. — P. 48—52. — doi:10.1016/0014-5793(96)00277-3. — PMID 8797801.
  • Agostini I., Navarro J.M., Rey F., Bouhamdan M., Spire B., Vigne R., Sire J. The human immunodeficiency virus type 1 Vpr transactivator: cooperation with promoter-bound activator domains and binding to TFIIB (англ.) // Journal of Molecular Biology[англ.] : journal. — 1996. — Vol. 261, no. 5. — P. 599—606. — doi:10.1006/jmbi.1996.0485. — PMID 8800208.
  • Zhou Q., Sharp P.A. Tat-SF1: cofactor for stimulation of transcriptional elongation by HIV-1 Tat (англ.) // Science : journal. — 1996. — Vol. 274, no. 5287. — P. 605—610. — doi:10.1126/science.274.5287.605. — PMID 8849451.
  • Okamoto H., Sheline C.T., Corden J.L., Jones K.A., Peterlin B.M. Trans-activation by human immunodeficiency virus Tat protein requires the C-terminal domain of RNA polymerase II (англ.) // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America : journal. — 1996. — Vol. 93, no. 21. — P. 11575—11579. — doi:10.1073/pnas.93.21.11575. — PMID 8876177. — PMC 38099.
  • Chun R.F., Jeang K.T. Requirements for RNA polymerase II carboxyl-terminal domain for activated transcription of human retroviruses human T-cell lymphotropic virus I and HIV-1 (англ.) // Journal of Biological Chemistry : journal. — 1996. — Vol. 271, no. 44. — P. 27888—27894. — doi:10.1074/jbc.271.44.27888. — PMID 8910388.
  • Parada C.A., Roeder R.G. Enhanced processivity of RNA polymerase II triggered by Tat-induced phosphorylation of its carboxy-terminal domain (англ.) // Nature : journal. — 1996. — Vol. 384, no. 6607. — P. 375—378. — doi:10.1038/384375a0. — PMID 8934526.
  • García-Martínez L.F., Ivanov D., Gaynor R.B. Association of Tat with purified HIV-1 and HIV-2 transcription preinitiation complexes (англ.) // Journal of Biological Chemistry : journal. — 1997. — Vol. 272, no. 11. — P. 6951—6958. — doi:10.1074/jbc.272.11.6951. — PMID 9054383.
  • Cujec T.P., Cho H., Maldonado E., Meyer J., Reinberg D., Peterlin B.M. The human immunodeficiency virus transactivator Tat interacts with the RNA polymerase II holoenzyme (англ.) // Molecular and Cellular Biology : journal. — 1997. — Vol. 17, no. 4. — P. 1817—1823. — PMID 9121429. — PMC 232028.