SIGLEC5 |
---|
![](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/d/db/Protein_SIGLEC5_PDB_2ZG1.png/250px-Protein_SIGLEC5_PDB_2ZG1.png) |
Доступные структуры |
---|
PDB | Поиск по базе UniProt: PDBe RCSB |
---|
Список идентификаторов PDB |
---|
2ZG1, 2ZG2, 2ZG3 |
|
|
Идентификаторы |
---|
Псевдонимы | SIGLEC5, CD170, CD33L2, OB-BP2, OBBP2, SIGLEC-5, sialic acid binding Ig like lectin 5 |
---|
Внешние ID | OMIM: 604200 HomoloGene: 55783 GeneCards: SIGLEC5 |
---|
|
|
Генная онтология |
---|
Молекулярная функция | - связывание углеводов
- связывание с белками плазмы
| Компонент клетки | - часть мембраны
- мембрана
- клеточная мембрана
- secretory granule membrane
- tertiary granule membrane
- ficolin-1-rich granule membrane
| Биологический процесс | - агрегация клеток
- neutrophil degranulation
| Источники: Amigo, QuickGO |
|
Ортологи |
---|
Вид | Человек | Мышь |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | |
---|
NM_003830 NM_001384708 NM_001384709 |
| |
---|
RefSeq (белок) | | |
---|
Локус (UCSC) | Chr 19: 51.61 – 51.63 Mb | н/д |
---|
Поиск по PubMed | Искать[2] | н/д |
---|
|
Информация в Викиданных |
|
SIGLEC5 (Sialic acid-binding Ig-like lectin 5; Ig-подобный лектин 5, связывающий сиаловую кислоту; CD170) — белок, молекула клеточной адгезии. Взаимодействует с сиаловыми кислотами. Продукт гена человека SIGLEC1[3][4].
Локализация
Экспрессирован на моноцитах и нейтрофилах. Особенно высокая экспрессия обнаружена на клетках периферической крови, селезёнки и костного мозга, присутствует также на миелоидных клетках в лимфатических узлах, лёгких, аппендиксе, плаценте, поджелудочной железе и тимусе. SIGLEC1 отсутствует на лейкемических клетках, представляющих ранние этапы миеломоноцитической дифференцировки.
Литература
- Maruyama K., Sugano S. Oligo-capping: a simple method to replace the cap structure of eukaryotic mRNAs with oligoribonucleotides (англ.) // Gene[англ.] : journal. — Elsevier, 1994. — Vol. 138, no. 1—2. — P. 171—174. — doi:10.1016/0378-1119(94)90802-8. — PMID 8125298.
- Suzuki Y., Yoshitomo-Nakagawa K., Maruyama K., etal. Construction and characterization of a full length-enriched and a 5'-end-enriched cDNA library (англ.) // Gene[англ.] : journal. — Elsevier, 1997. — Vol. 200, no. 1—2. — P. 149—156. — doi:10.1016/S0378-1119(97)00411-3. — PMID 9373149.
- Cornish A. L., Freeman S., Forbes G., etal. Characterization of siglec-5, a novel glycoprotein expressed on myeloid cells related to CD33 (англ.) // Blood[англ.] : journal. — American Society of Hematology[англ.], 1998. — Vol. 92, no. 6. — P. 2123—2132. — PMID 9731071.
- Patel N., Brinkman-Van der Linden E. C., Altmann S. W., etal. OB-BP1/Siglec-6. A leptin- and sialic acid-binding protein of the immunoglobulin superfamily (англ.) // J. Biol. Chem. : journal. — 1999. — Vol. 274, no. 32. — P. 22729—22738. — doi:10.1074/jbc.274.32.22729. — PMID 10428856.
- Yousef G. M., Ordon M. H., Foussias G., Diamandis E. P. Genomic organization of the siglec gene locus on chromosome 19q13.4 and cloning of two new siglec pseudogenes (англ.) // Gene[англ.] : journal. — Elsevier, 2002. — Vol. 286, no. 2. — P. 259—270. — doi:10.1016/S0378-1119(02)00432-8. — PMID 11943481.
- Strausberg R. L., Feingold E. A., Grouse L. H., etal. Generation and initial analysis of more than 15,000 full-length human and mouse cDNA sequences (англ.) // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America : journal. — 2003. — Vol. 99, no. 26. — P. 16899—16903. — doi:10.1073/pnas.242603899. — PMID 12477932. — PMC 139241.
- Erickson-Miller C. L., Freeman S. D., Hopson C. B., etal. Characterization of Siglec-5 (CD170) expression and functional activity of anti-Siglec-5 antibodies on human phagocytes (англ.) // Exp. Hematol.[англ.] : journal. — 2003. — Vol. 31, no. 5. — P. 382—388. — doi:10.1016/S0301-472X(03)00046-8. — PMID 12763136.
- Grimwood J., Gordon L. A., Olsen A., etal. The DNA sequence and biology of human chromosome 19 (англ.) // Nature : journal. — 2004. — Vol. 428, no. 6982. — P. 529—535. — doi:10.1038/nature02399. — PMID 15057824.
- Gerhard D. S., Wagner L., Feingold E. A., etal. The Status, Quality, and Expansion of the NIH Full-Length cDNA Project: The Mammalian Gene Collection (MGC) (англ.) // Genome Res.[англ.] : journal. — 2004. — Vol. 14, no. 10B. — P. 2121—2127. — doi:10.1101/gr.2596504. — PMID 15489334. — PMC 528928.
- Avril T., Freeman S. D., Attrill H., etal. Siglec-5 (CD170) can mediate inhibitory signaling in the absence of immunoreceptor tyrosine-based inhibitory motif phosphorylation (англ.) // J. Biol. Chem. : journal. — 2005. — Vol. 280, no. 20. — P. 19843—19851. — doi:10.1074/jbc.M502041200. — PMID 15769739.
- Rual J. F., Venkatesan K., Hao T., etal. Towards a proteome-scale map of the human protein-protein interaction network (англ.) // Nature : journal. — 2005. — Vol. 437, no. 7062. — P. 1173—1178. — doi:10.1038/nature04209. — PMID 16189514.
- Rapoport E. M., Pazynina G. V., Sablina M. A., etal. Probing sialic acid binding Ig-like lectins (siglecs) with sulfated oligosaccharides (англ.) // Biochemistry Mosc.[англ.] : journal. — 2006. — Vol. 71, no. 5. — P. 496—504. — doi:10.1134/S0006297906050051. — PMID 16732727.
- Biedermann B., Gil D., Bowen D. T., Crocker P. R. Analysis of the CD33-related siglec family reveals that Siglec-9 is an endocytic receptor expressed on subsets of acute myeloid leukemia cells and absent from normal hematopoietic progenitors (англ.) // Leuk. Res.[англ.] : journal. — 2007. — Vol. 31, no. 2. — P. 211—220. — doi:10.1016/j.leukres.2006.05.026. — PMID 16828866.
- Angata T., Hayakawa T., Yamanaka M., etal. Discovery of Siglec-14, a novel sialic acid receptor undergoing concerted evolution with Siglec-5 in primates (англ.) // The FASEB Journal[англ.] : journal. — Federation of American Societies for Experimental Biology[англ.], 2006. — Vol. 20, no. 12. — P. 1964—1973. — doi:10.1096/fj.06-5800com. — PMID 17012248.
- Zhuravleva M. A., Trandem K., Sun P. D. STRUCTURAL IMPLICATIONS OF SIGLEC-5 MEDIATED SIALO-GLYCAN RECOGNITION (нем.) // J. Mol. Biol.[англ.] : magazin. — 2007. — Bd. 375, Nr. 2. — S. 437—447. — doi:10.1016/j.jmb.2007.10.009. — PMID 18022638. — PMC 2245879.
Примечания
- ↑ 1 2 3 GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000268500 - Ensembl, May 2017
- ↑ Ссылка на публикацию человека на PubMed: (неопр.) Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
- ↑ Kim H. S. Assignment of the human OB binding protein-2 gene (CD33L2) to chromosome 19q13.3 by radiation hybrid mapping (англ.) // Cytogenetic and Genome Research[англ.] : journal. — Karger Publishers[англ.], 1999. — June (vol. 84, no. 1—2). — P. 96. — doi:10.1159/000015227. — PMID 10343116.
- ↑ Entrez Gene: SIGLEC5 sialic acid binding Ig-like lectin 5 (неопр.).
![Перейти к шаблону «Кластеры дифференцировки»](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/c/c9/Wikipedia_interwiki_section_gear_icon.svg/14px-Wikipedia_interwiki_section_gear_icon.svg.png) |
---|
1-50 | - CD1 (a-c, 1A, 1D, 1E)
- CD2
- CD3 (γ, δ, ε)
- CD4
- CD5
- CD6
- CD7
- CD8 (a)
- CD9
- CD10
- CD11 (a, b, c, d)
- CD13
- CD14
- CD15
- CD16 (A, B)
- CD18
- CD19
- CD20
- CD21
- CD22
- CD23
- CD24
- CD25
- CD26
- CD27
- CD28
- CD29
- CD30
- CD31
- CD32 (A, B)
- CD33
- CD34
- CD35
- CD36
- CD37
- CD38
- CD39
- CD40
- CD41
- CD42 (a, b, c, d)
- CD43
- CD44
- CD45
- CD46
- CD47
- CD48
- CD49 (a, b, c, d, e, f)
- CD50
|
---|
51-100 | - CD51
- CD52
- CD53
- CD54
- CD55
- CD56
- CD57
- CD58
- CD59
- CD61
- CD62 (E, L, P)
- CD63
- CD64 (A, B, C)
- CD66 (a, b, c, d, e, f)
- CD68
- CD69
- CD70
- CD71
- CD72
- CD73
- CD74
- CD78
- CD79 (a, b)
- CD80
- CD81
- CD82
- CD83
- CD84
- CD85 (a, d, e, h, j, k)
- CD86
- CD87
- CD88
- CD89
- CD90
- CD91
- CD92
- CD93
- CD94
- CD95
- CD96
- CD97
- CD98
- CD99
- CD100
|
---|
101-150 | |
---|
151-200 | - CD151
- CD152
- CD153
- CD154
- CD155
- CD156 (a, b, c)
- CD157
- CD158 (a, d, e, i, k)
- CD159 (a, c)
- CD160
- CD161
- CD162
- CD163
- CD164
- CD166
- CD167 (a, b)
- CD168
- CD169
- CD170
- CD171
- CD172 (a, b, g)
- CD174
- CD177
- CD178
- CD179 (a, b)
- CD181
- CD182
- CD183
- CD184
- CD185
- CD186
- CD191
- CD192
- CD193
- CD194
- CD195
- CD196
- CD197
- CDw198
- CDw199
- CD200
|
---|
201-250 | |
---|
251-300 | |
---|
301-350 | |
---|
351-400 | |
---|