Protein kodiran ovim genom je član NR1 potfamilije nuklearnih hormonskih receptora. On može biti vezan kao monomer ili homodimer za elemente hormonskog odgovora uzvodno od nekoliko gena da bi pojačao ekspresiju tih gena. Specifične funkcije ovog proteina su nepoznate, ali je bilo pokazano da ima interakciju sa NM23-2, nukleozid difosfat kinazom koja učestvuje u organogenezi i diferencijaciji, kao i sa NM23-1, produktom tumor metastaznog supresor kandidatnog gena. Četiri transkriptne varijante koje kodiraju različite izoforme su bile opisane za ovaj gen.[1]
Za RAR-srodni orfan receptor alfa je pokazano da uspostavlja interakciju sa EP300[2] i NME1.[3]
(1) Osnovni domeni |
---|
| Aktivirajući transkripcioni faktor (AATF, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7) • AP-1 (c-Fos, FOSB, FOSL1, FOSL2, c-Jun, JUNB, JUND) • BACH (1, 2) • BATF • BLZF1 • C/EBP (α, β, γ, δ, ε, ζ) • CREB (1, 3, L1) • CREM • DBP • DDIT3 • GABPA • HLF • MAF (B, F, G, K) • NFE (2, L1, L2) • NFIL3 • NRL • NRF1 • XBP1 |
---|
(1.2) Osnovni heliks-petlja-heliks (bHLH) | ATOH1 • AhR • AHRR • ARNT • ASCL1 • BHLHB2 • BMAL (ARNTL, ARNTL2) • CLOCK • EPAS1 • HAND (1, 2) • HES (5, 6) • HEY (1, 2, L) • HES1 • HIF (1A, 3A) • ID (1, 2, 3, 4) • LYL1 • MXD4 • MYCL1 • MYCN • Myogenic regulatorni faktori (MyoD, Myogenin, MYF5, MYF6) • Neurogenini (1, 2, 3) • NeuroD (1, 2) • NPAS (1, 2, 3) • OLIG (1, 2) • Pho4 • Scleraxis • TAL (1, 2) • Twist • USF1 |
---|
(1.3) bHLH-ZIP | AP-4 • MAX • MITF • MNT • MLX • MXI1 • Myc • SREBP (1, 2) |
---|
(1.4) NF-1 | NFI (A, B, C, X) • SMAD (R-SMAD (1, 2, 3, 5, 9) - I-SMAD (6, 7) - 4) |
---|
(1.5) RF-X | RFX (1, 2, 3, 4, 5, ANK) |
---|
(1.6) Osnovni heliks-razmak-heliks (bHSH) | AP-2 (α, β, γ, δ, ε) |
---|
|
|
|
---|
(2.1) Nuklearni receptor (Cys4) | podfamilija 1 (Tiroidni hormon (α, β), CAR, FXR, LXR (α, β), PPAR (α, β/δ, γ), PXR, RAR ( α, β, γ), ROR (α, β, γ), Rev-ErbA (α, β), VDR) podfamilija 2 (COUP-TF (I, II), Ear-2, HNF4 (α, γ), PNR, RXR (α, β, γ), Testikularni receptor (2, 4), TLX) podfamilija 3 (Steroidni hormon (Androgen, Estrogen (α, β), Glukokortikoid, Mineralokortikoid, Progesteron), Estrogen-vezani (α, β, γ)) podfamilija 4 NUR (NGFIB, NOR1, NURR1) • podfamilija 5 (LRH-1, SF1) • podfamilija 6 (GCNF) • podfamilija 0 (DAX1, SHP) |
---|
(2.2) Drugi Cys4 | GATA (1, 2, 3, 4, 5, 6) • MTA (1, 2, 3) • TRPS1 |
---|
(2.3) Cys2His2 | Generalni transkripcioni faktori (TFIIA, TFIIB, TFIID, TFIIE, TFIIF (1, 2), TFIIH (1, 2, 4, 2I, 3A, 3C1, 3C2)) ATBF1 • BCL (6, 11A, 11B) • CTCF • E4F1 • EGR (2, 3) • ERV3 • GFI1 • GLI-Kruppel familija (1, 2, 3, REST, S2, YY1) • HIC (1, 2) • HIVEP (1, 2, 3) • IKZF (1, 2, 3) • ILF (2, 3) • KLF (2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 17) • MTF1 • MYT1 • OSR1 • SP (1, 2, 4, 7) • WT1 • Zbtb7 (7A, 7B) • ZBTB (16, 17, 20, 32, 33, 40) • cink prst (3, 7, 9, 10, 19, 22, 24, 33B, 34, 35, 41, 43, 44, 51, 74, 143, 146, 148, 165, 202, 217, 219, 238, 239, 259, 267, 268, 281, 295, 318, 330, 346, 350, 365, 366, 384, 423, 451, 452, 471, 593, 638, 649, 655) |
---|
(2.4) Cys6 | HIVEP1 |
---|
(2.5) Naizmenična kompozicija | AIRE • DIDO1 • GRLF1 • ING (1, 2, 4) • JARID (1A, 1B, 1C, 1D, 2) • JMJD1B |
---|
|
|
|
---|
(3.1) Homeodomen | ARX • CDX (1, 2) • CRX • CUTL1 • DBX (1, 2) • DLX (3, 4, 5) • EMX2 • EN (1, 2) • FHL (1, 2, 3) • HESX1 • HHEX • HLX • Homeobox (A1, A2, A3, A4, A5, A7, A9, A10, A11, A13, B1, B2, B3, B4, B5, B6, B7, B8, B9, B13, C4, C5, C6, C8, C9, C10, C11, C13, D1, D3, D4, D8, D9, D10, D11, D12, D13) • HOPX • IRX (1, 2, 3, 4, 5, 6, MKX) • LMX (1A, 1B) • MEIS (1, 2) • MEOX2 • MNX1 • MSX (1, 2) • NANOG • NKX (2-1, 2-2, 2-3, 2-5, 3-1, 3-2, 6-1, 6-2) • PBX (1, 2, 3) • PHF (1, 3, 6, 8, 10, 16, 17, 20, 21A) • PITX (1, 2, 3) • POU domen (PIT-1, BRN-3: A, B, C, Oktamer transkripcioni faktor: 1, 2, 3/4, 6, 7, 11) • OTX (1, 2) • PDX1 • ZEB (1, 2) |
---|
(3.2) Paired box | PAX (1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9) |
---|
(3.3) Fork glava / winged heliks | E2F (1, 2, 3, 4, 5) • FOX proteini (C1, C2, D3, E1, G1, H1, K2, L2, M1, N3, O1, O3, O4, P1, P2, P3) |
---|
(3.4) Faktori toplotnog šoka | HSF (1, 2, 4) |
---|
(3.5) Triptofan klasteri | ELF (2, 4, 5) • EGF • ELK (1, 3, 4) • ERF • ERG • ETS (1, 2, SPIB) • ETV (1, 4, 5, 6) • FLI1 • Interferon regulatorni faktori (1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8) • MYB • MYBL2 |
---|
(3.6) TEA domen | transkripcioni pojačivač faktor (1, 2, 3, 4) |
---|
|
|
(4) β-Scaffold faktori sa manjim žljebnim kontaktima |
---|
(4.1) Rel homologni region | NF-κB (NFKB1, NFKB2, REL, RELA, RELB) • NFAT (C1, C2, C3, C4, 5) |
---|
(4.2) STAT | STAT (1, 2, 3, 4, 5, 6) |
---|
(4.3) p53 | p53 • TBX (1, 2, 3, 5, 19, 21, 22, Brahiuri, TBR1) |
---|
(4.4) MADS kutija | Mef2 (A, B, C, D) • SRF |
---|
(4.6) TATA vezujući proteini | TBP • TBPL1 |
---|
(4.7) Grupa visoke pokretljivosti | HMGB (1, 2, 3) • HNF (1A, 1B) • LEF1 • SOX (1, 2, 3, 4, 5, 6, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 18, 21) • SRY • SSRP1 • TCF (3, 4) • TOX (1, 2, 3, 4) |
---|
(4.10) Domen hladnog šoka | CSDA, YBX1 |
---|
(4.11) Runt | CBF (CBFA2T2, CBFA2T3, RUNX1, RUNX2, RUNX3, RUNX1T1) |
---|
|
|
(0) Drugi transkripcioni faktori |
---|
(0.2) HMGI(Y) | HMGA (1, 2) • HBP1 |
---|
(0.3) Džep domen | Rb • RBL1 • RBL2 |
---|
(0.5) AP-2/EREBP-vezani faktori | Apetala 2 • EREBP • B3 |
---|
(0.6) Razno | ARID (1A, 1B, 2, 3A, 3B, 4A) • CAP • IFI (16, 35) • MLL (2, 3, T1) • MNDA • NFY (A, B, C) • Ro/Sigma |
---|
|
|
vidi isto transkripcioni faktor/koregulator nedostataka |