RNK polimeraza IV

RNK polimeraza IV je enzim koji sintetiše malu interferirajuću RNK (siRNK) kod biljki.^[1] Polimeraza IV je specifična za biljne genome i neophodna je za sintezu preko 90% 24-nukleotidnih heterohromatičnih siRNK.^[2]

Funkcija

RNK polimeraza supresuje transpozone i repetitivnu DNK u siRNK putu.^[1] siRNK ima značajnu ulogu u odbrani genoma od invazionih virusa i transpozivnih elemenata putem RNK usmerene DNK metilacije.^[2]

Polimeraza IV i ROS1 demetilaza otključavaju i rekondenzuju 5S rDNK hromatin, koji je prisutan u semenu i koji se koristi za razviće svojstava odraslih biljki.^[3] Polimeraza IV učestvuje u uspostavljanju metilacionih obrazaca u 5S genima tokom biljne maturacije. ^[3]

Reference

↑ ^1,0 ^1,1 Herr, A. J. , M. B. Jensen, T. Dalmay, and D. C. Baulcombe (2005). „RNA Polymerase IV Directs Silencing of Endogenous DNA”. Science 308. DOI:10.1126/science.1106910. PMID 15692015.
↑ ^2,0 ^2,1 Zhang, Xiaoyu , Ian R. Henderson,Cheng Lu,Pamela J. Green, and Steven E. Jacobsen (2007). „Role of RNA polymerase IV in plant small RNA metabolism”. Proc Natl Acad Sci USA 104. DOI:10.1073/pnas.0611456104.
↑ ^3,0 ^3,1 Douet, Julien , Bertrand Blanchard, Claudine Cuvillier, and Sylvette Tourmente (2008). „Interplay of RNA Pol IV and ROS1 During Post-Embryonic 5S rDNA Chromatin Remodeling”. Plant and Cell Physiology 49.

Transferaze: fosfor-sadržavajuće grupe (EC 2.7)

2.7.1-2.7.4:
fosfotransferaze/kinaze
(PO₄)

2.7.1: OH- akceptor	Hekso- • Gluko- • Frukto- (Hepatička) • Galakto- • Fosfofrukto- (1, Jetra, Mišić, Trombocit, 2) • Riboflavin • Šikimat • Timidin (ADP-timidin) • NAD⁺ • Glicerol • Pantotenat • Mevalonat • Piruvat • Deoksicitidin • PFP • Diacilglocerol • Fosfoinozitid 3 (Klasa I PI 3, Klasa II PI 3) • Sfingozin • Glukoza-1,6-bisfosfat sintaza
2.7.2: COOH akceptor	Fosfoglicerat • Aspartat
2.7.3: N akceptor	Kreatin
2.7.4: PO₄ akceptor	Fosfomevalonat • Adenilat • Nukleozid-difosfat

2.7.6: difosfotransferaze
(P₂O₇)

Riboza-fosfat difosfokinaza • Tiaminska pirofosfokinaza

2.7.7: nukleotidiltransferaza
(PO₄-nukleozid)

Polimeraza

DNK polimeraza	DNK-usmerena DNK polimeraza: DNK polimeraza I • DNA polimeraza II • DNA polimeraza III holoenzim RNK-usmerena DNA polimeraza: Reverzna transkriptaza (Telomeraza) DNK nukleotidileksotransferaza/Terminalna deoksinukleotidil transferaza
RNK nukleotidiltransferaza	RNK polimeraza/DNK-usmerena RNK polimeraza: RNK polimeraza I • RNK polimeraza II • RNK polimeraza III • RNK polimeraza IV • Primaza • RNK-zavisna RNK polimeraza PNPaza

Fosforolitička
3' do 5' eksoribonukleaza

RNaza PH • PNPaze

Uridililtransferaza

Glukoza-1-fosfat uridililtransferaza • Galaktoza-1-fosfat uridililtransferaza

Guanililtransferaza

iRNK završavajući enzim

Druge

Rekombinaza (Integraza) • Transpozaza

2.7.8: razno

Fosfatidiltransferaze	CDP-diacilglicerol—glicerol-3-fosfat 3-fosfatidiltransferaza • CDP-diacilglicerol—serin O-fosfatidiltransferaza • CDP-diacilglicerol—inozitol 3-fosfatidiltransferaza • CDP-diacilglicerol—holin O-fosfatidiltransferaza
Glikozil-1-fosfotransferaza	N-acetilglukozamin-1-fosfat transferaza

2.7.10-2.7.13: proteinske kinaze
(PO₄; proteinski akceptor)

2.7.10: proteinske-tirozinske	vidi tirozinske kinaze
2.7.11: proteinske-serin/treonin	vidi serin/treonin-specifične proteinske kinaze
2.7.12: dualna specifičnost	vidi serin/treonin-specifične proteinske kinaze
2.7.13: protein-histidinske	Protein-histidinske pros-kinaze • Proteinske-histidinske tele-kinaze • Histidinske kinaze

B enzm: 1.1/2/3/4/5/6/7/8/10/11/13/14/15-18, 2.1/2/3/4/5/6/7/8, 2.7.10, 2.7.11-12, 3.1/2/3/4/5/6/7, 3.1.3.48, 3.4.21/22/23/24, 4.1/2/3/4/5/6, 5.1/2/3/4/99, 6.1-3/4/5-6