Faktor nekroze tumora (ligand) superfamilija, član 10 |
---|
![](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/3/34/Protein_TNFSF10_PDB_1d0g.png/250px-Protein_TNFSF10_PDB_1d0g.png) PDB prikaz baziran na 1d0g. |
Dostupne strukture |
---|
1d0g, 1d2q, 1d4v, 1dg6, 1du3 |
Identifikatori |
---|
Simboli | TNFSF10; APO2L; Apo-2L; CD253; TL2; TRAIL |
---|
Vanjski ID | OMIM: 603598 MGI: 107414 HomoloGene: 2824 GeneCards: TNFSF10 Gene |
---|
Ontologija gena | Molekularna funkcija | • aktivnost prenosa signala • citokinska aktivnost • vezivanje za faktor nekroze tumora • vezivanje jona cinka • vezivanje metalnih jona
| Celularna komponenta | • ekstracelularni prostor • rastvorna frakcija • integralno sa membranom plazme • membrana
| Biološki proces | • apoptoza • indukcija apoptoze • imunski odgovor • prenos signala • interćelijska signalizacija • pozitivna regulacija I-kapaB kinaze/NF-kapaB kaskade
| |
Pregled RNK izražavanja |
---|
![](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/8/8c/PBB_GE_TNFSF10_202688_at_tn.png/250px-PBB_GE_TNFSF10_202688_at_tn.png) |
![](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/4/41/PBB_GE_TNFSF10_202687_s_at_tn.png/250px-PBB_GE_TNFSF10_202687_s_at_tn.png) |
![](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/6/6c/PBB_GE_TNFSF10_214329_x_at_tn.png/250px-PBB_GE_TNFSF10_214329_x_at_tn.png) |
podaci |
Ortolozi |
---|
Vrsta | Čovek | Miš | |
---|
Entrez | 8743 | 22035 | |
---|
Ensembl | ENSG00000121858 | ENSMUSG00000039304 | |
---|
UniProt | P50591 | Q3TZR6 | |
---|
RefSeq (mRNA) | NM_003810 | NM_009425 | |
---|
RefSeq (protein) | NP_003801 | NP_033451 | |
---|
Lokacija (UCSC) | Chr 3: 173.71 - 173.72 Mb | Chr 3: 27.51 - 27.53 Mb | |
---|
PubMed pretraga | [1] | [2] | |
TRAIL, TNF-srodni apoptoza-indukujući ligand, je protein koji funkcioniše kao ligand koji indukuje proces ćelijske smrti (apoptozu). TRAIL je takođe naziva CD253 (klaster diferencijacije 253).[1][2][3]
Gen
Kod ljudi, gen koji kodira TRAIL je lociran na hromozomu 3q26. On nije u blizini drugih članova TNF familije. Genomska struktura TRAIL gena se sastoji od aproksimativno 20 kb i formirana je od pet eksonskih segmenata 222, 138, 42, 106, i 1245 nukleotida i četiri introna sa aproksimativno 8.2, 3.2, 2.3 i 2.3 kb. TRAIL genu nedostaju TATA i CAAT kutije, i promotorski region sadrži putativne response elemente za GATA, AP-1, C/EBP, SP-1, OCT-1, AP3, PEA3, CF-1, i ISRE.
Struktura
TRAIL pokazuje homologiju sa drugim članovima faktor nekroze tumora superfamilije. On se sastoji od 281 aminokiseline i ima karakteristike tipa II transmembranskog proteina (i.e. nema vodeću sekvencu i unutrašnji transmembranski domen). N-terminalni citoplazmatični domen nije konzerviran među članovima familije. U kontrastu s njim, C-terminalni ekstracelularni domen je konzerviran i može biti proteolitički odsečen sa ćelijske površine. TRAIL formira homotrimer koji vezuje tri molekula receptora.
Funkcija
TRAIL se vezuje za receptore smrti DR4 (TRAIL-RI) i DR5 (TRAIL-RII). Proces apoptoze je zavistan od kaspaze-8. Kaspaza-8 aktivira nizvodne efektorske kaspaze uključujući prokaspaze-3, -6, i -7, što dovodi do aktivacije specifičnih kinaza.[4] TRAIL se takođe vezuje za receptore DcR1 i DcR2, koji ne sadrže citoplazmatični domen (DcR1), ili koji imaju skraćeni domen smrti (DcR2). DcR1 funkcioniše kao TRAIL-neutrališući mamac-receptor. Citoplazmatični DcR2 domen je funkcionalan i aktivira NFkapaB. U ćelijama koje izražavaju DcR2, TRAIL vezivanje aktivira NFkapaB, što dovodi do transkripcije gena za koje se zna da antagoniziraju signalni put smrti i/ili da promovišu inflamaciju.
Interakcije
Za TRAIL je bilo pokazano da interaguje sa TNFRSF10B.[5][6][7]
Povezano
Reference
- ↑ Wiley SR, Schooley K, Smolak PJ, Din WS, Huang CP, Nicholl JK, Sutherland GR, Smith TD, Rauch C, Smith CA (December 1995). „Identification and characterization of a new member of the TNF family that induces apoptosis”. Immunity 3 (6): 673–82. DOI:10.1016/1074-7613(95)90057-8. PMID 8777713.
- ↑ Pitti RM, Marsters SA, Ruppert S, Donahue CJ, Moore A, Ashkenazi A (May 1996). „Induction of apoptosis by Apo-2 ligand, a new member of the tumor necrosis factor cytokine family”. J. Biol. Chem. 271 (22): 12687–90. DOI:10.1074/jbc.271.22.12687. PMID 8663110. Arhivirano iz originala na datum 2005-01-19. Pristupljeno 2014-05-20.
- ↑ Mire-Sluis, Anthony R.; Thorpe, Robin, ur. (1998). Cytokines (Handbook of Immunopharmacology). Boston: Academic Press. ISBN 0-12-498340-5.
- ↑ Song JJ, Lee YJ (May 2008). „Differential cleavage of Mst1 by caspase-7/-3 is responsible for TRAIL-induced activation of the MAPK superfamily”. Cell. Signal. 20 (5): 892–906. DOI:10.1016/j.cellsig.2008.01.001. PMC 2483832. PMID 18276109.
- ↑ Kaptein, A; Jansen M, Dilaver G, Kitson J, Dash L, Wang E, Owen M J, Bodmer J L, Tschopp J, Farrow S N (November 2000). „Studies on the interaction between TWEAK and the death receptor WSL-1/TRAMP (DR3)”. FEBS Lett. (NETHERLANDS) 485 (2-3): 135–41. DOI:10.1016/S0014-5793(00)02219-5. ISSN 0014-5793. PMID 11094155.
- ↑ Walczak, H; Degli-Esposti M A, Johnson R S, Smolak P J, Waugh J Y, Boiani N, Timour M S, Gerhart M J, Schooley K A, Smith C A, Goodwin R G, Rauch C T (September 1997). „TRAIL-R2: a novel apoptosis-mediating receptor for TRAIL”. EMBO J. (ENGLAND) 16 (17): 5386–97. DOI:10.1093/emboj/16.17.5386. ISSN 0261-4189. PMC 1170170. PMID 9311998.
- ↑ Hymowitz, S G; Christinger H W, Fuh G, Ultsch M, O'Connell M, Kelley R F, Ashkenazi A, de Vos A M (October 1999). „Triggering cell death: the crystal structure of Apo2L/TRAIL in a complex with death receptor 5”. Mol. Cell (UNITED STATES) 4 (4): 563–71. DOI:10.1016/S1097-2765(00)80207-5. ISSN 1097-2765. PMID 10549288.
Literatura
- Wiley S, Schooley K, Smolak P, Din W, Huang C, Nicholl J, Sutherland G, Smith T, Rauch C, Smith C (1995). „Identification and characterization of a new member of the TNF family that induces apoptosis”. Immunity 3 (6): 673–82. DOI:10.1016/1074-7613(95)90057-8. PMID 8777713.
- Almasan A, Ashkenazi A (2004). „Apo2L/TRAIL: apoptosis signaling, biology, and potential for cancer therapy.”. Cytokine Growth Factor Rev. 14 (3-4): 337–48. DOI:10.1016/S1359-6101(03)00029-7. PMID 12787570.
- Cha SS, Song YL, Oh BH (2004). „Specificity of molecular recognition learned from the crystal structures of TRAIL and the TRAIL:sDR5 complex.”. Vitam. Horm. 67: 1–17. DOI:10.1016/S0083-6729(04)67001-4. PMID 15110168.
- Song C, Jin B (2005). „TRAIL (CD253), a new member of the TNF superfamily.”. J. Biol. Regul. Homeost. Agents 19 (1-2): 73–7. PMID 16178278.
- Bucur O, Ray S, Bucur MC, Almasan A (2006). „APO2 ligand/tumor necrosis factor-related apoptosis-inducing ligand in prostate cancer therapy.”. Front. Biosci. 11: 1549–68. DOI:10.2741/1903. PMID 16368536.
Spoljašnje veze
- Apoptoza, Trail & Kaspaze 8 - Mapa proteolize-animacija
- PDB 1D2Q
- MeSH TRAIL+Protein
|
---|
Po familiji | | |
---|
| |
---|
| Glavni | |
---|
TNF (ligand) superfamilija | |
---|
| |
---|
|
---|
| |
---|
|
---|
Drugi | |
---|
Po funkciji | |
---|
B trdu: peptidi (nrpl/grfl/cytl/horl), receptori (lgic, enzr, gprc, igsr, intg, nrpr/grfr/cytr), itra (adap, gbpr, mapk), calc, lipd, signalni putevi (hedp, wntp, tgfp+mapp, notp, jakp, fsap, hipp, tlrp) |
|
---|
1-50 | CD1 (a-c, 1A, 1D, 1E) • CD2 • CD3 (γ, δ, ε) • CD4 • CD5 • CD6 • CD7 • CD8 (a) • CD9 • CD10 • CD11 (a, b, c) • CD13 • CD14 • CD15 • CD16 (A, B) • CD18 • CD19 • CD20 • CD21 • CD22 • CD23 • CD24 • CD25 • CD26 • CD27 • CD28 • CD29 • CD30 • CD31 • CD32 (A, B) • CD33 • CD34 • CD35 • CD36 • CD37 • CD38 • CD39 • CD40 • CD41 • CD42 (a, b, c, d) • CD43 • CD44 • CD45 • CD46 • CD47 • CD48 • CD49 (a, b, c, d, e, f) • CD50 |
---|
51-100 | CD51 • CD52 • CD53 • CD54 • CD55 • CD56 • CD57 • CD58 • CD59 • CD61 • CD62 (E, L, P) • CD63 • CD64 (A, B, C) • CD66 (a, b, c, d, e, f) • CD68 • CD69 • CD70 • CD71 • CD72 • CD73 • CD74 • CD78 • CD79 (a, b) • CD80 • CD81 • CD82 • CD83 • CD84 • CD85 (a, d, e, h, j, k) • CD86 • CD87 • CD88 • CD89 • CD90 • CD91- CD92 • CD93 • CD94 • CD95 • CD96 • CD97 • CD98 • CD99 • CD100 |
---|
101-150 | CD101 • CD102 • CD103 • CD104 • CD105 • CD106 • CD107 (a, b) • CD108 • CD109 • CD110 • CD111 • CD112 • CD113 • CD114 • CD115 • CD116 • CD117 • CD118 • CD119 • CD120 (a, b) • CD121 (a, b) • CD122 • CD123 • CD124 • CD125 • CD126 • CD127 • CD129 • CD130 • CD131 • CD132 • CD133 • CD134 • CD135 • CD136 • CD137 • CD138 • CD140b • CD141 • CD142 • CD143 • CD144 • CD146 • CD147 • CD148 • CD150 |
---|
151-200 | CD151 • CD152 • CD153 • CD154 • CD155 • CD156 (a, b, c) • CD157 • CD158 (a, d, e, i, k) • CD159 (a, c) • CD160 • CD161 • CD162 • CD163 • CD164 • CD166 • CD167 ( a, b) • CD168 • CD169 • CD170 • CD171 • CD172 (a, b, g) • CD174 • CD177 • CD178 • CD179 (a, b) • CD181 • CD182 • CD183 • CD184 • CD185 • CD186 • CD191 • CD192 • CD193 • CD194 • CD195 • CD196 • CD197 • CDw198 • CDw199 • CD200 |
---|
201-250 | CD201 • CD202b • CD204 • CD205 • CD206 • CD207 • CD208 • CD209 • CDw210 (a, b) • CD212 • CD213a (1, 2) • CD217 • CD218 (a, b) • CD220 • CD221 • CD222 • CD223 • CD224 • CD225 • CD226 • CD227 • CD228 • CD229 • CD230 • CD233 • CD234 • CD235 (a, b) • CD236 • CD238 • CD239 • CD240CE • CD241 • CD243 • CD244 • CD246 • CD247- CD248 • CD249 |
---|
251-300 | CD252 • CD253 • CD254 • CD256 • CD257 • CD258 • CD261 • CD262 • CD264 • CD265 • CD266 • CD267 • CD268 • CD269 • CD271 • CD272 • CD273 • CD274 • CD275 • CD276 • CD278 • CD279 • CD280 • CD281 • CD282 • CD283 • CD284 • CD286 • CD288 • CD289 • CD290 • CD292 • CDw293 • CD294 • CD295 • CD297 • CD298 • CD299 |
---|
301-350 | CD300A • CD301 • CD302 • CD303 • CD304 • CD305 • CD306 • CD307 • CD309 • CD312 • CD314 • CD315 • CD316 • CD317 • CD318 • CD320 • CD321 • CD322 • CD324 • CD325 • CD326 • CD328 • CD329 • CD331 • CD332 • CD333 • CD334 • CD335 • CD336 • CD337 • CD338 • CD339 • CD340 • CD344 • CD349 • CD350 |
---|