Trolančana DNK

Šematski prikaz trolančane DNK.

Trolančana DNK je DNK struktura u kojoj su tri oligonukleotida uvijena jedan oko drugog tako da formiraju trostruki heliks. U ovoj strukturi, jedan lanac se vezuje za B-forma DNK dvostrukog heliksa putem Hugstinovog sparivanja baza.[1]

Na primer, nukleobaza T se vezuje za Votson–Krikov bazni par T-A Hugstinovom vodoničnom vezom između AxT para (x označava Hugstinov par). Protonisani citozin, koji se označava sa C+, takođe može da formira bazni triplet sa C-G parom putem Hugstinovog baznog sparivanja u formu GxC+.[2]

Reference

  1. ↑ Andrew Thompson, Tam Huynh-Dinh, Juan A. Subirana (2002). „Crystal structure of an antiparallel DNA fragment with Hoogsteen base pairing”. PNAS 99 (5): 2806-2811. DOI:10.1073/pnas.052675499. 
  2. ↑ Evgenia N. Nikolova, Eunae Kim, Abigail A. Wise, Patrick J. O’Brien, Ioan Andricioaei, Hashim M. Al-Hashimi (2011). „Transient Hoogsteen base pairs in canonical duplex DNA”. Nature 470: 498–502. DOI:10.1038/nature09775. 

Literatura

  • Rich, A. (1993). DNA comes in many forms. Gene 135:99–109
  • Soyfer, V.N and V.N.Potaman. Triple-Helical Nucleic Acids. Springer Ver., New York, 1995, 360 pp.
  • Mills, M., Arimondo, P., Lacroix, L., Garestier, T., Hélène, C., Klump, H. & Mergny, J.L. (1999). Energetics of strand displacement reactions in triple helices: a spectroscopic study. J. Mol. Biol. Vol. 291: 1035–1054
  • Watson, J.D. and Crick, F.H.C. (1953). Molecular structure of nucleic acids: A structure for deoxyribose nucleic acid. "Nature," 4356: 737–738.
  • Firulli, A, Maibenco, D., and Kinniburgh, AJ (1994). „Triplex forming ability of a c-myc promoter element predicts promoter strength”. Arch. Biochem. Biophys. 310 (1): 236–42.