Аполіпропротеїн CII

Аполіпропротеїн C-II

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
1SOH, 1BY6, 1I5J, 1O8T

Ідентифікатори

Символи

APOC2, APO-CII, APOC-II, apolipoprotein C2

Зовнішні ІД

OMIM: 608083 MGI: 88054 HomoloGene: 47928 GeneCards: APOC2

Пов'язані генетичні захворювання

familial apolipoprotein C-II deficiency^[1]

Онтологія гена
Молекулярна функція	• lipase inhibitor activity • phospholipase binding • protein homodimerization activity • lipoprotein lipase activator activity • phospholipase activator activity • GO:0010577 enzyme activator activity • lipid binding
Клітинна компонента	• chylomicron • very-low-density lipoprotein particle • spherical high-density lipoprotein particle • extracellular region • early endosome • low-density lipoprotein particle • high-density lipoprotein particle • intermediate-density lipoprotein particle • міжклітинний простір
Біологічний процес	• high-density lipoprotein particle clearance • lipid transport • positive regulation of triglyceride catabolic process • chylomicron remnant clearance • lipid metabolism • phospholipid efflux • positive regulation of lipoprotein lipase activity • positive regulation of fatty acid biosynthetic process • negative regulation of very-low-density lipoprotein particle clearance • retinoid metabolic process • negative regulation of receptor-mediated endocytosis • lipid catabolic process • positive regulation of phospholipase activity • positive regulation of phospholipid catabolic process • cholesterol efflux • very-low-density lipoprotein particle remodeling • negative regulation of cholesterol transport • cholesterol homeostasis • positive regulation of very-low-density lipoprotein particle remodeling • triglyceride-rich lipoprotein particle remodeling • triglyceride homeostasis • negative regulation of lipid metabolic process • reverse cholesterol transport • GO:0048553 negative regulation of catalytic activity • lipoprotein transport • chylomicron remodeling • high-density lipoprotein particle remodeling • chylomicron assembly • GO:0048554 positive regulation of catalytic activity
Джерела:Amigo / QuickGO

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


344


11813

Ensembl


ENSG00000234906


ENSMUSG00000002992

UniProt


P02655


Q05020

RefSeq (мРНК)


NM_000483


NM_001277944 NM_001309795

RefSeq (білок)


NP_000474 NP_000474.2


NP_001296728 NP_001264873 NP_001296724

Локус (UCSC)

Хр. 19: 44.95 – 44.95 Mb

Хр. 7: 19.41 – 19.41 Mb

PubMed search

^[2]

^[3]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

Аполіпропротеїн C-II (англ. Apolipoprotein C2) – білок, який кодується геном APOC2, розташованим у людей на короткому плечі 19-ї хромосоми. ^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 101 амінокислот, а молекулярна маса — 11 284^[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MGTRLLPALF	LVLLVLGFEV	QGTQQPQQDE	MPSPTFLTQV	KESLSSYWES
AKTAAQNLYE	KTYLPAVDEK	LRDLYSKSTA	AMSTYTGIFT	DQVLSVLKGE
E

A: Аланін
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у таких біологічних процесах як метаболізм ліпідів, транспорт, транспорт ліпідів, деградація ліпідів. Білок має сайт для зв'язування з сіаловими кислотами. Секретований назовні.

Література

Fojo S.S., Law S.W., Brewer H.B. Jr. (1987). The human preproapolipoprotein C-II gene. Complete nucleic acid sequence and genomic organization. FEBS Lett. 213: 221—226. PMID 3030808 DOI:10.1016/0014-5793(87)81495-3
Fojo S.S., Law S.W., Brewer H.B. Jr. (1984). Human apolipoprotein C-II: complete nucleic acid sequence of preapolipoprotein C-II. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 81: 6354—6357. PMID 6593704 DOI:10.1073/pnas.81.20.6354
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Jackson C.L., Bruns G.A.P., Breslow J.L. (1986). Isolation of cDNA and genomic clones for apolipoprotein C-II. Methods Enzymol. 128: 788—800. PMID 3014272 DOI:10.1016/0076-6879(86)28106-9
Jackson R.L., Baker H.N., Gilliam E.B., Gotto A.M. Jr. (1977). Primary structure of very low density apolipoprotein C-II of human plasma. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 74: 1942—1945. PMID 194244 DOI:10.1073/pnas.74.5.1942
Sparrow J.T., Gotto A.M. Jr. (1980). Phospholipid binding studies with synthetic apolipoprotein fragments. Ann. N. Y. Acad. Sci. 348: 187—211. PMID 6772077 DOI:10.1111/j.1749-6632.1980.tb21300.x

Примітки

↑ Захворювання, генетично пов'язані з Аполіпропротеїн C-II переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:609 (англ.) . Архів оригіналу за 13 вересня 2015. Процитовано 30 січня 2017.
↑ UniProt, P02655 (англ.) . Архів оригіналу за 12 квітня 2017. Процитовано 30 січня 2017.