ADAMTSL1 |
---|
|
Ідентифікатори |
---|
Символи | ADAMTSL1, ADAMTSL-1, ADAMTSR1, C9orf94, PUNCTIN, ADAMTS like 1 |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 609198 MGI: 1924989 HomoloGene: 64642 GeneCards: ADAMTSL1 |
---|
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • GO:0070122 peptidase activity • hydrolase activity |
---|
Клітинна компонента | • extracellular region • endoplasmic reticulum lumen |
---|
Біологічний процес | • протеоліз |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
|
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | NM_001040272 NM_052866 NM_139238 NM_139264 |
| | NM_029967 NM_172542 NM_001368621 |
|
---|
RefSeq (білок) | | |
---|
Локус (UCSC) | Хр. 9: 17.91 – 18.91 Mb | Хр. 4: 85.43 – 86.35 Mb |
---|
PubMed search | [1] | [2] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
ADAMTSL1 (англ. ADAMTS like 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 9-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 762 амінокислот, а молекулярна маса — 193 409[4].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MECCRRATPG | | TLLLFLAFLL | | LSSRTARSEE | | DRDGLWDAWG | | PWSECSRTCG |
GGASYSLRRC | | LSSKSCEGRN | | IRYRTCSNVD | | CPPEAGDFRA | | QQCSAHNDVK |
HHGQFYEWLP | | VSNDPDNPCS | | LKCQAKGTTL | | VVELAPKVLD | | GTRCYTESLD |
MCISGLCQIV | | GCDHQLGSTV | | KEDNCGVCNG | | DGSTCRLVRG | | QYKSQLSATK |
SDDTVVAIPY | | GSRHIRLVLK | | GPDHLYLETK | | TLQGTKGENS | | LSSTGTFLVD |
NSSVDFQKFP | | DKEILRMAGP | | LTADFIVKIR | | NSGSADSTVQ | | FIFYQPIIHR |
WRETDFFPCS | | ATCGGGYQLT | | SAECYDLRSN | | RVVADQYCHY | | YPENIKPKPK |
LQECNLDPCP | | ASDGYKQIMP | | YDLYHPLPRW | | EATPWTACSS | | SCGGGIQSRA |
VSCVEEDIQG | | HVTSVEEWKC | | MYTPKMPIAQ | | PCNIFDCPKW | | LAQEWSPCTV |
TCGQGLRYRV | | VLCIDHRGMH | | TGGCSPKTKP | | HIKEECIVPT | | PCYKPKEKLP |
VEAKLPWFKQ | | AQELEEGAAV | | SEEPSFIPEA | | WSACTVTCGV | | GTQVRIVRCQ |
VLLSFSQSVA | | DLPIDECEGP | | KPASQRACYA | | GPCSGEIPEF | | NPDETDGLFG |
GLQDFDELYD | | WEYEGFTKCS | | ESCGGGVQEA | | VVSCLNKQTR | | EPAEENLCVT |
SRRPPQLLKS | | CNLDPCPARW | | EIGKWSPCSL | | TCGVGLQTRD | | VFCSHLLSRE |
MNETVILADE | | LCRQPKPSTV | | QACNRFNCPP | | AWYPAQWQPC | | SRTCGGGVQK |
REVLCKQRMA | | DGSFLELPET | | FCSASKPACQ | | QACKKDDCPS | | EWLLSDWTEC |
STSCGEGTQT | | RSAICRKMLK | | TGLSTVVNST | | LCPPLPFSSS | | IRPCMLATCA |
RPGRPSTKHS | | PHIAAARKVY | | IQTRRQRKLH | | FVVGGFAYLL | | PKTAVVLRCP |
ARRVRKPLIT | | WEKDGQHLIS | | STHVTVAPFG | | YLKIHRLKPS | | DAGVYTCSAG |
PAREHFVIKL | | IGGNRKLVAR | | PLSPRSEEEV | | LAGRKGGPKE | | ALQTHKHQNG |
IFSNGSKAEK | | RGLAANPGSR | | YDDLVSRLLE | | QGGWPGELLA | | SWEAQDSAER |
NTTSEEDPGA | | EQVLLHLPFT | | MVTEQRRLDD | | ILGNLSQQPE | | ELRDLYSKHL |
VAQLAQEIFR | | SHLEHQDTLL | | KPSERRTSPV | | TLSPHKHVSG | | FSSSLRTSST |
GDAGGGSRRP | | HRKPTILRKI | | SAAQQLSASE | | VVTHLGQTVA | | LASGTLSVLL |
HCEAIGHPRP | | TISWARNGEE | | VQFSDRILLQ | | PDDSLQILAP | | VEADVGFYTC |
NATNALGYDS | | VSIAVTLAGK | | PLVKTSRMTV | | INTEKPAVTV | | DIGSTIKTVQ |
GVNVTINCQV | | AGVPEAEVTW | | FRNKSKLGSP | | HHLHEGSLLL | | TNVSSSDQGL |
YSCRAANLHG | | ELTESTQLLI | | LDPPQVPTQL | | EDIRALLAAT | | GPNLPSVLTS |
PLGTQLVLDP | | GNSALLGCPI | | KGHPVPNITW | | FHGGQPIVTA | | TGLTHHILAA |
GQILQVANLS | | GGSQGEFSCL | | AQNEAGVLMQ | | KASLVIQDYW | | WSVDRLATCS |
ASCGNRGVQQ | | PRLRCLLNST | | EVNPAHCAGK | | VRPAVQPIAC | | NRRDCPSRWM |
VTSWSACTRS | | CGGGVQTRRV | | TCQKLKASGI | | STPVSNDMCT | | QVAKRPVDTQ |
ACNQQLCVEW | | AFSSWGQCNG | | PCIGPHLAVQ | | HRQVFCQTRD | | GITLPSEQCS |
ALPRPVSTQN | | CWSEACSVHW | | RVSLWTLCTA | | TCGNYGFQSR | | RVECVHARTN |
KAVPEHLCSW | | GPRPANWQRC | | NITPCENMEC | | RDTTRYCEKV | | KQLKLCQLSQ |
FKSRCCGTCG | | KA |
Кодований геном білок за функцією належить до гідролаз. Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Локалізований у позаклітинному матриксі. Також секретований назовні.
Література
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Wang L.W., Leonhard-Melief C., Haltiwanger R.S., Apte S.S. (2009). Post-translational modification of thrombospondin type-1 repeats in ADAMTS-like 1/punctin-1 by C-mannosylation of tryptophan. J. Biol. Chem. 284: 30004—30015. PMID 19671700 DOI:10.1074/jbc.M109.038059
Примітки
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:14632 (англ.) . Архів оригіналу за 15 березня 2016. Процитовано 8 вересня 2017.
- ↑ UniProt, Q8N6G6 (англ.) . Архів оригіналу за 7 грудня 2016. Процитовано 8 вересня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |
На цю статтю не посилаються інші статті Вікіпедії. Будь ласка розставте посилання відповідно до прийнятих рекомендацій. |