AFTPH |
---|
|
Ідентифікатори |
---|
Символи | AFTPH, Nbla10388, aftiphilin |
---|
Зовнішні ІД | MGI: 1923012 HomoloGene: 9764 GeneCards: AFTPH |
---|
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • clathrin binding |
---|
Клітинна компонента | • AP-1 adaptor complex • гіалоплазма • комплекс Ґольджі • внутрішньоклітинна мембранна органела • клітинне ядро • цитоплазма • trans-Golgi network membrane |
---|
Біологічний процес | • protein transport • intracellular transport |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
|
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | NM_001002243 NM_017657 NM_203437 |
| | NM_001252503 NM_001290545 NM_181411 |
|
---|
RefSeq (білок) | NP_001002243 NP_060127 NP_982261 NP_001362898 NP_001362899
| NP_001362900 NP_001362901 NP_001362902 |
| | NP_001239432 NP_001277474 NP_852076 |
|
---|
Локус (UCSC) | Хр. 2: 64.52 – 64.59 Mb | Хр. 11: 20.64 – 20.69 Mb |
---|
PubMed search | [1] | [2] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
AFTPH (англ. Aftiphilin) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 2-ї хромосоми. [3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 937 амінокислот, а молекулярна маса — 102 200[4].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MEPDIIRMYS | | SSPPPLDNGA | | EDDDDDEFGE | | FGGFSEVSPS | | GVGFVDFDTP |
DYTRPKEEFV | | PSNHFMPIHE | | FSENVDSLTS | | FKSIKNGNDK | | DITAELSAPV |
KGQSDVLLST | | TSKEIISSEM | | LATSIDGMER | | PGNLNKVVEQ | | RQNVGTLESF |
SPGDFRTNMN | | VVHQNKQLES | | CNGEKPPCLE | | ILTNGFAVLE | | TVNPQGTDDL |
DNVADSKGRK | | PLSTHSTEYN | | LDSVPSPAEE | | FADFATFSKK | | ERIQLEEIEC |
AVLNDREALT | | IRENNKINRV | | NELNSVKEVA | | LGRSLDNKGD | | TDGEDQVCVS |
EISIVTNRGF | | SVEKQGLPTL | | QQDEFLQSGV | | QSKAWSLVDS | | ADNSEAIRRE |
QCKTEEKLDL | | LTSKCAHLCM | | DSVKTSDDEV | | GSPKEESRKF | | TNFQSPNIDP |
TEENDLDDSL | | SVKNGDSSND | | FVTCNDINED | | DFGDFGDFGS | | ASGSTPPFVT |
GTQDSMSDAT | | FEESSEHFPH | | FSEPGDDFGE | | FGDINAVSCQ | | EETILTKSDL |
KQTSDNLSEE | | CQLARKSSGT | | GTEPVAKLKN | | GQEGEIGHFD | | SVPNIQDDCN |
GFQDSDDFAD | | FSSAGPSQVV | | DWNAFEDEQK | | DSCSWAAFGD | | QQATESHHRK |
EAWQSHRTDE | | NIDTPGTPKT | | HSVPSATSKG | | AVASGHLQES | | ATSVQTALLN |
RLERIFEACF | | PSILVPDAEE | | EVTSLKHLLE | | TSTLPIKTRE | | ALPESGELLD |
VWTELQDIHD | | AHGLRYQWGG | | SHSNKKLLSS | | LGIDTRNILF | | TGNKKQPVIV |
PMYAAGLGML | | EPTKEPLKPL | | SAAEKIASIG | | QTATMSPDMN | | TCTSDQFQES |
LPPVQFDWSS | | SGLTNPLDAS | | GGSTLLNLDF | | FGPVDDSSSS | | SSTTIPGVDP |
ELYELTTSKL | | EISTSSLKVT | | DAFARLMSTV | | EKTSTSTSRK | | PKREEHLSEE |
AIKVIAGLPD | | LTFMHAKVLM | | FPATLTPSTS | | SQEKADG |
Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як транспорт, транспорт білків, поліморфізм, альтернативний сплайсинг. Локалізований у цитоплазмі.
Література
- Mattera R., Ritter B., Sidhu S.S., McPherson P.S., Bonifacino J.S. (2004). Definition of the consensus motif recognized by gamma-adaptin ear domains. J. Biol. Chem. 279: 8018—8028. PMID 14665628 DOI:10.1074/jbc.M311873200
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Beausoleil S.A., Villen J., Gerber S.A., Rush J., Gygi S.P. (2006). A probability-based approach for high-throughput protein phosphorylation analysis and site localization. Nat. Biotechnol. 24: 1285—1292. PMID 16964243 DOI:10.1038/nbt1240
Примітки
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:25951 (англ.) . Архів оригіналу за 26 серпня 2017. Процитовано 29 серпня 2017.
- ↑ UniProt, Q6ULP2 (англ.) . Архів оригіналу за 17 серпня 2017. Процитовано 29 серпня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |