AGAP2

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
2BMJ, 2IWR, 2RLO

Ідентифікатори

Символи

AGAP2, CENTG1, GGAP2, PIKE, ArfGAP with GTPase domain, ankyrin repeat and PH domain 2

Зовнішні ІД

OMIM: 605476 HomoloGene: 86815 GeneCards: AGAP2

Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:0005097, GO:0005099, GO:0005100 GTPase activator activity • зв'язування з іоном металу • nucleotide binding • GTP binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • GO:0006184 GTPase activity
Клітинна компонента	• екзосома • мембрана • ядерце • цитоплазма • мітохондрія • клітинне ядро
Біологічний процес	• GO:1904089 negative regulation of neuron apoptotic process • protein transport • GO:1903363 negative regulation of protein catabolic process • GO:0032320, GO:0032321, GO:0032855, GO:0043089, GO:0032854 positive regulation of GTPase activity • GO:0015915 транспорт • positive regulation of 1-phosphatidylinositol-3-kinase activity
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


116986


65218

Ensembl


ENSG00000135439


ENSRNOG00000025584

UniProt


Q99490


Q8CGU4

RefSeq (мРНК)


NM_001122772 NM_014770


NM_023026

RefSeq (білок)


NP_001116244 NP_055585


NP_075415

Локус (UCSC)

Хр. 12: 57.72 – 57.74 Mb

н/д

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

AGAP2 (англ. ArfGAP with GTPase domain, ankyrin repeat and PH domain 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 12-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 192 амінокислот, а молекулярна маса — 124 674^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MSRGAGALQR	RTTTYLISLT	LVKLESVPPP	PPSPSAAAVG	APGARGSEPR
DPGSPRGAEE	PGKKRHERLF	HRQDALWIST	SSAGAGGAEP	PALSPAPASP
ARPVSPAPGR	RLSLWAAPPG	PPLSGGLSPD	SKPGGAPSSS	RRPLLSSPSW
GGPEPEGRTG	GGVPGSSSPH	PGTGSRRLKV	APPPPAPKPC	KTVTTSGAKA
GGGKGAGSRL	SWPESEGKPR	VKGSKSSAGT	GASVSAAATA	AAAGGGGSTA
STSGGVGAGA	GARGKLSPRK	GKSKTLDNSD	LHPGPPAGSP	PPLTLPPTPS
PATAVTAASA	QPPGPAPPIT	LEPPAPGLKR	GREGGRASTR	DRKMLKFISG
IFTKSTGGPP	GSGPLPGPPS	LSSGSGSREL	LGAELRASPK	AVINSQEWTL
SRSIPELRLG	VLGDARSGKS	SLIHRFLTGS	YQVLEKTESE	QYKKEMLVDG
QTHLVLIREE	AGAPDAKFSG	WADAVIFVFS	LEDENSFQAV	SRLHGQLSSL
RGEGRGGLAL	ALVGTQDRIS	ASSPRVVGDA	RARALCADMK	RCSYYETCAT
YGLNVDRVFQ	EVAQKVVTLR	KQQQLLAACK	SLPSSPSHSA	ASTPVAGQAS
NGGHTSDYSS	SLPSSPNVGH	RELRAEAAAV	AGLSTPGSLH	RAAKRRTSLF
ANRRGSDSEK	RSLDSRGETT	GSGRAIPIKQ	SFLLKRSGNS	LNKEWKKKYV
TLSSNGFLLY	HPSINDYIHS	THGKEMDLLR	TTVKVPGKRP	PRAISAFGPS
ASINGLVKDM	STVQMGEGLE	ATTPMPSPSP	SPSSLQPPPD	QTSKHLLKPD
RNLARALSTD	CTPSGDLSPL	SREPPPSPMV	KKQRRKKLTT	PSKTEGSAGQ
AEAKRKMWKL	KSFGSLRNIY	KAEENFEFLI	VSSTGQTWHF	EAASFEERDA
WVQAIESQIL	ASLQCCESSK	VKLRTDSQSE	AVAIQAIRNA	KGNSICVDCG
APNPTWASLN	LGALICIECS	GIHRNLGTHL	SRVRSLDLDD	WPRELTLVLT
AIGNDTANRV	WESDTRGRAK	PSRDSSREER	ESWIRAKYEQ	LLFLAPLSTS
EEPLGRQLWA	AVQAQDVATV	LLLLAHARHG	PLDTSVEDPQ	LRSPLHLAAE
LAHVVITQLL	LWYGADVAAR	DAQGRTALFY	ARQAGSQLCA	DILLQHGCPG
EGGSAATTPS	AATTPSITAT	PSPRRRSSAA	SVGRADAPVA	LV

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до активаторів гтфаз, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транспорт, транспорт білків, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з нуклеотидами, іонами металів, іоном цинку, ГТФ. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

Nagase T., Seki N., Ishikawa K., Tanaka A., Nomura N. (1996). Prediction of the coding sequences of unidentified human genes. V. The coding sequences of 40 new genes (KIAA0161-KIAA0200) deduced by analysis of cDNA clones from human cell line KG-1. DNA Res. 3: 17—24. PMID 8724849 DOI:10.1093/dnares/3.1.17
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Ahn J.-Y., Hu Y., Kroll T.G., Allard P., Ye K. (2004). PIKE-A is amplified in human cancers and prevents apoptosis by up-regulating Akt. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 101: 6993—6998. PMID 15118108 DOI:10.1073/pnas.0400921101
Nie Z., Fei J., Premont R.T., Randazzo P.A. (2005). The Arf GAPs AGAP1 and AGAP2 distinguish between the adaptor protein complexes AP-1 and AP-3. J. Cell Sci. 118: 3555—3566. PMID 16079295 DOI:10.1242/jcs.02486
Knobbe C.B., Trampe-Kieslich A., Reifenberger G. (2005). Genetic alteration and expression of the phosphoinositol-3-kinase/Akt pathway genes PIK3CA and PIKE in human glioblastomas. Neuropathol. Appl. Neurobiol. 31: 486—490. PMID 16150119 DOI:10.1111/j.1365-2990.2005.00660.x
Tang X., Feng Y., Ye K. (2007). Src-family tyrosine kinase fyn phosphorylates phosphatidylinositol 3-kinase enhancer-activating Akt, preventing its apoptotic cleavage and promoting cell survival. Cell Death Differ. 14: 368—377. PMID 16841086 DOI:10.1038/sj.cdd.4402011

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:16921 (англ.) . Процитовано 11 вересня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)
↑ UniProt, Q99490 (англ.) . Архів оригіналу за 25 вересня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.