AICDA |
---|
|
Наявні структури |
---|
PDB | Пошук ортологів: PDBe RCSB | | |
Ідентифікатори |
---|
Символи | AICDA, AID, ARP2, CDA2, HEL-S-284, HIGM2, activation-induced cytidine deaminase, activation induced cytidine deaminase |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 605257 MGI: 1342279 HomoloGene: 7623 GeneCards: AICDA |
---|
|
Пов'язані генетичні захворювання |
---|
hyper-IgM syndrome type 2[1] |
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • hydrolase activity, acting on carbon-nitrogen (but not peptide) bonds, in cyclic amidines • zinc ion binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • каталітична активність • hydrolase activity • ubiquitin protein ligase binding • зв'язування з іоном металу • cytidine deaminase activity • identical protein binding • RNA binding |
---|
Клітинна компонента | • Екзосома • клітинне ядро • цитоплазма • P-body • GO:0009327 protein-containing complex |
---|
Біологічний процес | • somatic hypermutation of immunoglobulin genes • DNA demethylation • mRNA processing • B cell differentiation • somatic diversification of immunoglobulins • negative regulation of DNA methylation-dependent heterochromatin assembly • cytidine deamination • cellular response to lipopolysaccharide • Перемикання класу імуноглобулінів • defense response to bacterium • regulation of DNA stability • negative regulation of transposition • cytidine to uridine editing • regulation of nuclear cell cycle DNA replication • negative regulation of single stranded viral RNA replication via double stranded DNA intermediate • defense response to virus • DNA cytosine deamination |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
![](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/4/49/PBB_GE_AICDA_219841_at_fs.png/250px-PBB_GE_AICDA_219841_at_fs.png) |
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | |
---|
RefSeq (білок) | | |
---|
Локус (UCSC) | Хр. 12: 8.6 – 8.61 Mb | Хр. 6: 122.53 – 122.54 Mb |
---|
PubMed search | [2] | [3] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
AICDA (англ. Activation induced cytidine deaminase) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 12-ї хромосоми. [4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 198 амінокислот, а молекулярна маса — 23 954[5].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MDSLLMNRRK | | FLYQFKNVRW | | AKGRRETYLC | | YVVKRRDSAT | | SFSLDFGYLR |
NKNGCHVELL | | FLRYISDWDL | | DPGRCYRVTW | | FTSWSPCYDC | | ARHVADFLRG |
NPNLSLRIFT | | ARLYFCEDRK | | AEPEGLRRLH | | RAGVQIAIMT | | FKDYFYCWNT |
FVENHERTFK | | AWEGLHENSV | | RLSRQLRRIL | | LPLYEVDDLR | | DAFRTLGL |
Кодований геном білок за функцією належить до гідролаз. Задіяний у такому біологічному процесі як процесінг мРНК. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.
Література
- Muto T., Muramatsu M., Taniwaki M., Kinoshita K., Honjo T. (2000). Isolation, tissue distribution, and chromosomal localization of the human activation-induced cytidine deaminase (hAID) gene. Genomics. 68: 85—88. PMID 10950930 DOI:10.1006/geno.2000.6268
- Martin A., Scharff M.D. (2002). Somatic hypermutation of the AID transgene in B and non-B cells. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 99: 12304—12308. PMID 12202747 DOI:10.1073/pnas.192442899
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Pasqualucci L., Kitaura Y., Gu H., Dalla-Favera R. (2006). PKA-mediated phosphorylation regulates the function of activation-induced deaminase (AID) in B cells. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 103: 395—400. PMID 16387847 DOI:10.1073/pnas.0509969103
- Guo J.U., Su Y., Zhong C., Ming G.L., Song H. (2011). Hydroxylation of 5-methylcytosine by TET1 promotes active DNA demethylation in the adult brain. Cell. 145: 423—434. PMID 21496894 DOI:10.1016/j.cell.2011.03.022
- Demorest Z.L., Li M., Harris R.S. (2011). Phosphorylation directly regulates the intrinsic DNA cytidine deaminase activity of activation-induced deaminase and APOBEC3G protein. J. Biol. Chem. 286: 26568—26575. PMID 21659520 DOI:10.1074/jbc.M111.235721
Примітки
- ↑ Захворювання, генетично пов'язані з AICDA переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:13203 (англ.) . Архів оригіналу за 4 квітня 2016. Процитовано 21 серпня 2017.
- ↑ UniProt, Q9GZX7 (англ.) . Архів оригіналу за 8 жовтня 2017. Процитовано 21 серпня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |