ARAP3 |
---|
|
Наявні структури |
---|
PDB | Пошук ортологів: PDBe RCSB | Список кодів PDB | 2KG5, 2LNW, 5JD0, 5JCP | | |
Ідентифікатори |
---|
Символи | ARAP3, CENTD3, DRAG1, ArfGAP with RhoGAP domain, ankyrin repeat and PH domain 3 |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 606647 MGI: 2147274 HomoloGene: 11199 GeneCards: ARAP3 |
---|
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • зв'язування з іоном металу • phosphatidylinositol-3,4-bisphosphate binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • GO:0005097, GO:0005099, GO:0005100 GTPase activator activity • phosphatidylinositol-3,4,5-trisphosphate binding |
---|
Клітинна компонента | • гіалоплазма • cell projection • мембрана • клітинна мембрана • цитоскелет • lamellipodium • ruffle • цитоплазма |
---|
Біологічний процес | • GO:0032320, GO:0032321, GO:0032855, GO:0043089, GO:0032854 positive regulation of GTPase activity • negative regulation of Rac protein signal transduction • cytoskeleton organization • regulation of small GTPase mediated signal transduction • vesicle-mediated transport • GO:0072468 сигнальна трансдукція • negative regulation of cell migration • negative regulation of Rho protein signal transduction • regulation of cell shape |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
|
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | |
---|
RefSeq (білок) | | |
---|
Локус (UCSC) | Хр. 5: 141.65 – 141.68 Mb | Хр. 18: 38.11 – 38.13 Mb |
---|
PubMed search | [1] | [2] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
ARAP3 (англ. ArfGAP with RhoGAP domain, ankyrin repeat and PH domain 3) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 5-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 544 амінокислот, а молекулярна маса — 169 844[4].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MAAPQDLDIA | | VWLATVHLEQ | | YADTFRRHGL | | ATAGAARGLG | | HEELKQLGIS |
ATGHRKRILR | | LLQTGTEEGS | | LDPKSDSAME | | PSPSPAPQAQ | | PPKPVPKPRT |
VFGGLSGPAT | | TQRPGLSPAL | | GGPGVSRSPE | | PSPRPPPLPT | | SSSEQSSALN |
TVEMMPNSIY | | FGLDSRGRAQ | | AAQDKAPDSS | | QISAPTPALR | | PTTGTVHIMD |
PGCLYYGVQP | | VGTPGAPDRR | | ESRGVCQGRA | | EHRLSRQDLE | | AREDAGYASL |
ELPGDSTLLS | | PTLETEETSD | | DLISPYASFS | | FTADRLTPLL | | SGWLDKLSPQ |
GNYVFQRRFV | | QFNGRSLMYF | | GSDKDPFPKG | | VIPLTAIEMT | | RSSKDNKFQV |
ITGQRVFVFR | | TESEAQRDMW | | CSTLQSCLKE | | QRLLGHPRPP | | QPPRPLRTGM |
LELRGHKAKV | | FAALSPGELA | | LYKSEQAFSL | | GIGICFIELQ | | GCSVRETKSR |
SFDLLTPHRC | | FSFTAESGGA | | RQSWAAALQE | | AVTETLSDYE | | VAEKIWSNRA |
NRQCADCGSS | | RPDWAAVNLG | | VVICKQCAGQ | | HRALGSGISK | | VQSLKLDTSV |
WSNEIVQLFI | | VLGNDRANRF | | WAGTLPPGEG | | LHPDATPGPR | | GEFISRKYRL |
GLFRKPHPQY | | PDHSQLLQAL | | CAAVARPNLL | | KNMTQLLCVE | | AFEGEEPWFP |
PAPDGSCPGL | | LPSDPSPGVY | | NEVVVRATYS | | GFLYCSPVSN | | KAGPSPPRRG |
RDAPPRLWCV | | LGAALEMFAS | | ENSPEPLSLI | | QPQDIVCLGV | | SPPPTDPGDR |
FPFSFELILA | | GGRIQHFGTD | | GADSLEAWTS | | AVGKWFSPLS | | CHQLLGPGLL |
RLGRLWLRSP | | SHTAPAPGLW | | LSGFGLLRGD | | HLFLCSAPGP | | GPPAPEDMVH |
LRRLQEISVV | | SAADTPDKKE | | HLVLVETGRT | | LYLQGEGRLD | | FTAWNAAIGG |
AAGGGGTGLQ | | EQQMSRGDIP | | IIVDACISFV | | TQHGLRLEGV | | YRKGGARARS |
LRLLAEFRRD | | ARSVKLRPGE | | HFVEDVTDTL | | KRFFRELDDP | | VTSARLLPRW |
REAAELPQKN | | QRLEKYKDVI | | GCLPRVNRRT | | LATLIGHLYR | | VQKCAALNQM |
CTRNLALLFA | | PSVFQTDGRG | | EHEVRVLQEL | | IDGYISVFDI | | DSDQVAQIDL |
EVSLITTWKD | | VQLSQAGDLI | | MEVYIEQQLP | | DNCVTLKVSP | | TLTAEELTNQ |
VLEMRGTAAG | | MDLWVTFEIR | | EHGELERPLH | | PKEKVLEQAL | | QWCQLPEPCS |
ASLLLKKVPL | | AQAGCLFTGI | | RRESPRVGLL | | RCREEPPRLL | | GSRFQERFFL |
LRGRCLLLLK | | EKKSSKPERE | | WPLEGAKVYL | | GIRKKLKPPT | | PWGFTLILEK |
MHLYLSCTDE | | DEMWDWTTSI | | LKAQHDDQQP | | VVLRRHSSSD | | LARQKFGTMP |
LLPIRGDDSG | | ATLLSANQTL | | RRLHNRRTLS | | MFFPMKSSQG | | SVEEQEELEE |
PVYEEPVYEE | | VGAFPELIQD | | TSTSFSTTRE | | WTVKPENPLT | | SQKSLDQPFL |
SKSSTLGQEE | | RPPEPPPGPP | | SKSSPQARGS | | LEEQLLQELS | | SLILRKGETT |
AGLGSPSQPS | | SPQSPSPTGL | | PTQTPGFPTQ | | PPCTSSPPSS | | QPLT |
Кодований геном білок за функціями належить до активаторів гтфаз, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як альтернативний сплайсинг, поліморфізм. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку. Локалізований у клітинній мембрані, цитоплазмі, цитоскелеті, мембрані, клітинних відростках.
Література
- Santy L.C., Casanova J.E. (2002). GTPase signaling: bridging the GAP between ARF and Rho. Curr. Biol. 12: R360—R362. PMID 12015138 DOI:10.1016/S0960-9822(02)00860-6
- Lu Q., Wei W., Kowalski P.E., Chang A.C.Y., Cohen S.N. (2004). EST-based genome-wide gene inactivation identifies ARAP3 as a host protein affecting cellular susceptibility to anthrax toxin. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 101: 17246—17251. PMID 15569923 DOI:10.1073/pnas.0407794101
- Leone M., Cellitti J., Pellecchia M. (2009). The Sam domain of the lipid phosphatase Ship2 adopts a common model to interact with Arap3-Sam and EphA2-Sam. BMC Struct. Biol. 9: 59—59. PMID 19765305 DOI:10.1186/1472-6807-9-59
Примітки
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:24097 (англ.) . Процитовано 5 вересня 2017.
{{cite web}}
: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання) - ↑ UniProt, Q8WWN8 (англ.) . Архів оригіналу за 17 серпня 2017. Процитовано 5 вересня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |
На цю статтю не посилаються інші статті Вікіпедії. Будь ласка розставте посилання відповідно до прийнятих рекомендацій. |