ARID5B
ARID5B | |||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| |||||||||||||||||
Ідентифікатори | |||||||||||||||||
Символи | ARID5B, DESRT, MRF-2, MRF2, AT-rich interaction domain 5B | ||||||||||||||||
Зовнішні ІД | OMIM: 608538 MGI: 2175912 HomoloGene: 45872 GeneCards: ARID5B | ||||||||||||||||
Пов'язані генетичні захворювання | |||||||||||||||||
ревматоїдний артрит, Гострий лімфобластний лейкоз, lymphoblastic leukemia[1] | |||||||||||||||||
| |||||||||||||||||
Ортологи | |||||||||||||||||
Види | Людина | Миша | |||||||||||||||
Entrez |
|
| |||||||||||||||
Ensembl |
|
| |||||||||||||||
UniProt |
|
| |||||||||||||||
RefSeq (мРНК) |
|
| |||||||||||||||
RefSeq (білок) |
|
| |||||||||||||||
Локус (UCSC) | Хр. 10: 61.9 – 62.1 Mb | Хр. 10: 67.93 – 68.11 Mb | |||||||||||||||
PubMed search | [2] | [3] | |||||||||||||||
Вікідані | |||||||||||||||||
|
ARID5B (англ. AT-rich interaction domain 5B) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 10-ї хромосоми.[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 188 амінокислот, а молекулярна маса — 132 375[5].
10 | 20 | 30 | 40 | 50 | ||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
MEPNSLQWVG | SPCGLHGPYI | FYKAFQFHLE | GKPRILSLGD | FFFVRCTPKD | ||||
PICIAELQLL | WEERTSRQLL | SSSKLYFLPE | DTPQGRNSDH | GEDEVIAVSE | ||||
KVIVKLEDLV | KWVHSDFSKW | RCGFHAGPVK | TEALGRNGQK | EALLKYRQST | ||||
LNSGLNFKDV | LKEKADLGED | EEETNVIVLS | YPQYCRYRSM | LKRIQDKPSS | ||||
ILTDQFALAL | GGIAVVSRNP | QILYCRDTFD | HPTLIENESI | CDEFAPNLKG | ||||
RPRKKKPCPQ | RRDSFSGVKD | SNNNSDGKAV | AKVKCEARSA | LTKPKNNHNC | ||||
KKVSNEEKPK | VAIGEECRAD | EQAFLVALYK | YMKERKTPIE | RIPYLGFKQI | ||||
NLWTMFQAAQ | KLGGYETITA | RRQWKHIYDE | LGGNPGSTSA | ATCTRRHYER | ||||
LILPYERFIK | GEEDKPLPPI | KPRKQENSSQ | ENENKTKVSG | TKRIKHEIPK | ||||
SKKEKENAPK | PQDAAEVSSE | QEKEQETLIS | QKSIPEPLPA | ADMKKKIEGY | ||||
QEFSAKPLAS | RVDPEKDNET | DQGSNSEKVA | EEAGEKGPTP | PLPSAPLAPE | ||||
KDSALVPGAS | KQPLTSPSAL | VDSKQESKLC | CFTESPESEP | QEASFPSFPT | ||||
TQPPLANQNE | TEDDKLPAMA | DYIANCTVKV | DQLGSDDIHN | ALKQTPKVLV | ||||
VQSFDMFKDK | DLTGPMNENH | GLNYTPLLYS | RGNPGIMSPL | AKKKLLSQVS | ||||
GASLSSSYPY | GSPPPLISKK | KLIARDDLCS | SLSQTHHGQS | TDHMAVSRPS | ||||
VIQHVQSFRS | KPSEERKTIN | DIFKHEKLSR | SDPHRCSFSK | HHLNPLADSY | ||||
VLKQEIQEGK | DKLLEKRALP | HSHMPSFLAD | FYSSPHLHSL | YRHTEHHLHN | ||||
EQTSKYPSRD | MYRESENSSF | PSHRHQEKLH | VNYLTSLHLQ | DKKSAAAEAP | ||||
TDDQPTDLSL | PKNPHKPTGK | VLGLAHSTTG | PQESKGISQF | QVLGSQSRDC | ||||
HPKACRVSPM | TMSGPKKYPE | SLSRSGKPHH | VRLENFRKME | GMVHPILHRK | ||||
MSPQNIGAAR | PIKRSLEDLD | LVIAGKKARA | VSPLDPSKEV | SGKEKASEQE | ||||
SEGSKAAHGG | HSGGGSEGHK | LPLSSPIFPG | LYSGSLCNSG | LNSRLPAGYS | ||||
HSLQYLKNQT | VLSPLMQPLA | FHSLVMQRGI | FTSPTNSQQL | YRHLAAATPV | ||||
GSSYGDLLHN | SIYPLAAINP | QAAFPSSQLS | SVHPSTKL |
Кодований геном білок за функціями належить до активаторів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у ядрі.
Література
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Whitson R.H., Huang T., Itakura K. (1999). The novel Mrf-2 DNA-binding domain recognizes a five-base core sequence through major and minor-groove contacts. Biochem. Biophys. Res. Commun. 258: 326—331. PMID 10329386 DOI:10.1006/bbrc.1999.0643
- Patsialou A., Wilsker D., Moran E. (2005). DNA-binding properties of ARID family proteins. Nucleic Acids Res. 33: 66—80. PMID 15640446 DOI:10.1093/nar/gki145
- Healy J., Richer C., Bourgey M., Kritikou E.A., Sinnett D. (2010). Replication analysis confirms the association of ARID5B with childhood B-cell acute lymphoblastic leukemia. Haematologica. 95: 1608—1611. PMID 20460642 DOI:10.3324/haematol.2010.022459
- Hendriks I.A., Treffers L.W., Verlaan-de Vries M., Olsen J.V., Vertegaal A.C. (2015). SUMO-2 orchestrates chromatin modifiers in response to DNA damage. Cell Rep. 10: 1778—1791. PMID 25772364 DOI:10.1016/j.celrep.2015.02.033
- Yuan Y.-C., Whitson R.H., Liu Q., Itakura K., Chen Y. (1998). A novel DNA-binding motif shares structural homology to DNA replication and repair nucleases and polymerases. Nat. Struct. Biol. 5: 959—964. PMID 9808040 DOI:10.1038/2934
Примітки
- ↑ Захворювання, генетично пов'язані з ARID5B переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:17362 (англ.) . Процитовано 8 вересня 2017.
{{cite web}}
: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання) - ↑ UniProt, Q14865 (англ.) . Архів оригіналу за 22 жовтня 2017. Процитовано 8 вересня 2017.
Див. також
- Хромосома 10
Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |