ASCC3 |
---|
|
Ідентифікатори |
---|
Символи | ASCC3, ASC1p200, HELIC1, RNAH, activating signal cointegrator 1 complex subunit 3 |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 614217 MGI: 1925237 HomoloGene: 4973 GeneCards: ASCC3 |
---|
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • nucleotide binding • GO:0043140 3'-5' DNA helicase activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • hydrolase activity • ATP binding • GO:0008026 helicase activity • nucleic acid binding • RNA binding |
---|
Клітинна компонента | • внутрішньоклітинний • мембрана • нуклеоплазма • клітинне ядро • гіалоплазма • activating signal cointegrator 1 complex • nuclear speck • цитоплазма • комплекс Ґольджі |
---|
Біологічний процес | • DNA dealkylation involved in DNA repair • DNA duplex unwinding • проліферація • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • transcription, DNA-templated • cellular response to DNA damage stimulus • GO:0100026 Репарація ДНК |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
|
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | NM_001284271 NM_006828 NM_022091 |
| |
---|
RefSeq (білок) | | NP_001271200 NP_006819 NP_071374 |
| |
---|
Локус (UCSC) | Хр. 6: 100.51 – 100.88 Mb | Хр. 10: 50.47 – 50.73 Mb |
---|
PubMed search | [1] | [2] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
ASCC3 (англ. Activating signal cointegrator 1 complex subunit 3) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 6-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 2 202 амінокислот, а молекулярна маса — 251 460[4].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MALPRLTGAL | | RSFSNVTKQD | | NYNEEVADLK | | IKRSKLHEQV | | LDLGLTWKKI |
IKFLNEKLEK | | SKMQSINEDL | | KDILHAAKQI | | VGTDNGREAI | | ESGAAFLFMT |
FHLKDSVGHK | | ETKAIKQMFG | | PFPSSSATAA | | CNATNRIISH | | FSQDDLTALV |
QMTEKEHGDR | | VFFGKNLAFS | | FDMHDLDHFD | | ELPINGETQK | | TISLDYKKFL |
NEHLQEACTP | | ELKPVEKTNG | | SFLWCEVEKY | | LNSTLKEMTE | | VPRVEDLCCT |
LYDMLASIKS | | GDELQDELFE | | LLGPEGLELI | | EKLLQNRITI | | VDRFLNSSND |
HRFQALQDNC | | KKILGENAKP | | NYGCQVTIQS | | EQEKQLMKQY | | RREEKRIARR |
EKKAGEDLEV | | SEGLMCFDPK | | ELRIQREQAL | | LNARSVPILS | | RQRDADVEKI |
HYPHVYDSQA | | EAMKTSAFIA | | GAKMILPEGI | | QRENNKLYEE | | VRIPYSEPMP |
LSFEEKPVYI | | QDLDEIGQLA | | FKGMKRLNRI | | QSIVFETAYN | | TNENMLICAP |
TGAGKTNIAM | | LTVLHEIRQH | | FQQGVIKKNE | | FKIVYVAPMK | | ALAAEMTDYF |
SRRLEPLGII | | VKELTGDMQL | | SKSEILRTQM | | LVTTPEKWDV | | VTRKSVGDVA |
LSQIVRLLIL | | DEVHLLHEDR | | GPVLESIVAR | | TLRQVESTQS | | MIRILGLSAT |
LPNYLDVATF | | LHVNPYIGLF | | FFDGRFRPVP | | LGQTFLGIKC | | ANKMQQLNNM |
DEVCYENVLK | | QVKAGHQVMV | | FVHARNATVR | | TAMSLIERAK | | NCGHIPFFFP |
TQGHDYVLAE | | KQVQRSRNKQ | | VRELFPDGFS | | IHHAGMLRQD | | RNLVENLFSN |
GHIKVLVCTA | | TLAWGVNLPA | | HAVIIKGTQI | | YAAKRGSFVD | | LGILDVMQIF |
GRAGRPQFDK | | FGEGIIITTH | | DKLSHYLTLL | | TQRNPIESQF | | LESLADNLNA |
EIALGTVTNV | | EEAVKWISYT | | YLYVRMRANP | | LAYGISHKAY | | QIDPTLRKHR |
EQLVIEVGRK | | LDKAQMIRFE | | ERTGYFSSTD | | LGRTASHYYI | | KYNTIETFNE |
LFDAHKTEGD | | IFAIVSKAEE | | FDQIKVREEE | | IEELDTLLSN | | FCELSTPGGV |
ENSYGKINIL | | LQTYISRGEM | | DSFSLISDSA | | YVAQNAARIV | | RALFEIALRK |
RWPTMTYRLL | | NLSKVIDKRL | | WGWASPLRQF | | SILPPHILTR | | LEEKKLTVDK |
LKDMRKDEIG | | HILHHVNIGL | | KVKQCVHQIP | | SVMMEASIQP | | ITRTVLRVTL |
SIYADFTWND | | QVHGTVGEPW | | WIWVEDPTND | | HIYHSEYFLA | | LKKQVISKEA |
QLLVFTIPIF | | EPLPSQYYIR | | AVSDRWLGAE | | AVCIINFQHL | | ILPERHPPHT |
ELLDLQPLPI | | TALGCKAYEA | | LYNFSHFNPV | | QTQIFHTLYH | | TDCNVLLGAP |
TGSGKTVAAE | | LAIFRVFNKY | | PTSKAVYIAP | | LKALVRERMD | | DWKVRIEEKL |
GKKVIELTGD | | VTPDMKSIAK | | ADLIVTTPEK | | WDGVSRSWQN | | RNYVQQVTIL |
IIDEIHLLGE | | ERGPVLEVIV | | SRTNFISSHT | | EKPVRIVGLS | | TALANARDLA |
DWLNIKQMGL | | FNFRPSVRPV | | PLEVHIQGFP | | GQHYCPRMAS | | MNKPAFQAIR |
SHSPAKPVLI | | FVSSRRQTRL | | TALELIAFLA | | TEEDPKQWLN | | MDEREMENII |
ATVRDSNLKL | | TLAFGIGMHH | | AGLHERDRKT | | VEELFVNCKV | | QVLIATSTLA |
WGVNFPAHLV | | IIKGTEYYDG | | KTRRYVDFPI | | TDVLQMMGRA | | GRPQFDDQGK |
AVILVHDIKK | | DFYKKFLYEP | | FPVESSLLGV | | LSDHLNAEIA | | GGTITSKQDA |
LDYITWTYFF | | RRLIMNPSYY | | NLGDVSHDSV | | NKFLSHLIEK | | SLIELELSYC |
IEIGEDNRSI | | EPLTYGRIAS | | YYYLKHQTVK | | MFKDRLKPEC | | STEELLSILS |
DAEEYTDLPV | | RHNEDHMNSE | | LAKCLPIESN | | PHSFDSPHTK | | AHLLLQAHLS |
RAMLPCPDYD | | TDTKTVLDQA | | LRVCQAMLDV | | AANQGWLVTV | | LNITNLIQMV |
IQGRWLKDSS | | LLTLPNIENH | | HLHLFKKWKP | | IMKGPHARGR | | TSIESLPELI |
HACGGKDHVF | | SSMVESELHA | | AKTKQAWNFL | | SHLPVINVGI | | SVKGSWDDLV |
EGHNELSVST | | LTADKRDDNK | | WIKLHADQEY | | VLQVSLQRVH | | FGFHKGKPES |
CAVTPRFPKS | | KDEGWFLILG | | EVDKRELIAL | | KRVGYIRNHH | | VASLSFYTPE |
IPGRYIYTLY | | FMSDCYLGLD | | QQYDIYLNVT | | QASLSAQVNT | | KVSDSLTDLA |
LK |
Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, геліказ, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, пошкодження ДНК, репарація ДНК, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами. Локалізований у ядрі.
Література
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Примітки
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:18697 (англ.) . Процитовано 6 вересня 2017.
{{cite web}}
: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання) - ↑ UniProt, Q8N3C0 (англ.) . Архів оригіналу за 10 серпня 2017. Процитовано 6 вересня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |