BAZ1A

Ідентифікатори

Символи

BAZ1A, ACF1, WALp1, WCRF180, hACF1, bromodomain adjacent to zinc finger domain 1A

Зовнішні ІД

OMIM: 605680 MGI: 1309478 HomoloGene: 45654 GeneCards: BAZ1A

Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:0001948, GO:0016582 protein binding • зв'язування з іоном металу • histone acetyltransferase activity
Клітинна компонента	• CHRAC • ACF complex • клітинне ядро
Біологічний процес	• DNA-dependent DNA replication • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • transcription, DNA-templated • ремоделювання хроматину • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II • histone acetylation
Джерела:Amigo / QuickGO

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


11177


217578

Ensembl


ENSG00000198604


ENSMUSG00000035021

UniProt


Q9NRL2


O88379

RefSeq (мРНК)


NM_013448 NM_182648


NM_013815

RefSeq (білок)


NP_038476 NP_872589


NP_038843

Локус (UCSC)

Хр. 14: 34.75 – 34.88 Mb

Хр. 12: 54.94 – 55.06 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

BAZ1A (англ. Bromodomain adjacent to zinc finger domain 1A) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 14-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 556 амінокислот, а молекулярна маса — 178 702^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MPLLHRKPFV	RQKPPADLRP	DEEVFYCKVT	NEIFRHYDDF	FERTILCNSL
VWSCAVTGRP	GLTYQEALES	EKKARQNLQS	FPEPLIIPVL	YLTSLTHRSR
LHEICDDIFA	YVKDRYFVEE	TVEVIRNNGA	RLQCRILEVL	PPSHQNGFAN
GHVNSVDGET	IIISDSDDSE	TQSCSFQNGK	KKDAIDPLLF	KYKVQPTKKE
LHESAIVKAT	QISRRKHLFS	RDKLKLFLKQ	HCEPQDGVIK	IKASSLSTYK
IAEQDFSYFF	PDDPPTFIFS	PANRRRGRPP	KRIHISQEDN	VANKQTLASY
RSKATKERDK	LLKQEEMKSL	AFEKAKLKRE	KADALEAKKK	EKEDKEKKRE
ELKKIVEEER	LKKKEEKERL	KVEREKEREK	LREEKRKYVE	YLKQWSKPRE
DMECDDLKEL	PEPTPVKTRL	PPEIFGDALM	VLEFLNAFGE	LFDLQDEFPD
GVTLEVLEEA	LVGNDSEGPL	CELLFFFLTA	IFQAIAEEEE	EVAKEQLTDA
DTKDLTEALD	EDADPTKSAL	SAVASLAAAW	PQLHQGCSLK	SLDLDSCTLS
EILRLHILAS	GADVTSANAK	YRYQKRGGFD	ATDDACMELR	LSNPSLVKKL
SSTSVYDLTP	GEKMKILHAL	CGKLLTLVST	RDFIEDYVDI	LRQAKQEFRE
LKAEQHRKER	EEAAARIRKR	KEEKLKEQEQ	KMKEKQEKLK	EDEQRNSTAD
ISIGEEERED	FDTSIESKDT	EQKELDQDMV	TEDEDDPGSH	KRGRRGKRGQ
NGFKEFTRQE	QINCVTREPL	TADEEEALKQ	EHQRKEKELL	EKIQSAIACT
NIFPLGRDRM	YRRYWIFPSI	PGLFIEEDYS	GLTEDMLLPR	PSSFQNNVQS
QDPQVSTKTG	EPLMSESTSN	IDQGPRDHSV	QLPKPVHKPN	RWCFYSSCEQ
LDQLIEALNS	RGHRESALKE	TLLQEKSRIC	AQLARFSEEK	FHFSDKPQPD
SKPTYSRGRS	SNAYDPSQMC	AEKQLELRLR	DFLLDIEDRI	YQGTLGAIKV
TDRHIWRSAL	ESGRYELLSE	ENKENGIIKT	VNEDVEEMEI	DEQTKVIVKD
RLLGIKTETP	STVSTNASTP	QSVSSVVHYL	AMALFQIEQG	IERRFLKAPL
DASDSGRSYK	TVLDRWRESL	LSSASLSQVF	LHLSTLDRSV	IWSKSILNAR
CKICRKKGDA	ENMVLCDGCD	RGHHTYCVRP	KLKTVPEGDW	FCPECRPKQR
SRRLSSRQRP	SLESDEDVED	SMGGEDDEVD	GDEEEGQSEE	EEYEVEQDED
DSQEEEEVSL	PKRGRPQVRL	PVKTRGKLSS	SFSSRGQQQE	PGRYPSRSQQ
STPKTTVSSK	TGRSLRKINS	APPTETKSLR	IASRSTRHSH	GPLQADVFVE
LLSPRRKRRG	RKSANNTPEN	SPNFPNFRVI	ATKSSEQSRS	VNIASKLSLQ
ESESKRRCRK	RQSPEPSPVT	LGRRSSGRQG	GVHELSAFEQ	LVVELVRHDD
SWPFLKLVSK	IQVPDYYDII	KKPIALNIIR	EKVNKCEYKL	ASEFIDDIEL
MFSNCFEYNP	RNTSEAKAGT	RLQAFFHIQA	QKLGLHVTPS	NVDQVSTPPA
AKKSRI

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку. Локалізований у ядрі.

Література

Jones M.H., Hamana N., Nezu J., Shimane M. (2000). A novel family of bromodomain genes. Genomics. 63: 40—45. PMID 10662543 DOI:10.1006/geno.1999.6071
Kukimoto I., Elderkin S., Grimaldi M., Oelgeschlager T., Varga-Weisz P.D. (2004). The histone-fold protein complex CHRAC-15/17 enhances nucleosome sliding and assembly mediated by ACF. Mol. Cell. 13: 265—277. PMID 14759371 DOI:10.1016/S1097-2765(03)00523-9
Yang J.G., Madrid T.S., Sevastopoulos E., Narlikar G.J. (2006). The chromatin-remodeling enzyme ACF is an ATP-dependent DNA length sensor that regulates nucleosome spacing. Nat. Struct. Mol. Biol. 13: 1078—1083. PMID 17099699 DOI:10.1038/nsmb1170
Ewing A.K., Attner M., Chakravarti D. (2007). Novel regulatory role for human Acf1 in transcriptional repression of vitamin D3 receptor-regulated genes. Mol. Endocrinol. 21: 1791—1806. PMID 17519354 DOI:10.1210/me.2007-0095

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:960 (англ.) . Архів оригіналу за 26 вересня 2016. Процитовано 11 вересня 2017.
↑ UniProt, Q9NRL2 (англ.) . Архів оригіналу за 27 вересня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.