C8orf4 : Література, Примітки, Див. також Вікіпедія

C8orf4

Ідентифікатори

Символи

TCIM, TC-1, TC1, C8orf4, chromosome 8 open reading frame 4, transcriptional and immune response regulator

Зовнішні ІД

OMIM: 607702 MGI: 1916318 HomoloGene: 10590 GeneCards: TCIM

Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:0001948, GO:0016582 protein binding • Notch binding
Клітинна компонента	• цитоплазма • nuclear speck • ядерце • клітинне ядро • нуклеоплазма • гіалоплазма • клітинна мембрана • внутрішньоклітинний
Біологічний процес	• regulation of cell cycle G1/S phase transition • endothelial cell activation involved in immune response • cellular response to heat • regulation of DNA-templated transcription in response to stress • regulation of hemopoiesis • negative regulation of Notch signaling pathway • GO:0097285 апоптоз • positive regulation of protein kinase A signaling • negative regulation of apoptotic process • positive regulation of protein kinase C activity • positive regulation of NIK/NF-kappaB signaling
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


56892


69068

Ensembl


ENSG00000176907


ENSMUSG00000056313

UniProt


Q9NR00


Q9D915

RefSeq (мРНК)


NM_020130


NM_026931

RefSeq (білок)


NP_064515


NP_081207

Локус (UCSC)

Хр. 8: 40.15 – 40.16 Mb

Хр. 8: 24.93 – 24.93 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

C8orf4 (англ. Chromosome 8 open reading frame 4) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 8-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 106 амінокислот, а молекулярна маса — 12 337^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MKAKRSHQAV	IMSTSLRVSP	SIHGYHFDTA	SRKKAVGNIF	ENTDQESLER
LFRNSGDKKA	EERAKIIFAI	DQDVEEKTRA	LMALKKRTKD	KLFQFLKLRK
YSIKVH

A: Аланін
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін

Y: Тирозин

Задіяний у такому біологічному процесі, як апоптоз. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

Chua E.L., Young L., Wu W.M., Turtle J.R., Dong Q. (2000). Cloning of TC-1 (C8orf4), a novel gene found to be overexpressed in thyroid cancer. Genomics. 69: 342—347. PMID 11056052 DOI:10.1006/geno.2000.6348
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:1357 (англ.) . Архів оригіналу за 16 листопада 2016. Процитовано 7 вересня 2017.
↑ UniProt, Q9NR00 (англ.) . Архів оригіналу за 2 березня 2017. Процитовано 7 вересня 2017.