CALCOCO1

Ідентифікатори

Символи

CALCOCO1, Cocoa, calphoglin, PP13275, calcium binding and coiled-coil domain 1

Зовнішні ІД

MGI: 1914738 HomoloGene: 10845 GeneCards: CALCOCO1

Пов'язані генетичні захворювання

Онтологія гена
Молекулярна функція	• sequence-specific DNA binding • beta-catenin binding • GO:0001105 transcription coactivator activity • chromatin binding • GO:0001104 transcription coregulator activity • protein C-terminus binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • nuclear receptor coactivator activity • armadillo repeat domain binding • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding
Клітинна компонента	• внутрішньоклітинна мембранна органела • клітинне ядро • цитоплазма • гіалоплазма
Біологічний процес	• GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • intracellular steroid hormone receptor signaling pathway • Wnt signaling pathway • transcription, DNA-templated • GO:0060469, GO:0009371 positive regulation of transcription, DNA-templated • GO:0072468 сигнальна трансдукція • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • GO:1901313 positive regulation of gene expression
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


57658


67488

Ensembl


ENSG00000012822


ENSMUSG00000023055

UniProt


Q9P1Z2


Q8CGU1

RefSeq (мРНК)


NM_001143682 NM_020898


NM_026192

RefSeq (білок)


NP_001137154 NP_065949


NP_080468

Локус (UCSC)

Хр. 12: 53.71 – 53.73 Mb

Хр. 15: 102.62 – 102.63 Mb

PubMed search

^[2]

^[3]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

CALCOCO1 (англ. Calcium binding and coiled-coil domain 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 12-ї хромосоми.^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 691 амінокислот, а молекулярна маса — 77 336^[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MEESPLSRAP	SRGGVNFLNV	ARTYIPNTKV	ECHYTLPPGT	MPSASDWIGI
FKVEAACVRD	YHTFVWSSVP	ESTTDGSPIH	TSVQFQASYL	PKPGAQLYQF
RYVNRQGQVC	GQSPPFQFRE	PRPMDELVTL	EEADGGSDIL	LVVPKATVLQ
NQLDESQQER	NDLMQLKLQL	EGQVTELRSR	VQELERALAT	ARQEHTELME
QYKGISRSHG	EITEERDILS	RQQGDHVARI	LELEDDIQTI	SEKVLTKEVE
LDRLRDTVKA	LTREQEKLLG	QLKEVQADKE	QSEAELQVAQ	QENHHLNLDL
KEAKSWQEEQ	SAQAQRLKDK	VAQMKDTLGQ	AQQRVAELEP	LKEQLRGAQE
LAASSQQKAT	LLGEELASAA	AARDRTIAEL	HRSRLEVAEV	NGRLAELGLH
LKEEKCQWSK	ERAGLLQSVE	AEKDKILKLS	AEILRLEKAV	QEERTQNQVF
KTELAREKDS	SLVQLSESKR	ELTELRSALR	VLQKEKEQLQ	EEKQELLEYM
RKLEARLEKV	ADEKWNEDAT	TEDEEAAVGL	SCPAALTDSE	DESPEDMRLP
PYGLCERGDP	GSSPAGPREA	SPLVVISQPA	PISPHLSGPA	EDSSSDSEAE
DEKSVLMAAV	QSGGEEANLL	LPELGSAFYD	MASGFTVGTL	SETSTGGPAT
PTWKECPICK	ERFPAESDKD	ALEDHMDGHF	FFSTQDPFTF	E

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до активаторів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, сигнальний шлях Wnt, альтернативний сплайсинг. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

Nagase T., Kikuno R., Ishikawa K., Hirosawa M., Ohara O. (2000). Prediction of the coding sequences of unidentified human genes. XVII. The complete sequences of 100 new cDNA clones from brain which code for large proteins in vitro. DNA Res. 7: 143—150. PMID 10819331 DOI:10.1093/dnares/7.2.143
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Takahashi K., Inuzuka M., Ingi T. (2004). Cellular signaling mediated by calphoglin-induced activation of IPP and PGM. Biochem. Biophys. Res. Commun. 325: 203—214. DOI:10.1016/J.BBRC.2004.10.021

Примітки

↑ Захворювання, генетично пов'язані з CALCOCO1 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:29306 (англ.) . Процитовано 11 вересня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)
↑ UniProt, Q9P1Z2 (англ.) . Архів оригіналу за 22 січня 2018. Процитовано 11 вересня 2017.