CAMK2B

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
3BHH

Ідентифікатори

Символи

CAMK2B, CAM2, CAMK2, CAMKB, calcium/calmodulin dependent protein kinase II beta, MRD54, CaMKIIbeta

Зовнішні ІД

OMIM: 607707 MGI: 88257 HomoloGene: 111050 GeneCards: CAMK2B

Пов'язані генетичні захворювання

остеоартроз, метаболічні захворювання, autosomal dominant mental retardation 54^[1]

Реагує на сполуку

staurosporine^[2]

Онтологія гена
Молекулярна функція	• transferase activity • nucleotide binding • protein kinase activity • protein homodimerization activity • kinase activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • actin binding • ATP binding • protein serine/threonine kinase activity • calmodulin-dependent protein kinase activity • calmodulin binding • identical protein binding
Клітинна компонента	• endocytic vesicle membrane • гіалоплазма • мембрана • клітинна мембрана • нуклеоплазма • центр організації мікротрубочок • sarcoplasmic reticulum membrane • sarcoplasmic reticulum • цитоскелет • цитоплазма • neuron projection • міжклітинні контакти • синапс
Біологічний процес	• диференціація клітин • regulation of synapse structural plasticity • regulation of calcium ion transport • regulation of long-term neuronal synaptic plasticity • interferon-gamma-mediated signaling pathway • фосфорилювання • нейробіологія розвитку • MAPK cascade • multicellular organism development • positive regulation of synapse maturation • protein phosphorylation • positive regulation of neuron projection development • protein autophosphorylation • regulation of skeletal muscle adaptation • positive regulation of dendritic spine morphogenesis • regulation of dendritic spine development • GO:0072468 сигнальна трансдукція • GO:0035404 peptidyl-serine phosphorylation • peptidyl-threonine phosphorylation • GO:0007243 intracellular signal transduction • regulation of neuron migration • regulation of cellular response to heat
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


816


12323

Ensembl


ENSG00000058404


ENSMUSG00000057897

UniProt


Q13554


P28652

RefSeq (мРНК)

NM_001220 NM_001293170 NM_172078 NM_172079 NM_172080
NM_172081 NM_172082 NM_172083 NM_172084


NM_001174053 NM_001174054 NM_007595

RefSeq (білок)

NP_001211 NP_001280099 NP_742075 NP_742076 NP_742077
NP_742078 NP_742079 NP_742080 NP_742081


NP_001167524 NP_001167525 NP_031621

Локус (UCSC)

Хр. 7: 44.22 – 44.33 Mb

Хр. 11: 5.92 – 6.02 Mb

PubMed search

^[3]

^[4]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

CAMK2B (англ. Calcium/calmodulin dependent protein kinase II beta) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 7-ї хромосоми.^[5] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 666 амінокислот, а молекулярна маса — 72 678^[6].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MATTVTCTRF	TDEYQLYEDI	GKGAFSVVRR	CVKLCTGHEY	AAKIINTKKL
SARDHQKLER	EARICRLLKH	SNIVRLHDSI	SEEGFHYLVF	DLVTGGELFE
DIVAREYYSE	ADASHCIQQI	LEAVLHCHQM	GVVHRDLKPE	NLLLASKCKG
AAVKLADFGL	AIEVQGDQQA	WFGFAGTPGY	LSPEVLRKEA	YGKPVDIWAC
GVILYILLVG	YPPFWDEDQH	KLYQQIKAGA	YDFPSPEWDT	VTPEAKNLIN
QMLTINPAKR	ITAHEALKHP	WVCQRSTVAS	MMHRQETVEC	LKKFNARRKL
KGAILTTMLA	TRNFSVGRQT	TAPATMSTAA	SGTTMGLVEQ	AKSLLNKKAD
GVKPQTNSTK	NSAAATSPKG	TLPPAALEPQ	TTVIHNPVDG	IKESSDSANT
TIEDEDAKAP	RVPDILSSVR	RGSGAPEAEG	PLPCPSPAPF	SPLPAPSPRI
SDILNSVRRG	SGTPEAEGPL	SAGPPPCLSP	ALLGPLSSPS	PRISDILNSV
RRGSGTPEAE	GPSPVGPPPC	PSPTIPGPLP	TPSRKQEIIK	TTEQLIEAVN
NGDFEAYAKI	CDPGLTSFEP	EALGNLVEGM	DFHRFYFENL	LAKNSKPIHT
TILNPHVHVI	GEDAACIAYI	RLTQYIDGQG	RPRTSQSEET	RVWHRRDGKW
QNVHFHCSGA	PVAPLQ

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до трансфераз, кіназ, серин/треонінових протеїнкіназ, білків розвитку, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як диференціація клітин, нейрогенез, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами, молекулою актину, молекулою кальмодуліну. Локалізований у цитоплазмі, цитоскелеті, мембрані, саркоплазматичному ретикулумі.

Література

Wang P., Wu Y., Zhou T.H., Sun Y., Pei G. (2000). Identification of alternative splicing variants of the beta subunit of human Ca(2+)/calmodulin-dependent protein kinase II with different activities. FEBS Lett. 475: 107—110. PMID 10858498 DOI:10.1016/S0014-5793(00)01634-3
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Tombes R.M., Krystal G.W. (1997). Identification of novel human tumor cell-specific CaMK-II variants. Biochim. Biophys. Acta. 1355: 281—292. PMID 9060999 DOI:10.1016/S0167-4889(96)00141-3
Krapivinsky G., Medina I., Krapivinsky L., Gapon S., Clapham D.E. (2004). SynGAP-MUPP1-CaMKII synaptic complexes regulate p38 MAP kinase activity and NMDA receptor-dependent synaptic AMPA receptor potentiation. Neuron. 43: 563—574. PMID 15312654 DOI:10.1016/j.neuron.2004.08.003
Rose A.J., Kiens B., Richter E.A. (2006). Ca2+-calmodulin-dependent protein kinase expression and signalling in skeletal muscle during exercise. J. Physiol. (Lond.). 574: 889—903. PMID 16690701 DOI:10.1113/jphysiol.2006.111757
Wayman G.A., Tokumitsu H., Davare M.A., Soderling T.R. (2011). Analysis of CaM-kinase signaling in cells. Cell Calcium. 50: 1—8. PMID 21529938 DOI:10.1016/j.ceca.2011.02.007

Примітки

↑ Захворювання, генетично пов'язані з CAMK2B переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
↑ Сполуки, які фізично взаємодіють з Calcium/calmodulin dependent protein kinase II beta переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:1461 (англ.) . Архів оригіналу за 26 березня 2016. Процитовано 7 вересня 2017.
↑ UniProt, Q13554 (англ.) . Архів оригіналу за 29 серпня 2017. Процитовано 7 вересня 2017.