CAMK2D

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
2VN9, 2W2C, 2WEL, 3GP2

Ідентифікатори

Символи

CAMK2D, CAMKD, calcium/calmodulin dependent protein kinase II delta

Зовнішні ІД

OMIM: 607708 MGI: 1341265 HomoloGene: 55561 GeneCards: CAMK2D

Пов'язані генетичні захворювання

хронічний лімфолейкоз^[1]

Онтологія гена
Молекулярна функція	• kinase activity • ATP binding • protein kinase activity • titin binding • transferase activity • protein homodimerization activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • nucleotide binding • sodium channel inhibitor activity • calmodulin-dependent protein kinase activity • protein serine/threonine kinase activity • transmembrane transporter binding • calmodulin binding • identical protein binding
Клітинна компонента	• endocytic vesicle membrane • мембрана • sarcoplasmic reticulum membrane • клітинна мембрана • нуклеоплазма • sarcoplasmic reticulum • Сарколема • neuron projection • клітинне ядро • цитоплазма • гіалоплазма • Кальцієві канали
Біологічний процес	• regulation of heart contraction • interferon-gamma-mediated signaling pathway • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II • regulation of membrane depolarization • positive regulation of cardiac muscle hypertrophy • protein phosphorylation • cellular response to calcium ion • regulation of cardiac muscle cell action potential involved in regulation of contraction • regulation of histone deacetylase activity • regulation of cellular localization • negative regulation of sodium ion transmembrane transport • фосфорилювання • regulation of the force of heart contraction • regulation of cardiac muscle contraction by regulation of the release of sequestered calcium ion • regulation of ryanodine-sensitive calcium-release channel activity • negative regulation of sodium ion transmembrane transporter activity • MAPK cascade • protein complex oligomerization • regulation of cell growth • regulation of cellular response to heat • regulation of cell communication by electrical coupling involved in cardiac conduction • regulation of heart rate by cardiac conduction • нейробіологія розвитку • диференціація клітин • regulation of cell communication by electrical coupling • positive regulation of cardiac muscle cell apoptotic process • regulation of release of sequestered calcium ion into cytosol by sarcoplasmic reticulum • GO:0035404 peptidyl-serine phosphorylation • peptidyl-threonine phosphorylation • endoplasmic reticulum calcium ion homeostasis • protein autophosphorylation • relaxation of cardiac muscle • cardiac muscle cell contraction • regulation of cardiac muscle cell action potential • regulation of relaxation of cardiac muscle • regulation of calcium ion transmembrane transport via high voltage-gated calcium channel
Джерела:Amigo / QuickGO

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


817


108058

Ensembl


ENSG00000145349


ENSMUSG00000053819

UniProt


Q13557


Q6PHZ2

RefSeq (мРНК)

NM_001221
NM_172114
NM_172115
NM_172127
NM_172128

NM_172129
NM_001321566
NM_001321567
NM_001321568
NM_001321569
NM_001321570
NM_001321571
NM_001321572
NM_001321573
NM_001321574
NM_001321575
NM_001321576
NM_001321577
NM_001321578
NM_001321579
NM_001321580
NM_001321581
NM_001321582
NM_001321583
NM_001321584
NM_001321585
NM_001321586
NM_001321587
NM_001321588
NM_001321589
NM_001321590
NM_001321591
NM_001321592
NM_001396964
NM_001396965
NM_001396966
NM_001396967
NM_001399855
NM_001399856
NM_001399857
NM_001399858
NM_001399859
NM_001399860
NM_001399861
NM_001399862
NM_001399863
NM_001399864
NM_001399865

NM_001025438 NM_001025439 NM_001293663 NM_001293664 NM_001293665
NM_001293666 NM_023813 NM_001346635 NM_001346636

RefSeq (білок)

NP_001212 NP_001308495 NP_001308496 NP_001308497 NP_001308498
NP_001308499 NP_001308500 NP_001308501 NP_001308502 NP_001308503 NP_001308504 NP_001308505 NP_001308506 NP_001308507 NP_001308508 NP_001308509 NP_001308510 NP_001308511 NP_001308512 NP_001308513 NP_001308514 NP_001308515 NP_001308516 NP_001308517 NP_001308518 NP_001308519 NP_001308520 NP_001308521 NP_742112 NP_742113 NP_742125 NP_742126 NP_742127

NP_001020609 NP_001020610 NP_001280592 NP_001280593 NP_001280594
NP_001280595 NP_001333564 NP_001333565 NP_076302

Локус (UCSC)

Хр. 4: 113.42 – 113.76 Mb

Хр. 3: 126.39 – 126.64 Mb

PubMed search

^[2]

^[3]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

CAMK2D (англ. Calcium/calmodulin dependent protein kinase II delta) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 4-ї хромосоми.^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 499 амінокислот, а молекулярна маса — 56 369^[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MASTTTCTRF	TDEYQLFEEL	GKGAFSVVRR	CMKIPTGQEY	AAKIINTKKL
SARDHQKLER	EARICRLLKH	PNIVRLHDSI	SEEGFHYLVF	DLVTGGELFE
DIVAREYYSE	ADASHCIQQI	LESVNHCHLN	GIVHRDLKPE	NLLLASKSKG
AAVKLADFGL	AIEVQGDQQA	WFGFAGTPGY	LSPEVLRKDP	YGKPVDMWAC
GVILYILLVG	YPPFWDEDQH	RLYQQIKAGA	YDFPSPEWDT	VTPEAKDLIN
KMLTINPAKR	ITASEALKHP	WICQRSTVAS	MMHRQETVDC	LKKFNARRKL
KGAILTTMLA	TRNFSAAKSL	LKKPDGVKES	TESSNTTIED	EDVKARKQEI
IKVTEQLIEA	INNGDFEAYT	KICDPGLTAF	EPEALGNLVE	GMDFHRFYFE
NALSKSNKPI	HTIILNPHVH	LVGDDAACIA	YIRLTQYMDG	SGMPKTMQSE
ETRVWHRRDG	KWQNVHFHRS	GSPTVPIKPP	CIPNGKENFS	GGTSLWQNI

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до трансфераз, кіназ, серин/треонінових протеїнкіназ, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як поліморфізм, ацетиляція, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами, молекулою кальмодуліну. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані, саркоплазматичному ретикулумі.

Література

Hoch B., Meyer R., Hetzer R., Krause E.-G., Karczewski P. (1999). Identification and expression of delta-isoforms of the multifunctional Ca2+/calmodulin-dependent protein kinase in failing and nonfailing human myocardium. Circ. Res. 84: 713—721. PMID 10189359 DOI:10.1161/01.RES.84.6.713
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Tombes R.M., Krystal G.W. (1997). Identification of novel human tumor cell-specific CaMK-II variants. Biochim. Biophys. Acta. 1355: 281—292. PMID 9060999 DOI:10.1016/S0167-4889(96)00141-3
Rose A.J., Kiens B., Richter E.A. (2006). Ca2+-calmodulin-dependent protein kinase expression and signalling in skeletal muscle during exercise. J. Physiol. (Lond.). 574: 889—903. PMID 16690701 DOI:10.1113/jphysiol.2006.111757
Little G.H., Bai Y., Williams T., Poizat C. (2007). Nuclear calcium/calmodulin-dependent protein kinase IIdelta preferentially transmits signals to histone deacetylase 4 in cardiac cells. J. Biol. Chem. 282: 7219—7231. PMID 17179159 DOI:10.1074/jbc.M604281200
Maier L.S., Bers D.M. (2007). Role of Ca2+/calmodulin-dependent protein kinase (CaMK) in excitation-contraction coupling in the heart. Cardiovasc. Res. 73: 631—640. PMID 17157285 DOI:10.1016/j.cardiores.2006.11.005

Примітки

↑ Захворювання, генетично пов'язані з CAMK2D переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:1462 (англ.) . Архів оригіналу за 10 травня 2017. Процитовано 30 серпня 2017.
↑ UniProt, Q13557 (англ.) . Архів оригіналу за 14 вересня 2017. Процитовано 30 серпня 2017.