CAPN10

Ідентифікатори

Символи

CAPN10, CANP10, NIDDM1, calpain 10

Зовнішні ІД

OMIM: 605286 MGI: 1344392 HomoloGene: 36323 GeneCards: CAPN10

Онтологія гена
Молекулярна функція	• cytoskeletal protein binding • GO:0070122 peptidase activity • cysteine-type peptidase activity • hydrolase activity • SNARE binding • calcium-dependent cysteine-type endopeptidase activity
Клітинна компонента	• внутрішньоклітинний • гіалоплазма • клітинна мембрана • мітохондрія • цитоплазма
Біологічний процес	• actin cytoskeleton reorganization • positive regulation of glucose import • cellular component disassembly involved in execution phase of apoptosis • positive regulation of intracellular transport • positive regulation of type B pancreatic cell apoptotic process • протеоліз • positive regulation of insulin secretion • cellular response to insulin stimulus • type B pancreatic cell apoptotic process
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


11132


23830

Ensembl


ENSG00000142330


ENSMUSG00000026270

UniProt


Q9HC96


Q9ESK3

RefSeq (мРНК)

NM_023089 NM_021251 NM_023083 NM_023084 NM_023085
NM_023086 NM_023087 NM_023088


NM_011796

RefSeq (білок)


NP_075571 NP_075573


NP_035926

Локус (UCSC)

Хр. 2: 240.59 – 240.62 Mb

Хр. 1: 92.86 – 92.88 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

CAPN10 (англ. Calpain 10) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 2-ї хромосоми. ^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 672 амінокислот, а молекулярна маса — 74 952^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MRAGRGATPA	RELFRDAAFP	AADSSLFCDL	STPLAQFRED	ITWRRPQEIC
ATPRLFPDDP	REGQVKQGLL	GDCWFLCACA	ALQKSRHLLD	QVIPPGQPSW
ADQEYRGSFT	CRIWQFGRWV	EVTTDDRLPC	LAGRLCFSRC	QREDVFWLPL
LEKVYAKVHG	SYEHLWAGQV	ADALVDLTGG	LAERWNLKGV	AGSGGQQDRP
GRWEHRTCRQ	LLHLKDQCLI	SCCVLSPRAG	ARELGEFHAF	IVSDLRELQG
QAGQCILLLR	IQNPWGRRCW	QGLWREGGEG	WSQVDAAVAS	ELLSQLQEGE
FWVEEEEFLR	EFDELTVGYP	VTEAGHLQSL	YTERLLCHTR	ALPGAWVKGQ
SAGGCRNNSG	FPSNPKFWLR	VSEPSEVYIA	VLQRSRLHAA	DWAGRARALV
GDSHTSWSPA	SIPGKHYQAV	GLHLWKVEKR	RVNLPRVLSM	PPVAGTACHA
YDREVHLRCE	LSPGYYLAVP	STFLKDAPGE	FLLRVFSTGR	VSLSAIRAVA
KNTTPGAALP	AGEWGTVQLR	GSWRVGQTAG	GSRNFASYPT	NPCFPFSVPE
GPGPRCVRIT	LHQHCRPSDT	EFHPIGFHIF	QVPEGGRSQD	APPLLLQEPL
LSCVPHRYAQ	EVSRLCLLPA	GTYKVVPSTY	LPDTEGAFTV	TIATRIDRPS
IHSQEMLGQF	LQEVSIMAVM	KT

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, протеаз, тіолових протеаз. Задіяний у таких біологічних процесах як поліморфізм, альтернативний сплайсинг.

Література

Nagase T., Nakayama M., Nakajima D., Kikuno R., Ohara O. (2001). Prediction of the coding sequences of unidentified human genes. XX. The complete sequences of 100 new cDNA clones from brain which code for large proteins in vitro. DNA Res. 8: 85—95. PMID 11347906 DOI:10.1093/dnares/8.2.85
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Hillman R.T., Green R.E., Brenner S.E. (2004). An unappreciated role for RNA surveillance. Genome Biol. 5: R8.1—R8.16. PMID 14759258 DOI:10.1186/gb-2004-5-2-r8
Brown A.E., Yeaman S.J., Walker M. (2007). Targeted suppression of calpain-10 expression impairs insulin-stimulated glucose uptake in cultured primary human skeletal muscle cells. Mol. Genet. Metab. 91: 318—324. PMID 17572128 DOI:10.1016/j.ymgme.2007.05.001

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:1477 (англ.) . Процитовано 28 серпня 2017.
↑ UniProt, Q9HC96 (англ.) . Архів оригіналу за 10 серпня 2017. Процитовано 28 серпня 2017.