CDC40 |
---|
|
Ідентифікатори |
---|
Символи | CDC40, EHB3, PRP17, PRPF17, cell division cycle 40, PCH15 |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 605585 MGI: 1918963 HomoloGene: 5716 GeneCards: CDC40 |
---|
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • RNA binding |
---|
Клітинна компонента | • catalytic step 2 spliceosome • spliceosomal complex • нуклеоплазма • клітинне ядро • U2-type catalytic step 2 spliceosome • nuclear speck |
---|
Біологічний процес | • mRNA splicing, via spliceosome • termination of RNA polymerase II transcription • mRNA processing • mRNA export from nucleus • mRNA 3'-end processing • Сплайсинг РНК • RNA export from nucleus |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
|
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | |
---|
RefSeq (білок) | | |
---|
Локус (UCSC) | Хр. 6: 110.18 – 110.25 Mb | Хр. 10: 40.71 – 40.76 Mb |
---|
PubMed search | [1] | [2] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
CDC40 (англ. Cell division cycle 40) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 6-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 579 амінокислот, а молекулярна маса — 65 521[4].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MSAAIAALAA | | SYGSGSGSES | | DSDSESSRCP | | LPAADSLMHL | | TKSPSSKPSL |
AVAVDSAPEV | | AVKEDLETGV | | HLDPAVKEVQ | | YNPTYETMFA | | PEFGPENPFR |
TQQMAAPRNM | | LSGYAEPAHI | | NDFMFEQQRR | | TFATYGYALD | | PSLDNHQVSA |
KYIGSVEEAE | | KNQGLTVFET | | GQKKTEKRKK | | FKENDASNID | | GFLGPWAKYV |
DEKDVAKPSE | | EEQKELDEIT | | AKRQKKGKQE | | EEKPGEEKTI | | LHVKEMYDYQ |
GRSYLHIPQD | | VGVNLRSTMP | | PEKCYLPKKQ | | IHVWSGHTKG | | VSAVRLFPLS |
GHLLLSCSMD | | CKIKLWEVYG | | ERRCLRTFIG | | HSKAVRDICF | | NTAGTQFLSA |
AYDRYLKLWD | | TETGQCISRF | | TNRKVPYCVK | | FNPDEDKQNL | | FVAGMSDKKI |
VQWDIRSGEI | | VQEYDRHLGA | | VNTIVFVDEN | | RRFVSTSDDK | | SLRVWEWDIP |
VDFKYIAEPS | | MHSMPAVTLS | | PNGKWLACQS | | MDNQILIFGA | | QNRFRLNKKK |
IFKGHMVAGY | | ACQVDFSPDM | | SYVISGDGNG | | KLNIWDWKTT | | KLYSRFKAHD |
KVCIGAVWHP | | HETSKVITCG | | WDGLIKLWD |
Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як процесинг мРНК, сплайсинг мРНК. Локалізований у ядрі.
Література
- Zhou Z., Reed R. (1998). Human homologs of yeast prp16 and prp17 reveal conservation of the mechanism for catalytic step II of pre-mRNA splicing. EMBO J. 17: 2095—2106. PMID 9524131 DOI:10.1093/emboj/17.7.2095
- Lindsey L.A., Garcia-Blanco M.A. (1998). Functional conservation of the human homolog of the yeast pre-mRNA splicing factor Prp17p. J. Biol. Chem. 273: 32771—32775. PMID 9830021 DOI:10.1074/jbc.273.49.32771
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Jurica M.S., Licklider L.J., Gygi S.P., Grigorieff N., Moore M.J. (2002). Purification and characterization of native spliceosomes suitable for three-dimensional structural analysis. RNA. 8: 426—439. PMID 11991638 DOI:10.1017/S1355838202021088
Примітки
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:17350 (англ.) . Процитовано 6 вересня 2017.
{{cite web}}
: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання) - ↑ UniProt, O60508 (англ.) . Архів оригіналу за 19 жовтня 2017. Процитовано 6 вересня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |