CDC42

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
4YDH, 1A4R, 1AJE, 1AM4, 1AN0, 1CEE, 1CF4, 1DOA, 1E0A, 1EES, 1GRN, 1GZS, 1KI1, 1KZ7, 1KZG, 1NF3, 2ASE, 2DFK, 2KB0, 2NGR, 2ODB, 2QRZ, 2WM9, 2WMN, 2WMO, 3GCG, 3QBV, 3VHL, 4DID, 4ITR, 4JS0, 4YC7, 5FI1

Ідентифікатори

Символи

CDC42, CDC42Hs, G25K, TKS, cell division cycle 42

Зовнішні ІД

OMIM: 116952 HomoloGene: 123986 GeneCards: CDC42

Пов'язані генетичні захворювання

macrothrombocytopenia-lymphedema-developmental delay-facial dysmorphism-camptodactyly syndrome^[1]

Онтологія гена
Молекулярна функція	• Rho GDP-dissociation inhibitor binding • GO:1904264, GO:1904822, GO:0090622, GO:0090302 ubiquitin protein ligase activity • apolipoprotein A-I receptor binding • GTP-dependent protein binding • GO:0006184 GTPase activity • mitogen-activated protein kinase kinase kinase binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • thioesterase binding • protein kinase binding • nucleotide binding • GTP binding • identical protein binding • protein serine/threonine kinase activity • GBD domain binding
Клітинна компонента	• цитоплазма • гіалоплазма • мембрана • cell-cell junction • focal adhesion • центр організації мікротрубочок • spindle midzone • neuron projection • storage vacuole • цитоскелет • cell projection • myelin sheath • екзосома • Філоподія • клітинна мембрана • веретено поділу • apical part of cell • secretory granule • neuronal cell body • cytoplasmic ribonucleoprotein granule • mitotic spindle • leading edge membrane • cell periphery • endoplasmic reticulum membrane • Golgi membrane • midbody • центросома • cell cortex • Golgi transport complex • GO:0009327 protein-containing complex • dendritic spine
Біологічний процес	• cardiac conduction system development • positive regulation of protein phosphorylation • negative regulation of epidermal growth factor receptor signaling pathway • positive regulation of muscle cell differentiation • nuclear migration • keratinization • positive regulation of JNK cascade • establishment of Golgi localization • actin filament bundle assembly • positive regulation of neuron apoptotic process • vascular endothelial growth factor receptor signaling pathway • hair follicle morphogenesis • heart contraction • regulation of protein stability • neuron fate determination • substantia nigra development • Fc-gamma receptor signaling pathway involved in phagocytosis • actin filament organization • GO:0106160 negative regulation of protein-containing complex assembly • epithelial-mesenchymal cell signaling • actin filament branching • negative regulation of gene expression • positive regulation of peptidyl-serine phosphorylation • establishment or maintenance of cell polarity • positive regulation of cell growth • regulation of protein metabolic process • establishment or maintenance of apical/basal cell polarity • regulation of protein kinase activity • regulation of attachment of spindle microtubules to kinetochore • regulation of small GTPase mediated signal transduction • positive regulation of hair follicle cell proliferation • positive regulation of MAPK cascade • regulation of mitotic nuclear division • hair follicle placode formation • positive regulation of intracellular protein transport • диференціація клітин • positive regulation of epithelial cell proliferation involved in lung morphogenesis • regulation of protein heterodimerization activity • Golgi organization • positive regulation of synapse structural plasticity • multicellular organism growth • epidermis morphogenesis • nucleus localization • epithelial cell-cell adhesion • sprouting angiogenesis • нейробіологія розвитку • macrophage differentiation • dendritic cell migration • positive regulation of cytokinesis • positive regulation of DNA replication • Wnt signaling pathway, planar cell polarity pathway • keratinocyte development • GO:1903362 regulation of protein catabolic process • canonical Wnt signaling pathway • adherens junction organization • organelle transport along microtubule • actin cytoskeleton organization • regulation of filopodium assembly • ендоцитоз • ephrin receptor signaling pathway • filopodium assembly • T cell costimulation • зсідання крові • positive regulation of phosphatidylinositol 3-kinase activity • positive regulation of substrate adhesion-dependent cell spreading • GO:1901313 positive regulation of gene expression • positive regulation of pseudopodium assembly • submandibular salivary gland formation • viral RNA genome replication • small GTPase mediated signal transduction • Убіквітин-залежний протеоліз • GO:0048554 positive regulation of catalytic activity • protein phosphorylation • phagocytosis, engulfment • integrin-mediated signaling pathway • Rho protein signal transduction • regulation of cell shape • regulation of lamellipodium assembly • positive regulation of lamellipodium assembly • cell projection assembly • Cdc42 protein signal transduction • regulation of actin cytoskeleton organization • cell junction assembly • interleukin-12-mediated signaling pathway • neuropilin signaling pathway • establishment of epithelial cell apical/basal polarity • positive regulation of filopodium assembly • regulation of stress fiber assembly • positive regulation of stress fiber assembly • dendritic spine morphogenesis • modification of synaptic structure • positive regulation of actin cytoskeleton reorganization
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


998


850930

Ensembl


ENSG00000070831


YLR229C

UniProt


P60953


P19073

RefSeq (мРНК)


NM_044472 NM_001039802 NM_001791


NM_001182116

RefSeq (білок)


NP_001034891 NP_001782 NP_426359


NP_013330

Локус (UCSC)

Хр. 1: 22.05 – 22.1 Mb

н/д

PubMed search

^[2]

^[3]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

CDC42 (англ. Cell division cycle 42) — білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. ^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 191 амінокислот, а молекулярна маса — 21 259^[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MQTIKCVVVG	DGAVGKTCLL	ISYTTNKFPS	EYVPTVFDNY	AVTVMIGGEP
YTLGLFDTAG	QEDYDRLRPL	SYPQTDVFLV	CFSVVSPSSF	ENVKEKWVPE
ITHHCPKTPF	LLVGTQIDLR	DDPSTIEKLA	KNKQKPITPE	TAEKLARDLK
AVKYVECSAL	TQKGLKNVFD	EAILAALEPP	EPKKSRRCVL	L

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у таких біологічних процесах як диференціація, нейрогенез. Білок має сайт для зв'язування з нуклеотидами, ГТФ. Локалізований у клітинній мембрані, цитоплазмі, цитоскелеті, мембрані.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Kwong C.H., Malech H.L., Rotrosen D., Leto T.L. (1993). Regulation of the human neutrophil NADPH oxidase by rho-related G-proteins. Biochemistry. 32: 5711—5717. PMID 8504089 DOI:10.1021/bi00072a029
Polakis P.G., Snyderman R., Evans T. (1989). Characterization of G25K, a GTP-binding protein containing a novel putative nucleotide binding domain. Biochem. Biophys. Res. Commun. 160: 25—32. PMID 2496687 DOI:10.1016/0006-291X(89)91615-X
Joberty G., Perlungher R.R., Macara I.G. (1999). The Borgs, a new family of Cdc42 and TC10 GTPase-interacting proteins. Mol. Cell. Biol. 19: 6585—6597. PMID 10490598 DOI:10.1128/MCB.19.10.6585
Pirone D.M., Fukuhara S., Gutkind J.S., Burbelo P.D. (2000). SPECs, small binding proteins for Cdc42. J. Biol. Chem. 275: 22650—22656. PMID 10816584 DOI:10.1074/jbc.M002832200
Miki H., Yamaguchi H., Suetsugu S., Takenawa T. (2000). IRSp53 is an essential intermediate between Rac and WAVE in the regulation of membrane ruffling. Nature. 408: 732—735. PMID 11130076 DOI:10.1038/35047107

Примітки

↑ Захворювання, генетично пов'язані з CDC42 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:1736 (англ.) . Архів оригіналу за 10 жовтня 2017. Процитовано 21 серпня 2017.
↑ UniProt, P60953 (англ.) . Архів оригіналу за 22 липня 2017. Процитовано 21 серпня 2017.