CDH16

Ідентифікатори

Символи

CDH16, cadherin 16

Зовнішні ІД

OMIM: 603118 MGI: 106671 HomoloGene: 2997 GeneCards: CDH16

Онтологія гена
Молекулярна функція	• calcium ion binding • зв'язування з іоном металу
Клітинна компонента	• integral component of membrane • клітинна мембрана • екзосома • мембрана • integral component of plasma membrane • basolateral plasma membrane
Біологічний процес	• calcium-dependent cell-cell adhesion via plasma membrane cell adhesion molecules • адгезія клітин • homophilic cell adhesion via plasma membrane adhesion molecules • cell-cell signaling • нейробіологія розвитку
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


1014


12556

Ensembl


ENSG00000166589


ENSMUSG00000031881

UniProt


O75309


O88338

RefSeq (мРНК)


NM_001204744 NM_001204745 NM_001204746 NM_004062


NM_001252627 NM_001252628 NM_007663

RefSeq (білок)


NP_001191673 NP_001191674 NP_001191675 NP_004053


NP_001239556 NP_001239557 NP_031689

Локус (UCSC)

Хр. 16: 66.91 – 66.92 Mb

Хр. 8: 105.33 – 105.35 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

CDH16 (англ. Cadherin 16) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 16-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 829 амінокислот, а молекулярна маса — 89 923^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MVPAWLWLLC	VSVPQALPKA	QPAELSVEVP	ENYGGNFPLY	LTKLPLPREG
AEGQIVLSGD	SGKATEGPFA	MDPDSGFLLV	TRALDREEQA	EYQLQVTLEM
QDGHVLWGPQ	PVLVHVKDEN	DQVPHFSQAI	YRARLSRGTR	PGIPFLFLEA
SDRDEPGTAN	SDLRFHILSQ	APAQPSPDMF	QLEPRLGALA	LSPKGSTSLD
HALERTYQLL	VQVKDMGDQA	SGHQATATVE	VSIIESTWVS	LEPIHLAENL
KVLYPHHMAQ	VHWSGGDVHY	HLESHPPGPF	EVNAEGNLYV	TRELDREAQA
EYLLQVRAQN	SHGEDYAAPL	ELHVLVMDEN	DNVPICPPRD	PTVSIPELSP
PGTEVTRLSA	EDADAPGSPN	SHVVYQLLSP	EPEDGVEGRA	FQVDPTSGSV
TLGVLPLRAG	QNILLLVLAM	DLAGAEGGFS	STCEVEVAVT	DINDHAPEFI
TSQIGPISLP	EDVEPGTLVA	MLTAIDADLE	PAFRLMDFAI	ERGDTEGTFG
LDWEPDSGHV	RLRLCKNLSY	EAAPSHEVVV	VVQSVAKLVG	PGPGPGATAT
VTVLVERVMP	PPKLDQESYE	ASVPISAPAG	SFLLTIQPSD	PISRTLRFSL
VNDSEGWLCI	EKFSGEVHTA	QSLQGAQPGD	TYTVLVEAQD	TDEPRLSASA
PLVIHFLKAP	PAPALTLAPV	PSQYLCTPRQ	DHGLIVSGPS	KDPDLASGHG
PYSFTLGPNP	TVQRDWRLQT	LNGSHAYLTL	ALHWVEPREH	IIPVVVSHNA
QMWQLLVRVI	VCRCNVEGQC	MRKVGRMKGM	PTKLSAVGIL	VGTLVAIGIF
LILIFTHWTM	SRKKDPDQPA	DSVPLKATV

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як клітинна адгезія, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном кальцію. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:1755 (англ.) . Архів оригіналу за 13 березня 2016. Процитовано 11 вересня 2017.
↑ UniProt, O75309 (англ.) . Архів оригіналу за 30 грудня 2016. Процитовано 11 вересня 2017.