CDH17

Ідентифікатори

Символи

CDH17, CDH16, HPT-1, HPT1, cadherin 17

Зовнішні ІД

OMIM: 603017 MGI: 1095414 HomoloGene: 56859 GeneCards: CDH17

Онтологія гена
Молекулярна функція	• calcium ion binding • transporter activity • зв'язування з іоном металу • integrin binding • proton-dependent oligopeptide secondary active transmembrane transporter activity • cytoskeletal protein binding • protein homodimerization activity • cadherin binding
Клітинна компонента	• integral component of membrane • мембрана • cell surface • клітинна мембрана • basolateral plasma membrane • клітинне ядро • міжклітинні контакти • catenin complex
Біологічний процес	• spleen development • marginal zone B cell differentiation • integrin-mediated signaling pathway • positive regulation of integrin activation by cell surface receptor linked signal transduction • germinal center B cell differentiation • B cell differentiation • adherens junction organization • oligopeptide transport • calcium-dependent cell-cell adhesion via plasma membrane cell adhesion molecules • oligopeptide transmembrane transport • homophilic cell adhesion via plasma membrane adhesion molecules • адгезія клітин • cell-cell junction assembly • cell-cell adhesion mediated by cadherin • cell-cell adhesion • GO:0000767 cell morphogenesis
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


1015


12557

Ensembl


ENSG00000079112


ENSMUSG00000028217

UniProt


Q12864


Q9R100

RefSeq (мРНК)


NM_001144663 NM_004063


NM_019753

RefSeq (білок)


NP_001138135 NP_004054


NP_062727

Локус (UCSC)

Хр. 8: 94.13 – 94.22 Mb

Хр. 4: 11.76 – 11.82 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

CDH17 (англ. Cadherin 17) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 8-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 832 амінокислот, а молекулярна маса — 92 219^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MILQAHLHSL	CLLMLYLATG	YGQEGKFSGP	LKPMTFSIYE	GQEPSQIIFQ
FKANPPAVTF	ELTGETDNIF	VIEREGLLYY	NRALDRETRS	THNLQVAALD
ANGIIVEGPV	PITIKVKDIN	DNRPTFLQSK	YEGSVRQNSR	PGKPFLYVNA
TDLDDPATPN	GQLYYQIVIQ	LPMINNVMYF	QINNKTGAIS	LTREGSQELN
PAKNPSYNLV	ISVKDMGGQS	ENSFSDTTSV	DIIVTENIWK	APKPVEMVEN
STDPHPIKIT	QVRWNDPGAQ	YSLVDKEKLP	RFPFSIDQEG	DIYVTQPLDR
EEKDAYVFYA	VAKDEYGKPL	SYPLEIHVKV	KDINDNPPTC	PSPVTVFEVQ
ENERLGNSIG	TLTAHDRDEE	NTANSFLNYR	IVEQTPKLPM	DGLFLIQTYA
GMLQLAKQSL	KKQDTPQYNL	TIEVSDKDFK	TLCFVQINVI	DINDQIPIFE
KSDYGNLTLA	EDTNIGSTIL	TIQATDADEP	FTGSSKILYH	IIKGDSEGRL
GVDTDPHTNT	GYVIIKKPLD	FETAAVSNIV	FKAENPEPLV	FGVKYNASSF
AKFTLIVTDV	NEAPQFSQHV	FQAKVSEDVA	IGTKVGNVTA	KDPEGLDISY
SLRGDTRGWL	KIDHVTGEIF	SVAPLDREAG	SPYRVQVVAT	EVGGSSLSSV
SEFHLILMDV	NDNPPRLAKD	YTGLFFCHPL	SAPGSLIFEA	TDDDQHLFRG
PHFTFSLGSG	SLQNDWEVSK	INGTHARLST	RHTEFEEREY	VVLIRINDGG
RPPLEGIVSL	PVTFCSCVEG	SCFRPAGHQT	GIPTVGMAVG	ILLTTLLVIG
IILAVVFIRI	KKDKGKDNVE	SAQASEVKPL	RS

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у таких біологічних процесах, як клітинна адгезія, транспорт. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном кальцію. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:1756 (англ.) . Архів оригіналу за 28 серпня 2017. Процитовано 7 вересня 2017.
↑ UniProt, Q12864 (англ.) . Архів оригіналу за 25 серпня 2017. Процитовано 7 вересня 2017.