CDH6

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
3LND

Ідентифікатори

Символи

CDH6, CAD6, KCAD, cadherin 6

Зовнішні ІД

OMIM: 603007 MGI: 107435 HomoloGene: 21027 GeneCards: CDH6

Онтологія гена
Молекулярна функція	• calcium ion binding • зв'язування з іоном металу • cytoskeletal protein binding • protein homodimerization activity • cadherin binding
Клітинна компонента	• integral component of membrane • клітинна мембрана • мембрана • cell surface • catenin complex
Біологічний процес	• Сигнальний шлях Notch • адгезія клітин • adherens junction organization • homophilic cell adhesion via plasma membrane adhesion molecules • cell-cell junction assembly • calcium-dependent cell-cell adhesion via plasma membrane cell adhesion molecules • cell-cell adhesion mediated by cadherin • cell-cell adhesion • GO:0000767 cell morphogenesis
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


1004


12563

Ensembl


ENSG00000113361


ENSMUSG00000039385

UniProt


P55285


P97326

RefSeq (мРНК)


NM_004932 NM_001362435


NM_007666

RefSeq (білок)


NP_004923 NP_001349364


NP_031692

Локус (UCSC)

Хр. 5: 31.19 – 31.33 Mb

Хр. 15: 13.03 – 13.17 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

CDH6 (англ. Cadherin 6) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 5-ї хромосоми. ^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 790 амінокислот, а молекулярна маса — 88 309^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MRTYRYFLLL	FWVGQPYPTL	STPLSKRTSG	FPAKKRALEL	SGNSKNELNR
SKRSWMWNQF	FLLEEYTGSD	YQYVGKLHSD	QDRGDGSLKY	ILSGDGAGDL
FIINENTGDI	QATKRLDREE	KPVYILRAQA	INRRTGRPVE	PESEFIIKIH
DINDNEPIFT	KEVYTATVPE	MSDVGTFVVQ	VTATDADDPT	YGNSAKVVYS
ILQGQPYFSV	ESETGIIKTA	LLNMDRENRE	QYQVVIQAKD	MGGQMGGLSG
TTTVNITLTD	VNDNPPRFPQ	STYQFKTPES	SPPGTPIGRI	KASDADVGEN
AEIEYSITDG	EGLDMFDVIT	DQETQEGIIT	VKKLLDFEKK	KVYTLKVEAS
NPYVEPRFLY	LGPFKDSATV	RIVVEDVDEP	PVFSKLAYIL	QIREDAQINT
TIGSVTAQDP	DAARNPVKYS	VDRHTDMDRI	FNIDSGNGSI	FTSKLLDRET
LLWHNITVIA	TEINNPKQSS	RVPLYIKVLD	VNDNAPEFAE	FYETFVCEKA
KADQLIQTLH	AVDKDDPYSG	HQFSFSLAPE	AASGSNFTIQ	DNKDNTAGIL
TRKNGYNRHE	MSTYLLPVVI	SDNDYPVQSS	TGTVTVRVCA	CDHHGNMQSC
HAEALIHPTG	LSTGALVAIL	LCIVILLVTV	VLFAALRRQR	KKEPLIISKE
DIRDNIVSYN	DEGGGEEDTQ	AFDIGTLRNP	EAIEDNKLRR	DIVPEALFLP
RRTPTARDNT	DVRDFINQRL	KENDTDPTAP	PYDSLATYAY	EGTGSVADSL
SSLESVTTDA	DQDYDYLSDW	GPRFKKLADM	YGGVDSDKDS

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як клітинна адгезія, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном кальцію. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Shimoyama Y., Gotoh M., Terasaki T., Kitajima M., Hirohashi S. (1995). Isolation and sequence analysis of human cadherin-6 complementary DNA for the full coding sequence and its expression in human carcinoma cells. Cancer Res. 55: 2206—2211. PMID 7743525
Suzuki S., Sano K., Tanihara H. (1991). Diversity of the cadherin family: evidence for eight new cadherins in nervous tissue. Cell Regul. 2: 261—270. PMID 2059658

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:1765 (англ.) . Архів оригіналу за 22 березня 2016. Процитовано 31 серпня 2017.
↑ UniProt, P55285 (англ.) . Архів оригіналу за 12 грудня 2017. Процитовано 31 серпня 2017.