CELSR1 |
---|
|
Ідентифікатори |
---|
Символи | CELSR1, CDHF9, FMI2, HFMI2, ME2, ADGRC1, cadherin EGF LAG seven-pass G-type receptor 1, LMPHM9 |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 604523 MGI: 1100883 HomoloGene: 7665 GeneCards: CELSR1 |
---|
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • calcium ion binding • G protein-coupled receptor activity • protein dimerization activity • signal transducer activity • transmembrane signaling receptor activity |
---|
Клітинна компонента | • integral component of membrane • мембрана • клітинна мембрана • integral component of plasma membrane • нуклеоплазма |
---|
Біологічний процес | • hair follicle development • planar dichotomous subdivision of terminal units involved in lung branching morphogenesis • G protein-coupled receptor signaling pathway • lateral sprouting involved in lung morphogenesis • regulation of actin cytoskeleton organization • locomotory behavior • orthogonal dichotomous subdivision of terminal units involved in lung branching morphogenesis • establishment of planar polarity of embryonic epithelium • establishment of planar polarity • Загоєння ран • neuron migration • establishment of body hair planar orientation • planar cell polarity pathway involved in neural tube closure • multicellular organism development • Wnt signaling pathway, planar cell polarity pathway • central nervous system development • cell surface receptor signaling pathway • neural tube closure • адгезія клітин • inner ear morphogenesis • apical protein localization • Rho protein signal transduction • anterior/posterior pattern specification • GO:0072468 сигнальна трансдукція • homophilic cell adhesion via plasma membrane adhesion molecules • protein localization involved in establishment of planar polarity • cell-cell adhesion |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
|
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | |
---|
RefSeq (білок) | | |
---|
Локус (UCSC) | Хр. 22: 46.36 – 46.54 Mb | Хр. 15: 85.78 – 85.92 Mb |
---|
PubMed search | [1] | [2] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
CELSR1 (англ. Cadherin EGF LAG seven-pass G-type receptor 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 22-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 3 014 амінокислот, а молекулярна маса — 329 486[4].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MAPPPPPVLP | | VLLLLAAAAA | | LPAMGLRAAA | | WEPRVPGGTR | | AFALRPGCTY |
AVGAACTPRA | | PRELLDVGRD | | GRLAGRRRVS | | GAGRPLPLQV | | RLVARSAPTA |
LSRRLRARTH | | LPGCGARARL | | CGTGARLCGA | | LCFPVPGGCA | | AAQHSALAAP |
TTLPACRCPP | | RPRPRCPGRP | | ICLPPGGSVR | | LRLLCALRRA | | AGAVRVGLAL |
EAATAGTPSA | | SPSPSPPLPP | | NLPEARAGPA | | RRARRGTSGR | | GSLKFPMPNY |
QVALFENEPA | | GTLILQLHAH | | YTIEGEEERV | | SYYMEGLFDE | | RSRGYFRIDS |
ATGAVSTDSV | | LDRETKETHV | | LRVKAVDYST | | PPRSATTYIT | | VLVKDTNDHS |
PVFEQSEYRE | | RVRENLEVGY | | EVLTIRASDR | | DSPINANLRY | | RVLGGAWDVF |
QLNESSGVVS | | TRAVLDREEA | | AEYQLLVEAN | | DQGRNPGPLS | | ATATVYIEVE |
DENDNYPQFS | | EQNYVVQVPE | | DVGLNTAVLR | | VQATDRDQGQ | | NAAIHYSILS |
GNVAGQFYLH | | SLSGILDVIN | | PLDFEDVQKY | | SLSIKAQDGG | | RPPLINSSGV |
VSVQVLDVND | | NEPIFVSSPF | | QATVLENVPL | | GYPVVHIQAV | | DADSGENARL |
HYRLVDTAST | | FLGGGSAGPK | | NPAPTPDFPF | | QIHNSSGWIT | | VCAELDREEV |
EHYSFGVEAV | | DHGSPPMSSS | | TSVSITVLDV | | NDNDPVFTQP | | TYELRLNEDA |
AVGSSVLTLQ | | ARDRDANSVI | | TYQLTGGNTR | | NRFALSSQRG | | GGLITLALPL |
DYKQEQQYVL | | AVTASDGTRS | | HTAHVLINVT | | DANTHRPVFQ | | SSHYTVSVSE |
DRPVGTSIAT | | LSANDEDTGE | | NARITYVIQD | | PVPQFRIDPD | | SGTMYTMMEL |
DYENQVAYTL | | TIMAQDNGIP | | QKSDTTTLEI | | LILDANDNAP | | QFLWDFYQGS |
IFEDAPPSTS | | ILQVSATDRD | | SGPNGRLLYT | | FQGGDDGDGD | | FYIEPTSGVI |
RTQRRLDREN | | VAVYNLWALA | | VDRGSPTPLS | | ASVEIQVTIL | | DINDNAPMFE |
KDELELFVEE | | NNPVGSVVAK | | IRANDPDEGP | | NAQIMYQIVE | | GDMRHFFQLD |
LLNGDLRAMV | | ELDFEVRREY | | VLVVQATSAP | | LVSRATVHIL | | LVDQNDNPPV |
LPDFQILFNN | | YVTNKSNSFP | | TGVIGCIPAH | | DPDVSDSLNY | | TFVQGNELRL |
LLLDPATGEL | | QLSRDLDNNR | | PLEALMEVSV | | SDGIHSVTAF | | CTLRVTIITD |
DMLTNSITVR | | LENMSQEKFL | | SPLLALFVEG | | VAAVLSTTKD | | DVFVFNVQND |
TDVSSNILNV | | TFSALLPGGV | | RGQFFPSEDL | | QEQIYLNRTL | | LTTISTQRVL |
PFDDNICLRE | | PCENYMKCVS | | VLRFDSSAPF | | LSSTTVLFRP | | IHPINGLRCR |
CPPGFTGDYC | | ETEIDLCYSD | | PCGANGRCRS | | REGGYTCECF | | EDFTGEHCEV |
DARSGRCANG | | VCKNGGTCVN | | LLIGGFHCVC | | PPGEYERPYC | | EVTTRSFPPQ |
SFVTFRGLRQ | | RFHFTISLTF | | ATQERNGLLL | | YNGRFNEKHD | | FIALEIVDEQ |
VQLTFSAGET | | TTTVAPKVPS | | GVSDGRWHSV | | QVQYYNKPNI | | GHLGLPHGPS |
GEKMAVVTVD | | DCDTTMAVRF | | GKDIGNYSCA | | AQGTQTGSKK | | SLDLTGPLLL |
GGVPNLPEDF | | PVHNRQFVGC | | MRNLSVDGKN | | VDMAGFIANN | | GTREGCAARR |
NFCDGRRCQN | | GGTCVNRWNM | | YLCECPLRFG | | GKNCEQAMPH | | PQLFSGESVV |
SWSDLNIIIS | | VPWYLGLMFR | | TRKEDSVLME | | ATSGGPTSFR | | LQILNNYLQF |
EVSHGPSDVE | | SVMLSGLRVT | | DGEWHHLLIE | | LKNVKEDSEM | | KHLVTMTLDY |
GMDQNKADIG | | GMLPGLTVRS | | VVVGGASEDK | | VSVRRGFRGC | | MQGVRMGGTP |
TNVATLNMNN | | ALKVRVKDGC | | DVDDPCTSSP | | CPPNSRCHDA | | WEDYSCVCDK |
GYLGINCVDA | | CHLNPCENMG | | ACVRSPGSPQ | | GYVCECGPSH | | YGPYCENKLD |
LPCPRGWWGN | | PVCGPCHCAV | | SKGFDPDCNK | | TNGQCQCKEN | | YYKLLAQDTC |
LPCDCFPHGS | | HSRTCDMATG | | QCACKPGVIG | | RQCNRCDNPF | | AEVTTLGCEV |
IYNGCPKAFE | | AGIWWPQTKF | | GQPAAVPCPK | | GSVGNAVRHC | | SGEKGWLPPE |
LFNCTTISFV | | DLRAMNEKLS | | RNETQVDGAR | | ALQLVRALRS | | ATQHTGTLFG |
NDVRTAYQLL | | GHVLQHESWQ | | QGFDLAATQD | | ADFHEDVIHS | | GSALLAPATR |
AAWEQIQRSE | | GGTAQLLRRL | | EGYFSNVARN | | VRRTYLRPFV | | IVTANMILAV |
DIFDKFNFTG | | ARVPRFDTIH | | EEFPRELESS | | VSFPADFFRP | | PEEKEGPLLR |
PAGRRTTPQT | | TRPGPGTERE | | APISRRRRHP | | DDAGQFAVAL | | VIIYRTLGQL |
LPERYDPDRR | | SLRLPHRPII | | NTPMVSTLVY | | SEGAPLPRPL | | ERPVLVEFAL |
LEVEERTKPV | | CVFWNHSLAV | | GGTGGWSARG | | CELLSRNRTH | | VACQCSHTAS |
FAVLMDISRR | | ENGEVLPLKI | | VTYAAVSLSL | | AALLVAFVLL | | SLVRMLRSNL |
HSIHKHLAVA | | LFLSQLVFVI | | GINQTENPFL | | CTVVAILLHY | | IYMSTFAWTL |
VESLHVYRML | | TEVRNIDTGP | | MRFYYVVGWG | | IPAIVTGLAV | | GLDPQGYGNP |
DFCWLSLQDT | | LIWSFAGPIG | | AVIIINTVTS | | VLSAKVSCQR | | KHHYYGKKGI |
VSLLRTAFLL | | LLLISATWLL | | GLLAVNRDAL | | SFHYLFAIFS | | GLQGPFVLLF |
HCVLNQEVRK | | HLKGVLGGRK | | LHLEDSATTR | | ATLLTRSLNC | | NTTFGDGPDM |
LRTDLGESTA | | SLDSIVRDEG | | IQKLGVSSGL | | VRGSHGEPDA | | SLMPRSCKDP |
PGHDSDSDSE | | LSLDEQSSSY | | ASSHSSDSED | | DGVGAEEKWD | | PARGAVHSTP |
KGDAVANHVP | | AGWPDQSLAE | | SDSEDPSGKP | | RLKVETKVSV | | ELHREEQGSH |
RGEYPPDQES | | GGAARLASSQ | | PPEQRKGILK | | NKVTYPPPLT | | LTEQTLKGRL |
REKLADCEQS | | PTSSRTSSLG | | SGGPDCAITV | | KSPGREPGRD | | HLNGVAMNVR |
TGSAQADGSD | | SEKP |
Кодований геном білок за функціями належить до рецепторів, g-білокспряжених рецепторів, білків внутрішньоклітинного сигналінгу, білків розвитку, фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іоном кальцію. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані.
Література
- Wu Q., Maniatis T. (2000). Large exons encoding multiple ectodomains are a characteristic feature of protocadherin genes. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 97: 3124—3129. PMID 10716726 DOI:10.1073/pnas.97.7.3124
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Примітки
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:1850 (англ.) . Архів оригіналу за 17 жовтня 2015. Процитовано 12 вересня 2017.
- ↑ UniProt, Q9NYQ6 (англ.) . Архів оригіналу за 12 жовтня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |
|
---|
Рецептори нейромедіаторів | Адренорецептори | |
---|
Пуринові рецептори | - Аденозинові рецептори
- P2Y
|
---|
Серотонінові рецептори | - (крім 5-HT3) 5-HT1
- 5-HT2
- 5-HT
- 5A
- 6
- 7)
|
---|
Інші | |
---|
|
---|
Метаболіти та сигнальні молекули | Ейкозаноїдні рецептори | |
---|
Інші | |
---|
|
---|
Пептиди | Рецептори нейропептидів | - B/W
- FF
- S
- Y
- Нейромедин
- Нейротенсин
|
---|
Інші | |
---|
|
---|
Різні | |
---|
|
|
|
|
|