CHAF1A |
---|
|
Наявні структури |
---|
PDB | Пошук ортологів: PDBe RCSB | | |
Ідентифікатори |
---|
Символи | CHAF1A, CAF-1, CAF1, CAF1B, CAF1P150, P150, chromatin assembly factor 1 subunit A |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 601246 MGI: 1351331 HomoloGene: 4003 GeneCards: CHAF1A |
---|
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • unfolded protein binding • chromatin binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • chromo shadow domain binding • identical protein binding |
---|
Клітинна компонента | • CAF-1 complex • клітинне ядро • GO:0009327 protein-containing complex |
---|
Біологічний процес | • реплікація ДНК • клітинний цикл • GO:0100026 Репарація ДНК • cellular response to DNA damage stimulus • GO:0034723 DNA replication-dependent chromatin assembly • nucleosome assembly |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
|
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | |
---|
RefSeq (білок) | | |
---|
Локус (UCSC) | Хр. 19: 4.4 – 4.45 Mb | Хр. 17: 56.35 – 56.38 Mb |
---|
PubMed search | [1] | [2] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
CHAF1A (англ. Chromatin assembly factor 1 subunit A) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 19-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 956 амінокислот, а молекулярна маса — 106 926[4].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MLEELECGAP | | GARGAATAMD | | CKDRPAFPVK | | KLIQARLPFK | | RLNLVPKGKA |
DDMSDDQGTS | | VQSKSPDLEA | | SLDTLENNCH | | VGSDIDFRPK | | LVNGKGPLDN |
FLRNRIETSI | | GQSTVIIDLT | | EDSNEQPDSL | | VDHNKLNSEA | | SPSREAINGQ |
REDTGDQQGL | | LKAIQNDKLA | | FPGETLSDIP | | CKTEEEGVGC | | GGAGRRGDSQ |
ECSPRSCPEL | | TSGPRMCPRK | | EQDSWSEAGG | | ILFKGKVPMV | | VLQDILAVRP |
PQIKSLPATP | | QGKNMTPESE | | VLESFPEEDS | | VLSHSSLSSP | | SSTSSPEGPP |
APPKQHSSTS | | PFPTSTPLRR | | ITKKFVKGST | | EKNKLRLQRD | | QERLGKQLKL |
RAEREEKEKL | | KEEAKRAKEE | | AKKKKEEEKE | | LKEKERREKR | | EKDEKEKAEK |
QRLKEERRKE | | RQEALEAKLE | | EKRKKEEEKR | | LREEEKRIKA | | EKAEITRFFQ |
KPKTPQAPKT | | LAGSCGKFAP | | FEIKEHMVLA | | PRRRTAFHPD | | LCSQLDQLLQ |
QQSGEFSFLK | | DLKGRQPLRS | | GPTHVSTRNA | | DIFNSDVVIV | | ERGKGDGVPE |
RRKFGRMKLL | | QFCENHRPAY | | WGTWNKKTAL | | IRARDPWAQD | | TKLLDYEVDS |
DEEWEEEEPG | | ESLSHSEGDD | | DDDMGEDEDE | | DDGFFVPHGY | | LSEDEGVTEE |
CADPENHKVR | | QKLKAKEWDE | | FLAKGKRFRV | | LQPVKIGCVW | | AADRDCAGDD |
LKVLQQFAAC | | FLETLPAQEE | | QTPKASKRER | | RDEQILAQLL | | PLLHGNVNGS |
KVIIREFQEH | | CRRGLLSNHT | | GSPRSPSTTY | | LHTPTPSEDA | | AIPSKSRLKR |
LISENSVYEK | | RPDFRMCWYV | | HPQVLQSFQQ | | EHLPVPCQWS | | YVTSVPSAPK |
EDSGSVPSTG | | PSQGTPISLK | | RKSAGSMCIT | | QFMKKRRHDG | | QIGAEDMDGF |
QADTEEEEEE | | EGDCMIVDVP | | DAAEVQAPCG | | AASGAGGGVG | | VDTGKATLTS |
SPLGAS |
Кодований геном білок за функціями належить до шаперонів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як клітинний цикл, пошкодження ДНК, репарація ДНК, реплікація ДНК, альтернативний сплайсинг. Локалізований у ядрі.
Література
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Kaufman P.D., Kobayashi R., Kessler N., Stillman B. (1995). The p150 and p60 subunits of chromatin assembly factor I: a molecular link between newly synthesized histones and DNA replication. Cell. 81: 1105—1114. PMID 7600578 DOI:10.1016/S0092-8674(05)80015-7
- Shibahara K., Stillman B. (1999). Replication-dependent marking of DNA by PCNA facilitates CAF-1-coupled inheritance of chromatin. Cell. 96: 575—585. PMID 10052459 DOI:10.1016/S0092-8674(00)80661-3
- Quivy J.-P., Grandi P., Almouzni G. (2001). Dimerization of the largest subunit of chromatin assembly factor 1: importance in vitro and during Xenopus early development. EMBO J. 20: 2015—2027. PMID 11296234 DOI:10.1093/emboj/20.8.2015
- Reese B.E., Bachman K.E., Baylin S.B., Rountree M.R. (2003). The methyl-CpG binding protein MBD1 interacts with the p150 subunit of chromatin assembly factor 1. Mol. Cell. Biol. 23: 3226—3236. PMID 12697822 DOI:10.1128/MCB.23.9.3226-3236.2003
- Sarraf S.A., Stancheva I. (2004). Methyl-CpG binding protein MBD1 couples histone H3 methylation at lysine 9 by SETDB1 to DNA replication and chromatin assembly. Mol. Cell. 15: 595—605. PMID 15327775 DOI:10.1016/j.molcel.2004.06.043
Примітки
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:1910 (англ.) . Процитовано 12 вересня 2017.
{{cite web}}
: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання) - ↑ UniProt, Q13111 (англ.) . Архів оригіналу за 23 вересня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |