CHL1 |
---|
|
Ідентифікатори |
---|
Символи | CHL1, CALL, L1CAM2, cell adhesion molecule L1 like |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 607416 MGI: 1098266 HomoloGene: 21314 GeneCards: CHL1 |
---|
|
Пов'язані генетичні захворювання |
---|
ожиріння[1] |
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • protease binding |
---|
Клітинна компонента | • integral component of membrane • мембрана • клітинна мембрана • apical part of cell • extracellular region • дендрит (нейробіологія) • екзосома |
---|
Біологічний процес | • GO:1904089 negative regulation of neuron apoptotic process • диференціація клітин • когнітивність • axon regeneration • adult locomotory behavior • neuron migration • нейробіологія розвитку • multicellular organism development • адгезія клітин • exploration behavior • neuron projection development • GO:0072468 сигнальна трансдукція • axon guidance |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | NM_001253387 NM_001253388 NM_006614 |
| |
---|
RefSeq (білок) | | NP_001240316 NP_001240317 NP_006605 |
| |
---|
Локус (UCSC) | Хр. 3: 0.2 – 0.41 Mb | Хр. 6: 103.49 – 103.73 Mb |
---|
PubMed search | [2] | [3] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
CHL1 (англ. Cell adhesion molecule L1 like) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 3-ї хромосоми. [4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 208 амінокислот, а молекулярна маса — 135 071[5].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MEPLLLGRGL | | IVYLMFLLLK | | FSKAIEIPSS | | VQQVPTIIKQ | | SKVQVAFPFD |
EYFQIECEAK | | GNPEPTFSWT | | KDGNPFYFTD | | HRIIPSNNSG | | TFRIPNEGHI |
SHFQGKYRCF | | ASNKLGIAMS | | EEIEFIVPSV | | PKFPKEKIDP | | LEVEEGDPIV |
LPCNPPKGLP | | PLHIYWMNIE | | LEHIEQDERV | | YMSQKGDLYF | | ANVEEKDSRN |
DYCCFAAFPR | | LRTIVQKMPM | | KLTVNSSNSI | | KQRKPKLLLP | | PTESGSESSI |
TILKGEILLL | | ECFAEGLPTP | | QVDWNKIGGD | | LPKGRETKEN | | YGKTLKIENV |
SYQDKGNYRC | | TASNFLGTAT | | HDFHVIVEEP | | PRWTKKPQSA | | VYSTGSNGIL |
LCEAEGEPQP | | TIKWRVNGSP | | VDNHPFAGDV | | VFPREISFTN | | LQPNHTAVYQ |
CEASNVHGTI | | LANANIDVVD | | VRPLIQTKDG | | ENYATVVGYS | | AFLHCEFFAS |
PEAVVSWQKV | | EEVKPLEGRR | | YHIYENGTLQ | | INRTTEEDAG | | SYSCWVENAI |
GKTAVTANLD | | IRNATKLRVS | | PKNPRIPKLH | | MLELHCESKC | | DSHLKHSLKL |
SWSKDGEAFE | | INGTEDGRII | | IDGANLTISN | | VTLEDQGIYC | | CSAHTALDSA |
ADITQVTVLD | | VPDPPENLHL | | SERQNRSVRL | | TWEAGADHNS | | NISEYIVEFE |
GNKEEPGRWE | | ELTRVQGKKT | | TVILPLAPFV | | RYQFRVIAVN | | EVGRSQPSQP |
SDHHETPPAA | | PDRNPQNIRV | | QASQPKEMII | | KWEPLKSMEQ | | NGPGLEYRVT |
WKPQGAPVEW | | EEETVTNHTL | | RVMTPAVYAP | | YDVKVQAINQ | | LGSGPDPQSV |
TLYSGEDYPD | | TAPVIHGVDV | | INSTLVKVTW | | STVPKDRVHG | | RLKGYQINWW |
KTKSLLDGRT | | HPKEVNILRF | | SGQRNSGMVP | | SLDAFSEFHL | | TVLAYNSKGA |
GPESEPYIFQ | | TPEGVPEQPT | | FLKVIKVDKD | | TATLSWGLPK | | KLNGNLTGYL |
LQYQIINDTY | | EIGELNDINI | | TTPSKPSWHL | | SNLNATTKYK | | FYLRACTSQG |
CGKPITEESS | | TLGEGSKGIG | | KISGVNLTQK | | THPIEVFEPG | | AEHIVRLMTK |
NWGDNDSIFQ | | DVIETRGREY | | AGLYDDISTQ | | GWFIGLMCAI | | ALLTLLLLTV |
CFVKRNRGGK | | YSVKEKEDLH | | PDPEIQSVKD | | ETFGEYSDSD | | EKPLKGSLRS |
LNRDMQPTES | | ADSLVEYGEG | | DHGLFSEDGS | | FIGAYAGSKE | | KGSVESNGSS |
TATFPLRA |
Кодований геном білок за функціями належить до білків розвитку, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як клітинна адгезія, диференціація, нейрогенез, поліморфізм, альтернативний сплайсинг. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані, позаклітинному матриксі. Також секретований назовні.
Література
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Примітки
- ↑ Захворювання, генетично пов'язані з CHL1 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:1939 (англ.) . Архів оригіналу за 28 березня 2016. Процитовано 30 серпня 2017.
- ↑ UniProt, O00533 (англ.) . Архів оригіналу за 27 вересня 2017. Процитовано 30 серпня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |
На цю статтю не посилаються інші статті Вікіпедії. Будь ласка розставте посилання відповідно до прийнятих рекомендацій. |